本文關(guān)鍵詞：利用宏基因組法篩選新幾丁質(zhì)酶基因

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【摘要】：為了尋找新型幾丁質(zhì)酶編碼基因,提取了汕頭灣海域海底表層沉積物中微生物的宏基因組,采用PCR-DGGE技術(shù)擴(kuò)增和分離獲得了新型幾丁質(zhì)酶基因編碼信息。實(shí)驗(yàn)共得到63條幾丁質(zhì)酶基因片段,其編碼的蛋白序列與NCBI數(shù)據(jù)庫收錄的序列相似率在41%~97%之間,且大多數(shù)在70%以下,只有8條相似率在70%以上,NCBI數(shù)據(jù)庫中與其相似性最高的幾丁質(zhì)酶蛋白序列有18個(gè)種屬,其中與橙色滑柱菌株(Herpetosiphon aurantiacus)ATCC 23779的幾丁質(zhì)酶存在著最高相似性的序列有27條,另外,與未可培養(yǎng)細(xì)菌幾丁質(zhì)酶基因片段相似的有22條,占34.9%,分屬9個(gè)種屬。說明汕頭灣表層沉積物中存在多種幾丁質(zhì)酶編碼基因,其中有很多是尚未研究的,為尋找新型的幾丁質(zhì)酶編碼基因提供了有力的生物資源。
【作者單位】： 徐州生物工程職業(yè)技術(shù)學(xué)院;汕頭大學(xué)生物系;
【關(guān)鍵詞】： 汕頭灣 幾丁質(zhì)酶 DGGE 宏基因組 表層沉積物
【分類號(hào)】：Q78
【正文快照】： 海洋環(huán)境中會(huì)產(chǎn)生大量的幾丁質(zhì)沉積,所以降解幾丁質(zhì)就成了很多海洋細(xì)菌必不可少的特性,幾丁質(zhì)酶基因在海洋細(xì)菌中分布十分廣泛,幾丁質(zhì)編碼基因資源非常豐富,但是99%的微生物都是不可培養(yǎng)的,給獲取幾丁質(zhì)基因帶來了巨大的困難。采用宏基因組法可以繞過微生物的培養(yǎng)環(huán)節(jié)直接研究

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