芋頭過氧化物酶基因克隆
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【摘要】:根據(jù)芋頭的密碼子使用頻率,用i CODEHOP設(shè)計簡并引物擴增芋頭過氧化物酶基因序列,待芋頭過氧化物酶基因非側(cè)翼序列擴增成功后,依據(jù)其序列合成hiTAIL-PCR引物擴增芋頭過氧化物酶基因的兩側(cè)序列。結(jié)果從芋頭基因組DNA中克隆出1 165 bp序列,經(jīng)同源性分析為過氧化物酶基因的部分序列;再利用hiTAIL-PCR技術(shù)可以擴增出芋頭過氧化物酶基因的兩側(cè)序列,擴增序列為689 bp,測序結(jié)果能與1 165 bp序列拼接到一起,長1 854 bp。與已知的過氧化物酶進行序列比對,發(fā)現(xiàn)兩側(cè)還有氨基酸的編碼序列,因此進行第2次hiTAIL-PCR,擴增出165 bp芋頭過氧化物酶基因的側(cè)翼序列,拼接后得到2 019bp。用Softberry上的基因預(yù)測軟件分析后,發(fā)現(xiàn)包含過氧化物酶4個外顯子,同源性分析表明,此過氧化物酶基因為含血紅素的第三類過氧化物酶。
【作者單位】: 廣東海洋大學農(nóng)學院;
【關(guān)鍵詞】: 芋頭 過氧化物酶基因 hiTAIL-PCR 克隆
【基金】:國家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項經(jīng)費子課題分項目(200903017-08)
【分類號】:S632.3;Q943.2
【正文快照】: 芋頭(Colocasia esculenta)主要種植于熱帶地區(qū),在東南亞和太平洋地區(qū)是一種重要的經(jīng)濟作物。2016年國際糧農(nóng)組織報告,2004—2014年期間,我國的芋頭年均生產(chǎn)量居全球第在大多數(shù)情況下獲得的主要產(chǎn)物片段為1~3kb[12]。hi TAIL-PCR技術(shù)非常實用[13-16]。例如,郭翠等[14]通過一次
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,本文編號:635463
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