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泥蚶HDAC1基因cDNA全長(zhǎng)、內(nèi)含子克隆及時(shí)空表達(dá)特征分析

發(fā)布時(shí)間:2017-06-14 21:12

  本文關(guān)鍵詞:泥蚶HDAC1基因cDNA全長(zhǎng)、內(nèi)含子克隆及時(shí)空表達(dá)特征分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:HDAC1作為HDACs家族中重要成員,可使組蛋白去乙;M(jìn)而調(diào)節(jié)基因表達(dá),在細(xì)胞分化和胚胎早期發(fā)育中起重要作用。本文利用SMART RACE技術(shù)克隆得到泥蚶HDAC1(Tg-HDAC1)基因的cDNA全長(zhǎng)序列,并對(duì)其內(nèi)含子進(jìn)行擴(kuò)增及不同組織、不同發(fā)育時(shí)期的定量表達(dá)。結(jié)果發(fā)現(xiàn):TgHDAC1基因的cDNA序列全長(zhǎng)為2 275bp,開放閱讀框(ORF)1 587bp,編碼528個(gè)氨基酸;TgHDAC1蛋白序列與斑馬魚、雞、小鼠等的相似性都在80%以上,表明該蛋白氨基酸序列在物種進(jìn)化過(guò)程中具有保守性;在Tg-HDAC1基因中擴(kuò)增出13個(gè)內(nèi)含子,均存在于開放閱讀框中,且都遵循GT-AG原則;熒光定量PCR(qRT-PCR)分析結(jié)果顯示,Tg-HDAC1基因在成體血液、內(nèi)臟團(tuán)、外套膜、鰓、斧足和閉殼肌6個(gè)組織中均有表達(dá),而在足中的表達(dá)量最高,且與其余5組織中的表達(dá)量有極顯著差異(P0.01),說(shuō)明它對(duì)該組織生長(zhǎng)具有重要作用。不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)差異結(jié)果表明,TgHDAC1基因在擔(dān)輪幼蟲期表達(dá)量最高,顯著高于其他發(fā)育時(shí)期(P0.05)。
【作者單位】: 上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;浙江萬(wàn)里學(xué)院生物與環(huán)境學(xué)院浙江省水產(chǎn)種質(zhì)資源高效利用技術(shù)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】泥蚶 組蛋白去乙;(HDAC) 基因克隆 內(nèi)含子 表達(dá)分析
【基金】:國(guó)家現(xiàn)代貝類產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目(CARS-48) 浙江省自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(LZ12C19001) 浙江省重大科技專項(xiàng)(2012C12907-4) 國(guó)家水產(chǎn)種質(zhì)資源平臺(tái)項(xiàng)目(2015DKA30470)
【分類號(hào)】:S917.4
【正文快照】:

【參考文獻(xiàn)】

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

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【共引文獻(xiàn)】

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1 任付真;姚韓韓;董迎輝;周小龍;林志華;;泥蚶HDAC1基因cDNA全長(zhǎng)、內(nèi)含子克隆及時(shí)空表達(dá)特征分析[J];海洋學(xué)報(bào);2016年08期

2 高曉艷;董迎輝;姚韓韓;林志華;;文蛤HDAC1基因克隆、時(shí)空表達(dá)及生長(zhǎng)相關(guān)SNP位點(diǎn)篩查[J];水生生物學(xué)報(bào);2016年03期

3 高曉艷;董迎輝;施沈佳;姚韓韓;阮文斌;趙家熙;林志華;;文蛤生長(zhǎng)因子受體結(jié)合蛋白2(GRB2)基因克隆、時(shí)空表達(dá)及SNP位點(diǎn)篩查[J];水產(chǎn)學(xué)報(bào);2015年09期

4 陳新頁(yè);郭華;鮑寶龍;;牙鲆仔魚SWS1基因克隆及5個(gè)視蛋白基因的表達(dá)[J];上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào);2015年05期

