人巨細(xì)胞病毒無(wú)癥狀性感染者UL144基因多態(tài)性研究
發(fā)布時(shí)間:2017-07-01 14:17
本文關(guān)鍵詞:人巨細(xì)胞病毒無(wú)癥狀性感染者UL144基因多態(tài)性研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:為探究人巨細(xì)胞病毒(HCMV)無(wú)癥狀性感染者UL144基因多態(tài)性,本研究采用聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增HCMVDNA陽(yáng)性無(wú)癥狀性感染者尿沉渣標(biāo)本UL144基因開(kāi)放讀碼框(ORF),陽(yáng)性結(jié)果進(jìn)行雙向DNA測(cè)序,通過(guò)生物信息學(xué)工具BioEdit、DNAstar、Mega5.0、GeneDoc等軟件進(jìn)行序列特征分析。結(jié)果顯示,在50例HCMV-DNA陽(yáng)性無(wú)癥狀性感染者尿沉渣標(biāo)本中,21例標(biāo)本UL144基因擴(kuò)增陽(yáng)性,陽(yáng)性率為42%,并完成測(cè)序。同源性比較顯示核苷酸同源性為80.2%~100%,氨基酸同源性為77.8%~100%。種系進(jìn)化樹(shù)分析顯示21例無(wú)癥狀性感染者DNA序列主要分為2個(gè)基因型,A型(10例,47.61%)和B型(11例,52.38%),未見(jiàn)其他基因型。Expasy數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)分析UL144基因編碼產(chǎn)物重要功能基團(tuán),結(jié)果顯示ASN、PKC、TNFR、NCD3G等翻譯后修飾位點(diǎn)高度保守。與UL144A型相比,UL144B型在1-16和30-96氨基酸殘基之間各增加了一個(gè)PROKAR_LIPOPROTEIN位點(diǎn)和ZF_CTCHY位點(diǎn)。與Toledo標(biāo)準(zhǔn)病毒株比較,UL144A型的CRD1和CRD2區(qū)域高度保守,UL144B型的CRD1和CRD2功能區(qū)變異較大,但跨膜區(qū)(transmembrane domain)和胞漿區(qū)(cytoplasmic domain)在UL144A型和B型中均高度保守。UL144A型和B型堿基變異未對(duì)UL144蛋白的預(yù)測(cè)等電點(diǎn)和二級(jí)結(jié)構(gòu)造成較大改變?傊cHCMV顯性感染者不同,HCMV無(wú)癥狀性感染者UL144基因型為A型和B型。
【作者單位】: 溫州醫(yī)科大學(xué)微生物學(xué)和免疫學(xué)教研室;溫州醫(yī)科大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院;溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院胃腸外科;溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院檢驗(yàn)科;
【關(guān)鍵詞】: 人巨細(xì)胞病毒(HCMV) 無(wú)癥狀性感染 UL 多態(tài)性
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(項(xiàng)目號(hào):81472308) 溫州市科技局項(xiàng)目(項(xiàng)目號(hào):Y20170744) 浙江省大學(xué)生新苗計(jì)劃(項(xiàng)目號(hào):2014R413058;2015R413069)
【分類號(hào)】:R440
【正文快照】: 人巨細(xì)胞病毒(Human cytomegalovirus,HC-MV)屬于皰疹病毒科β亞科,基因組全長(zhǎng)230-240kb,含有200多個(gè)可能的開(kāi)放閱讀框(ORF)[1]。該病毒在人群中感染非常普遍,大多數(shù)呈無(wú)癥狀性感染或潛伏感染[2]。但對(duì)于免疫低下或免疫缺陷個(gè)體(包括HIV感染、器官移植、骨髓移植患者)可引起不
本文關(guān)鍵詞:人巨細(xì)胞病毒無(wú)癥狀性感染者UL144基因多態(tài)性研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):506256
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/506256.html
最近更新
教材專著