人巨細胞病毒無癥狀性感染者UL144基因多態(tài)性研究
發(fā)布時間:2017-07-01 14:17
本文關(guān)鍵詞:人巨細胞病毒無癥狀性感染者UL144基因多態(tài)性研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:為探究人巨細胞病毒(HCMV)無癥狀性感染者UL144基因多態(tài)性,本研究采用聚合酶鏈反應擴增HCMVDNA陽性無癥狀性感染者尿沉渣標本UL144基因開放讀碼框(ORF),陽性結(jié)果進行雙向DNA測序,通過生物信息學工具BioEdit、DNAstar、Mega5.0、GeneDoc等軟件進行序列特征分析。結(jié)果顯示,在50例HCMV-DNA陽性無癥狀性感染者尿沉渣標本中,21例標本UL144基因擴增陽性,陽性率為42%,并完成測序。同源性比較顯示核苷酸同源性為80.2%~100%,氨基酸同源性為77.8%~100%。種系進化樹分析顯示21例無癥狀性感染者DNA序列主要分為2個基因型,A型(10例,47.61%)和B型(11例,52.38%),未見其他基因型。Expasy數(shù)據(jù)庫預測分析UL144基因編碼產(chǎn)物重要功能基團,結(jié)果顯示ASN、PKC、TNFR、NCD3G等翻譯后修飾位點高度保守。與UL144A型相比,UL144B型在1-16和30-96氨基酸殘基之間各增加了一個PROKAR_LIPOPROTEIN位點和ZF_CTCHY位點。與Toledo標準病毒株比較,UL144A型的CRD1和CRD2區(qū)域高度保守,UL144B型的CRD1和CRD2功能區(qū)變異較大,但跨膜區(qū)(transmembrane domain)和胞漿區(qū)(cytoplasmic domain)在UL144A型和B型中均高度保守。UL144A型和B型堿基變異未對UL144蛋白的預測等電點和二級結(jié)構(gòu)造成較大改變。總之與HCMV顯性感染者不同,HCMV無癥狀性感染者UL144基因型為A型和B型。
【作者單位】: 溫州醫(yī)科大學微生物學和免疫學教研室;溫州醫(yī)科大學第二臨床醫(yī)學院;溫州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院胃腸外科;溫州醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院檢驗科;
【關(guān)鍵詞】: 人巨細胞病毒(HCMV) 無癥狀性感染 UL 多態(tài)性
【基金】:國家自然科學基金(項目號:81472308) 溫州市科技局項目(項目號:Y20170744) 浙江省大學生新苗計劃(項目號:2014R413058;2015R413069)
【分類號】:R440
【正文快照】: 人巨細胞病毒(Human cytomegalovirus,HC-MV)屬于皰疹病毒科β亞科,基因組全長230-240kb,含有200多個可能的開放閱讀框(ORF)[1]。該病毒在人群中感染非常普遍,大多數(shù)呈無癥狀性感染或潛伏感染[2]。但對于免疫低下或免疫缺陷個體(包括HIV感染、器官移植、骨髓移植患者)可引起不
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本文編號:506256
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