基于基因簇判別的人類miRNA功能預(yù)測(cè)研究
本文關(guān)鍵詞:基于基因簇判別的人類miRNA功能預(yù)測(cè)研究
更多相關(guān)文章: miRNA miRNA家族 基因簇判別 K-折交叉驗(yàn)證
【摘要】:隨著新一代測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展,面對(duì)海量的序列數(shù)據(jù),如果僅靠生物實(shí)驗(yàn)的方法來挖掘微RNA(microRNA,miRNA)的基因功能似乎不可能,因此,通過判別新miRNA家族歸屬來預(yù)測(cè)其相關(guān)生物學(xué)功能為實(shí)際生物實(shí)驗(yàn)的研究開辟新的思路。該文運(yùn)用基因簇判別方法,基于原始家族信息,對(duì)未確定家族歸屬或新發(fā)現(xiàn)的miRNA進(jìn)行判別,確定其基因家族。研究發(fā)現(xiàn),同一家族的成熟體miRNA成員序列之間存在高度相似性,并且參與相同的調(diào)控通路或作用于相同的靶基因,具有相似的生物學(xué)功能。因此,通過基因簇判別預(yù)測(cè)新miRNA家族歸屬,對(duì)新miRNA的基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)與驗(yàn)證具有十分重要的指導(dǎo)意義。
【作者單位】: 江南大學(xué)理學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: miRNA miRNA家族 基因簇判別 K-折交叉驗(yàn)證
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(批準(zhǔn)號(hào):11271163) 江蘇省研究生科研創(chuàng)新計(jì)劃項(xiàng)目(批準(zhǔn)號(hào):KYZZ16_0309)資助的課題~~
【分類號(hào)】:Q522
【正文快照】: 微RNA(micro RNA,mi RNA)是一類內(nèi)源性長(zhǎng)約19~24個(gè)核苷酸的非編碼單鏈RNA,進(jìn)化中具有高度保守性,在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因的表達(dá),從而在生物過程中發(fā)揮重要的作用。生物信息學(xué)分析也表明,人類全部基因的1/3都受到mi RNA的調(diào)控。研究發(fā)現(xiàn),mi RNA能夠特異性和靶m RNA的不精確互補(bǔ)配
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條
1 唐峰波;楊銘;;MiR-200家族與消化道腫瘤的相關(guān)研究[J];中華臨床醫(yī)師雜志(電子版);2016年01期
2 李艷芳;王鈺;李濟(jì)洪;;幾種交叉驗(yàn)證檢驗(yàn)的可重復(fù)性[J];太原師范學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2013年04期
3 接智慧;吳建磊;陶陶;史春雪;王敏;;miR-17~92基因簇在宮頸癌、子宮內(nèi)膜癌與卵巢癌多種細(xì)胞系中的表達(dá)及意義[J];中國(guó)醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2013年03期
【共引文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前9條
1 丁濤;高潔;;基于基因簇判別的人類miRNA功能預(yù)測(cè)研究[J];中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào);2016年12期
2 邱勝華;劉健;陳運(yùn)平;郭洪娜;;循環(huán)型m icroRNA-92a在先天性巨結(jié)腸中的表達(dá)及上調(diào)CDX2基因的研究[J];中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志;2016年21期
3 沈阿靈;劉麗雅;齊飛;陳宏偉;魏麗慧;林久茂;蔡巧燕;彭軍;;片仔癀上調(diào)miR-200a抑制大腸癌耐藥細(xì)胞轉(zhuǎn)移的作用機(jī)制[J];中華中醫(yī)藥雜志;2016年09期
4 接智慧;吳建磊;王敏;;miR-17~92基因簇過表達(dá)調(diào)控PTEN、BIM蛋白對(duì)卵巢癌SKOV3細(xì)胞紫杉醇耐藥的影響[J];現(xiàn)代婦產(chǎn)科進(jìn)展;2016年07期
5 谷有眾;高衛(wèi)東;盧雨正;劉建立;楊瑞華;;應(yīng)用遺傳算法優(yōu)化支持向量回歸機(jī)的噴氣渦流紡紗線質(zhì)量預(yù)測(cè)[J];紡織學(xué)報(bào);2016年07期
6 孔志偉;全曉廣;周美娟;;HE4、CA125、CA153聯(lián)合CA199檢測(cè)在婦科腫瘤診療中的應(yīng)用[J];齊齊哈爾醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2016年13期
7 谷有眾;劉建立;高衛(wèi)東;;基于遺傳模擬退火神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的紗線強(qiáng)力預(yù)測(cè)[J];上海紡織科技;2016年01期
