基于p73和DAPK基因異常甲基化模式的白血病腫瘤標(biāo)志物研究
本文關(guān)鍵詞:基于p73和DAPK基因異常甲基化模式的白血病腫瘤標(biāo)志物研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的腫瘤抑制基因異常甲基化狀態(tài)與白血病發(fā)生關(guān)系密切,發(fā)展白血病甲基化標(biāo)志物成為研究熱點(diǎn)。但白血病類型復(fù)雜,利用單個(gè)基因甲基化模式作為腫瘤標(biāo)志物具有一定局限性。本研究通過探討基于腫瘤抑制基因p73和死亡相關(guān)蛋白激酶(death-associated protein kinase gene,DAPK)異常甲基化模式對白血病診斷分型的價(jià)值和意義,尋找一種聯(lián)合多基因異常甲基化模式作為白血病腫瘤標(biāo)志物的方法。方法應(yīng)用亞硫酸氫鹽測序法(bisulfite sequencing PCR,BSP),分析正常人白細(xì)胞、單核細(xì)胞系白血病細(xì)胞株U937、粒細(xì)胞系HL-60及淋巴細(xì)胞系Jurkat基因組中,p73和DAPK基因啟動(dòng)子區(qū)CpG島甲基化狀態(tài),將測序結(jié)果匯集到Office Excel 2010文件中,并計(jì)算各CpG位點(diǎn)甲基化率,繪制2個(gè)基因在4種細(xì)胞來源基因組中的CpG島甲基化模式圖,從而篩選特異甲基化位點(diǎn)組合。通過甲基化特異性PCR法(methylation specific PCR,MSP),在白血病細(xì)胞株、30例正常對照和104例白血病患者外周血標(biāo)本中,驗(yàn)證基因異常甲基化模式的診斷效能。結(jié)果成功測序約107個(gè)含BSP產(chǎn)物轉(zhuǎn)化質(zhì)粒的菌株,并繪制出p73和DAPK基因CpG島甲基化模式圖。正常細(xì)胞基因組兩者去甲基化程度遠(yuǎn)高于白血病細(xì)胞株。p73基因在正常細(xì)胞與白血病細(xì)胞株中,甲基化狀態(tài)完全相反。DAPK基因在HL-60中與其他白血病細(xì)胞株甲基化狀態(tài)存在明顯差異。p73基因MSP甲基化檢測可以鑒別正常細(xì)胞和白血病細(xì)胞,在臨床白血病標(biāo)本診斷中的靈敏度、特異度和準(zhǔn)確度分別是21.5%、100.0%和43.1%,DAPK基因甲基化檢測可以鑒別HL-60與其他白血病細(xì)胞株,其診斷急性非淋巴細(xì)胞白血病的靈敏度、特異度和準(zhǔn)確性分別是59.1%、100.0%和77.2%。結(jié)論 p73和DAPK基因啟動(dòng)子區(qū)CpG島在不同類型白血病細(xì)胞基因組中存在特異的甲基化位點(diǎn),將其作為白血病初步診斷分型的潛在腫瘤標(biāo)志物具有一定臨床意義,也為今后發(fā)現(xiàn)白血病等腫瘤的甲基化標(biāo)志物提供方法并奠定實(shí)驗(yàn)研究基礎(chǔ)。
【作者單位】: 南陽理工學(xué)院張仲景國醫(yī)學(xué)院;南陽市第一人民醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科;中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司科研部;
【關(guān)鍵詞】: DAPK基因 白血病 腫瘤抑制基因 腫瘤標(biāo)志物 DNA甲基化 表觀遺傳學(xué)
【分類號(hào)】:R733.7
【正文快照】: 中華腫瘤防治雜志,2016,23(11):716-721Chin J Cancer Prev Treat,2016,23(11):716-721白血病位居兒童及35歲成人惡性腫瘤發(fā)病率和死亡率首位[1]。研究發(fā)現(xiàn),抑癌基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化與白血病發(fā)生相關(guān),通過檢測其甲基化狀態(tài)有助于腫瘤早期診斷[2]。抑癌基因p73能誘導(dǎo)細(xì)胞周期阻
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本文關(guān)鍵詞:基于p73和DAPK基因異常甲基化模式的白血病腫瘤標(biāo)志物研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號(hào):463501
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