本文關鍵詞：結核分枝桿菌higB基因的擴增及生物信息學分析

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【摘要】：目的擴增結核分枝桿菌(H37Rv)的higB基因,運用生物信息學方法預測其編碼蛋白的生物信息學特征。方法采用PCR方法擴增higB基因并對擴增產物測序,通過在線Protparam、protscale、SignaIP 4.1、MotifScan、SWISS_MODEL等程序,分析higB基因編碼蛋白的生物學特征。結果獲得的higB基因全長378bp,與預期大小基本一致,基因序列與GenBank上公布的MTB標準株的核苷酸同源性為100.00%。higB蛋白共125個氨基酸,分子質量單位為14.429 8ku,理論等電點10.18,脂溶性系數(shù)77.36,不穩(wěn)定系數(shù)35.67,預測該蛋白為穩(wěn)定蛋白。higB蛋白無信號肽,其二級結構中β-轉角占12%,無規(guī)則卷曲占34.4%,氨基酸序列中有3個潛在的B細胞抗原表位,4個Th細胞表位,5個磷酸化位點。結論成功擴增了結核分枝桿菌higB基因,通過生物學信息獲得了其編碼蛋白的信息學特征,為研究該蛋白的生物學功能和免疫活性奠定了基礎。
【作者單位】： 濰坊醫(yī)學院醫(yī)學檢驗學系;濰坊醫(yī)學院臨床學院病原生物學教研室;
【關鍵詞】： 結核分枝桿菌 higB 擴增 生物信息學分析
【基金】：國家自然科學基金項目(No.81470001;No.81170080)
【分類號】：R440
【正文快照】： *?**?結核病是由結核分枝桿菌引起的慢性傳染病。近年來,隨著耐藥株的不斷增多,結核病已成為嚴重威脅人類健康的疾病。世界衛(wèi)生組織(WHO)《2015年全球結核病報告》中2014年全球大約有960萬人感染結核病,其中約120萬人為結核病和艾滋病雙重感染,5%的結核病患者為耐多藥結核病(m

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1 陳玲;朱玲玲;史春梅;季晨博;郭錫熔;;miR-146b靶基因預測和生物信息學分析[A];2012年江浙滬兒科學術年會暨浙江省醫(yī)學會兒科學分會學術年會、兒內科疾病診治新進展國家級學習班論文匯編[C];2012年

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本文編號：608653