本文關(guān)鍵詞：秈稻低親和陽離子轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因OsLCT2的克隆與生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 水稻 鎘 低親和陽離子轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白 OsLCT

【摘要】：OsLCT1是目前在水稻中唯一鑒定出來的參與韌皮部鎘離子運(yùn)輸?shù)年P(guān)鍵轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,與水稻籽粒鎘積累密切相關(guān)。本研究根據(jù)Gene Bank已發(fā)表的小麥Ta LCT1基因序列信息設(shè)計(jì)引物,利用RT-PCR方法從秈稻93-11和華占中克隆了低親和陽離子轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因(LCT),并命名為OsLCT2。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,該基因定位在5號(hào)染色體上,全長(zhǎng)2 699 bp,包含3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子,其CDS全長(zhǎng)1 437 bp,編碼478個(gè)氨基酸,包含2個(gè)PEST序列和11個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域。OsLCT2蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示,α-螺旋占57.11%、β-折疊占7.74%,無規(guī)則卷曲占35.15%。序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,OsLCT2與小麥的親緣關(guān)系最近達(dá)65%,其次為高粱64%,而與水稻OsLCT1的同源性并不高,推測(cè)OsLCT2的功能可能與Ta LCT1相類似。
【作者單位】： 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)生物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;湖南雜交水稻研究中心雜交水稻國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 水稻 鎘 低親和陽離子轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白 OsLCT
【基金】：湖南省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(14JJ7084) 湖南省重大科研攻關(guān)項(xiàng)目(湘財(cái)農(nóng)指(2014)180號(hào))共同資助
【分類號(hào)】：S511.21
【正文快照】： *通訊作者,brzhao652@hhrrc.ac.cn;pkq8055@hunau.netCloning and Bioinformatics Analysis of Low-affinity Cation TransporterGene Os LCT2 in Indica Rice(Oryza sativa)Li Yaokui1,2Tang Li2Mao Bigang2Zhao Bingran2*Peng Keqin1*1 College of Bioscience and Biotechno，

本文編號(hào)：629292