本文關鍵詞：基于高通量測序的慈竹筍轉錄組分析與基因功能注釋

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【摘要】：慈竹是我國四川當?shù)氐膬?yōu)勢叢生竹種之一,其纖維長度和質量較優(yōu)異,是造紙、紡織等工業(yè)的良好原料。本文利用Illumina Hi SeqTM 2000平臺,對10、50、100和150 cm高的慈竹筍進行轉錄組分析,共得到69.28 M條讀長(Reads),經(jīng)從頭拼接、組裝和聚類后得到111 137條非重復序列基因Unigene,其中共有63 094條注釋到COG、GO、KEGG、Swiss-Prot和Nr數(shù)據(jù)庫中。這些Unigene不僅具有一般的功能,如轉錄和信號轉導等,還涉及到蔗糖轉運與代謝、次級代謝產(chǎn)物及細胞壁的生物合成等方面。不同高度慈竹筍的纖維素合成酶基因存在差異表達,發(fā)現(xiàn)了可能調控慈竹生長發(fā)育以及纖維素和木質素生物合成的相關基因,為慈竹品種改良提供一定的理論基礎。
【作者單位】： 西南科技大學生命科學與工程學院四川省生物質資源利用與改性工程技術研究中心;
【關鍵詞】： 慈竹 轉錄組 高通量測序 功能注釋
【基金】：國家自然科學基金(Nos.31400257,31400333) 四川省“十三五”育種公關項目 四川省生物質資源利用與改性工程技術研究中心基金(Nos.12zxsk07,13zxsk01,14tdgc05) 四川省教育廳科研項目(No.16ZA0145) 西南科技大學研究生創(chuàng)新基金(No.15ycx089)資助~~
【分類號】：S795.5
【正文快照】： 竹子是重要的非木材可再生資源,以生長速度快、產(chǎn)量高、易加工、用途廣泛、經(jīng)濟價值高等特點著稱。近年來隨著分子生物學研究手段的發(fā)展,尤其是基因組和轉錄組測序技術的廣泛應用,毛竹、麻竹等竹種的基因組和(或)轉錄組數(shù)據(jù)已經(jīng)被公布,一些與竹筍快速生長以及竹材纖維形成的相，

本文編號：620883