利用SNP基因芯片技術(shù)進(jìn)行小麥遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀QTL分析
發(fā)布時(shí)間:2017-06-15 04:06
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【摘要】:小麥遺傳圖譜是進(jìn)行小麥染色體分析和表型研究的遺傳基礎(chǔ).構(gòu)建高密度遺傳圖譜,針對(duì)小麥重要農(nóng)藝性狀進(jìn)行初級(jí)定位,確定相關(guān)性狀主效數(shù)量性狀位點(diǎn)(Quantitative Trait Loci,QTL),有助于開(kāi)發(fā)輔助選擇的實(shí)用性標(biāo)記,并為利用次級(jí)群體進(jìn)行精細(xì)定位和基因挖掘奠定基礎(chǔ).本研究以H461×CN16的重組自交系(Recombinant Inbred Line,RIL)為作圖群體,利用90k小麥SNP基因芯片技術(shù),對(duì)包含188個(gè)家系的RIL群體(F7)進(jìn)行多態(tài)性分析,構(gòu)建高密度遺傳圖譜,并利用Map QTL5.0的多QTL模型(MQM),對(duì)旗葉長(zhǎng)、穗粒數(shù)等8個(gè)重要農(nóng)藝性狀進(jìn)行QTL定位分析.構(gòu)建了包括43個(gè)連鎖群的分子遺傳圖譜,成功連鎖到除2D、5D、6D外的18條染色體.該圖譜共含有6 573個(gè)多態(tài)性SNP標(biāo)記,覆蓋的遺傳距離長(zhǎng)2 647.02 c M,標(biāo)記間平均距離僅為0.4 c M.A、B、D三個(gè)染色體組分別含有標(biāo)記2 696、3 094和684個(gè);覆蓋染色長(zhǎng)度分別為1 130.92 c M、1 164.82 c M和330.44 c M;分別建立19、18和5個(gè)連鎖群.對(duì)8種重要田間農(nóng)藝性狀進(jìn)行QTL分析,共檢測(cè)到66個(gè)重要農(nóng)藝性狀QTL,其中包括26個(gè)主效QTL,包含未見(jiàn)報(bào)道的新位點(diǎn)7個(gè).全部QTL分布于2A、4A、6A、2B、4B、5B、2D、4D、7D 9條染色體上,單個(gè)QTL可解釋表型變異率7.4%-19.5%,其中62個(gè)QTL加性效應(yīng)來(lái)自母本H461,其余來(lái)自父本CN16.以上結(jié)果為小麥重要農(nóng)藝性狀QTL精細(xì)定位打下了基礎(chǔ),也為分子標(biāo)記輔助育種提供了參考.
【作者單位】: 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)小麥研究所;
【關(guān)鍵詞】: 普通小麥 K基因芯片 QTL定位 農(nóng)藝性狀 SNP
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31301317) 國(guó)家國(guó)際科技合作專項(xiàng)(2015DFA30600)資助~~
【分類號(hào)】:S512.1
【正文快照】: CLC S330.2+5構(gòu)建小麥遺傳圖譜是進(jìn)行小麥基因組分析和研究表型變異的基礎(chǔ)之一,遺傳圖譜的實(shí)效性隨圖譜標(biāo)記密度的增加而提高,高密度的遺傳圖譜可以用于QTL位點(diǎn)識(shí)別、比較作圖、標(biāo)記輔助育種、精細(xì)作圖及圖位克隆.R?der等(1998)構(gòu)建了第一張小麥SSR遺傳圖譜[1],涵蓋了279個(gè)SSR
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本文編號(hào):451385
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