5 李慧;徐義平;鮑寶龍;;牙鲆胚后發(fā)育階段HDAC1基因的空間表達(dá)[J];上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào);2014年05期

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7 董迎輝;項(xiàng)翔;姚韓韓;包永波;孫長(zhǎng)森;林志華;;泥蚶(Tegillarca granosa)生長(zhǎng)因子受體結(jié)合蛋白2(GRB2)基因的克隆與表達(dá)分析[J];海洋與湖沼;2013年04期

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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7 陳樸賢;;犬齒牙鲆胚胎及仔、稚、幼魚形態(tài)發(fā)育觀察[J];海洋科學(xué);2012年06期

8 張曉瑋;鄭洪新;林庶茹;金珉廷;;補(bǔ)腎中藥血清對(duì)成骨細(xì)胞中Smad1/5信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白活性的影響[J];中國(guó)骨質(zhì)疏松雜志;2012年01期

9 汪青;林志華;包永波;霍禮輝;顧海龍;;泥蚶(Tegillarca granosa)血紅蛋白基因(Tg-HbIIA)克隆、分析及免疫表達(dá)研究[J];海洋與湖沼;2012年01期

10 劉芳;格日力;;藏羚羊組蛋白去乙;1基因編碼區(qū)的克隆與序列分析[J];獸類學(xué)報(bào);2011年04期

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

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【相似文獻(xiàn)】

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3 張炯明;肖國(guó)強(qiáng);牟哲松;李尚魯;林志華;;不同密度泥蚶圍塘養(yǎng)殖的研究[A];中國(guó)動(dòng)物學(xué)會(huì)、中國(guó)海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)會(huì)分會(huì)第十四次學(xué)會(huì)研討會(huì)論文摘要匯編[C];2009年

4 汪青;包永波;顧海龍;林志華;;泥蚶金屬蛋白酶組織抑制因子基因克隆與表達(dá)分析[A];中國(guó)動(dòng)物學(xué)會(huì)·中國(guó)海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)分會(huì)第九次會(huì)員代表大會(huì)暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)議摘要集[C];2011年

5 李松偉;李太武;蘇秀榕;李曄;;泥蚶(Tegillarca granosa)HSP70基因的克隆及抗體的制備[A];華東六省一市生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì)2010年學(xué)術(shù)交流會(huì)論文集[C];2010年

6 孫長(zhǎng)森;林志華;董迎輝;肖國(guó)強(qiáng);柴雪良;劉保忠;;泥蚶主要經(jīng)濟(jì)性狀遺傳參數(shù)的估算[A];中國(guó)動(dòng)物學(xué)會(huì)、中國(guó)海洋湖沼學(xué)會(huì)貝類學(xué)會(huì)分會(huì)第十四次學(xué)會(huì)研討會(huì)論文摘要匯編[C];2009年

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3 陳貴善;養(yǎng)殖泥蚶把三關(guān)[N];中國(guó)特產(chǎn)報(bào);2006年

4 張建江 范翠紅;泥蚶苗價(jià)高養(yǎng)殖戶爭(zhēng)購(gòu)[N];中國(guó)畜牧水產(chǎn)報(bào);2000年

5 王一雄 林榕慶 沈琛;云霄泥蚶賣得酣[N];閩南日?qǐng)?bào);2007年

6 倪世俊;養(yǎng)殖泥蚶五要點(diǎn)[N];中國(guó)海洋報(bào);2004年

7 呂紀(jì)增;養(yǎng)殖泥蚶五要點(diǎn)[N];中國(guó)漁業(yè)報(bào);2006年

8 吳奕;樂清市水產(chǎn)品三足鼎立[N];中國(guó)特產(chǎn)報(bào);2004年

9 陳昌喜 摘;幾種立體循環(huán)養(yǎng)殖模式[N];福建科技報(bào);2006年

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本文編號(hào):450567

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