8 陳麗娟;陳建琴;張浩偉;趙峰;王秀秀;王渠源;;miRNA-92在婦科腫瘤中的研究進(jìn)展[J];中國(guó)婦幼保健;2015年16期
9 張萍;王敏;接智慧;雙婷;閆效宇;周瑩瑩;吳建磊;;miR-210在化療耐藥與化療敏感卵巢漿液性癌組織中的檢測(cè)及意義[J];中國(guó)醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2014年06期
【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 李小平;鄭磊貞;;胰腺癌干細(xì)胞信號(hào)通路研究進(jìn)展[J];實(shí)用腫瘤雜志;2015年02期
2 吳共發(fā);趙海燕;何楠;韓慧霞;;miR-200a在結(jié)直腸癌細(xì)胞系中的表達(dá)及其對(duì)高轉(zhuǎn)移細(xì)胞系Lovo的影響[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2015年03期
3 譚國(guó)斌;邱明寧;陳合格;柳建軍;;miR-200c與腫瘤進(jìn)展關(guān)系的研究進(jìn)展[J];中國(guó)腫瘤生物治療雜志;2015年01期
4 韓敬明;白久旭;張曉玲;崔漢民;李旭;曹寧;;轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β調(diào)控miR-200b-200a-429啟動(dòng)子活性[J];第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2014年06期
5 楊西勝;汪建林;李小磊;李海民;;β-catenin參與腫瘤干細(xì)胞形成和增殖轉(zhuǎn)移的研究進(jìn)展[J];現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué);2014年04期
6 朱名毅;姚金光;劉津;;miR-200c在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的研究進(jìn)展[J];右江民族醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2014年01期
7 胡優(yōu);何宋兵;朱新國(guó);;MicroRNA與Wnt/β-catenin通路在大腸癌發(fā)生發(fā)展中的研究進(jìn)展[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào);2014年02期
8 王小軍;周良芬;張華;;miR-200c在肝細(xì)胞癌組織中的表達(dá)及其臨床意義[J];中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)生;2013年28期
9 蔡曉波;李慶;郭俊明;徐進(jìn);季林丹;;MicroRNA與食管癌的研究進(jìn)展[J];中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào);2013年09期
10 鮑欣;楊艷明;劉念;尹光浩;孟凡旭;程穎;劉林林;;miR-21在結(jié)腸癌與癌旁組織中的表達(dá)及其臨床意義[J];吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2013年02期
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 陳清華;韓云蕾;馬堯;燕永亮;平淑珍;陸偉;;生物固氮基因簇結(jié)構(gòu)與進(jìn)化研究進(jìn)展[J];中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào);2013年04期
2 江舸,李偉,金由辛,王德寶;水稻snoRNA47基因簇的初步鑒定[J];生物化學(xué)與生物物理學(xué)報(bào);2002年05期
3 沈德新;核糖體核糖核酸基因簇在細(xì)菌系統(tǒng)分類中的研究進(jìn)展[J];醫(yī)學(xué)綜述;2004年02期
4 張群;羅艷;張士璀;;MiR-183基因簇對(duì)動(dòng)物感覺器官功能和發(fā)育及腫瘤發(fā)生的調(diào)控[J];中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào);2012年07期
5 張雁峰;張銳;宿兵;;MicroRNA基因簇的多樣性與進(jìn)化[J];中國(guó)科學(xué)(C輯:生命科學(xué));2009年01期
6 閆曉紅;王志鵬;王寧;;雞mir-17-92基因簇的結(jié)構(gòu)、功能及其調(diào)控[J];動(dòng)物學(xué)研究;2012年05期
7 李小慧;王凱;吳建盛;湯麗華;;miR-430基因簇的生物信息學(xué)分析[J];南京郵電大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2014年02期
8 胡志浩,陶美鳳,鮑鍇,周秀芬,周啟,,鄧子新;一個(gè)巨大的抗真菌抗生素基因簇及其與植物生物技術(shù)的潛在關(guān)系[J];高技術(shù)通訊;1996年06期
9 李華;王利娟;何t
本文編號(hào):556218
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/556218.html