浙江省寧波市2015年麻疹野毒株核蛋白和血凝素蛋白基因分析
發(fā)布時間:2017-06-30 02:01
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【摘要】:目的了解寧波市2015年麻疹野毒株核蛋白(N)基因及血凝素蛋白(H)基因特征。方法對寧波市2015年分離的麻疹野毒株進行逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)擴增N基因,隨機選取20株擴增H基因,序列測定后與基因庫中麻疹病毒各基因型參考株比對分析。結(jié)果寧波2015年分離麻疹病毒38株,均為H1a基因亞型,核苷酸和氨基酸的同源性分別為98.2%~100%和98%~100%,與H1a亞型參考株china93-7的同源性分別為98.0%~98.9%和97.3%~99.3%;與H1b亞型參考株china94-7的同源性分別為96.6%~96.8%和96%~98%;與中國疫苗株S191的同源性為90.6%~91.7%和87%~89.3%。H基因核苷酸和氨基酸之間的同源性分別為97.9%~99.9%和98.9%~100%;與疫苗株S191的同源性分別為93.7%~94.1%和94.7%~95.4%。H蛋白240位和397位氨基酸分別發(fā)生從Ser到Asn、從Pro到Leu的變化。結(jié)論寧波市2015年流行的麻疹野毒株主要為H1a基因亞型。與S191相比有較大變異,H基因有較大差異,應(yīng)加強對H、N基因的常規(guī)監(jiān)測。
【作者單位】: 寧波市疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】: 麻疹病毒 基因型 序列分析 血凝素蛋白 核蛋白
【基金】:寧波市科技創(chuàng)新團隊項目(編號:2012B82018) 浙江省醫(yī)學(xué)重點學(xué)科(編號:07-013)
【分類號】:R373
【正文快照】: 麻疹病毒為單股負鏈核糖核酸(RNA),基因組全長16 kb,共包含6個結(jié)構(gòu)基因,編碼8個蛋白。6個結(jié)構(gòu)蛋白由結(jié)構(gòu)基因編碼,從3'到5'端依次為核蛋白(N)、磷酸化蛋白(P)、基質(zhì)蛋白(M)、融合蛋白(F)、血凝素蛋白(H)和依賴于RNA的RNA聚合酶蛋白(L)。6個結(jié)構(gòu)基因中,H基因和N基因變異較大,含
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1 劉健毅;傅燕;董紅軍;胡逢蛟;張姝;高紅;焦素黎;陳科杰;;寧波市麻疹野毒株N基因片段研究[J];中國熱帶醫(yī)學(xué);2006年12期
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1 鄭敬彤;長春地區(qū)麻疹野毒株H基因與F基因變異情況及流行病學(xué)研究[D];吉林大學(xué);2012年
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本文編號:500109
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