本文關鍵詞：莖瘤固氮根瘤菌趨化系統(tǒng)基因的比較基因組學分析及相關蛋白序列分析（英文）

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【摘要】：【目的】莖瘤固氮根瘤菌既可以與毛萼田菁共生固氮,又可以自生或作為內生菌在其他植物體內固氮。由于其具有3種生活狀態(tài)及固氮能力,其感受外界信號的趨化系統(tǒng)應當更為復雜多樣。目前對莖瘤固氮根瘤菌的趨化通路研究很少,因此我們將莖瘤固氮根瘤菌的趨化系統(tǒng)與其他已有研究的菌株相比較�！痉椒ā炕贜CBI蛋白數(shù)據(jù)庫,利用BLAST程序對菌株ORS571及已公布全基因組序列的α變形菌門的其他菌種進行趨化基因簇的比較分析;基于Pfam蛋白數(shù)據(jù)庫,利用HMMER3程序對甲基化受體蛋白序列進行比較分析。【結果】分析結果表明莖瘤固氮根瘤菌中有1條主要的趨化基因簇,其中所編碼的甲基化酶Che R為非五肽依賴型;此外,該菌還具有43個甲基化受體蛋白基因,所編碼的受體蛋白保守區(qū)段均由38個七肽單位組成。【結論】通過比較基因組學的分析可知莖瘤固氮根瘤菌與其他菌屬相比趨化系統(tǒng)具有高度同源性,但同時存在自身的獨特性,這一結論能夠使我們更好的了解莖瘤固氮根瘤菌利用趨化系統(tǒng)適應環(huán)境的過程。
【作者單位】： 中國科學院煙臺海岸帶研究所;中國科學院大學;
【關鍵詞】： 趨化性 甲基化受體蛋白 莖瘤固氮根瘤菌
【基金】：Supported by the National Natural Science Foundation of China(31370108,31570063) by the Key Research Program of the Chinese Academy of Sciences(KZZD-EW-14),by the One Hundred-Talent Plan of Chinese Academy of Sciences(CAS) by the Shandong Independent Innovation and Achievement Transformation Program(2014ZZCX07303) by the Yantai Science and Technology Project(2013JH021)~~
【分類號】：Q939.114
【正文快照】： Azorhizobium caulinodans ORS571 is a microsymbiont isolated from the stem nodules of the tropical legume Sesbania rostrata,and has the capability of fixing nitrogen both under free-living and symbiotic conditions[1].Nitrogen-fixing nodules are formed alo

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8 簡曙光,楊中藝;莖瘤對長喙田菁在鉛鋅尾礦環(huán)境適應中的意義 Ⅱ.莖瘤對長喙田菁固氮和積累重金屬的影響[J];植物生態(tài)學報;2002年02期

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本文編號：611621