本文關(guān)鍵詞：一個(gè)木薯候選STK類抗病基因的分離及其生物信息學(xué)分析

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【摘要】：根據(jù)絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶類(STK)結(jié)構(gòu)域Ⅰ和Ⅷ氨基酸保守序列設(shè)計(jì)了1對(duì)簡(jiǎn)并引物,以細(xì)菌性萎蔫病抗/感木薯種質(zhì)E1340和GR911基因組DNA為模板,通過PCR擴(kuò)增,均獲得大小約0.5 kb的擴(kuò)增片段。兩個(gè)片段純化、克隆、測(cè)序后獲得完全一致的505 nt序列,比對(duì)發(fā)現(xiàn),木薯種質(zhì)AM560帶有和該序列高度同源的核苷酸片段。對(duì)包括同源片段上下游各約2.0 kb的大片段序列進(jìn)行基因預(yù)測(cè),獲得1個(gè)有4個(gè)外顯子、ORF全長1866 nt的預(yù)測(cè)基因,命名SSK1。序列分析表明,該基因編碼621 aa,有細(xì)胞壁受體激酶結(jié)合、偶聯(lián)位點(diǎn)和8個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,具有典型的STK類抗病基因的保守結(jié)構(gòu),是一個(gè)候選的抗病基因,可能在木薯抗病反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。
【作者單位】： 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院環(huán)境與植物保護(hù)研究所/農(nóng)業(yè)部熱帶作物有害生物綜合治理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/海南省熱帶農(nóng)業(yè)有害生物監(jiān)測(cè)與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 木薯 候選抗病基因 絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶
【基金】：農(nóng)業(yè)部現(xiàn)代農(nóng)業(yè)人才支撐計(jì)劃項(xiàng)目(No.0316001) 國家木薯現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)項(xiàng)目(No.CARS-12-hnhgx) 海南省自然科學(xué)基金(No.20153046)
【分類號(hào)】：S533
【正文快照】： Abstact One pair of degenerated primers were designed based the domain I and VIII of the Serine/Threonine(STK)kinase-like proteins.Cassava germplasm E1340 and GR911 were resistant andsusceptible to cassava bacterial blight separately,and their genome DNA

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