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西瓜高密度遺傳圖譜構(gòu)建及三個(gè)果實(shí)性狀相關(guān)候選基因的精細(xì)定位

發(fā)布時(shí)間:2025-04-11 02:56
  西瓜(Citrullus lanatus)是一種在世界范圍內(nèi)廣泛種植的園藝作物,中國(guó)是西瓜最大的生產(chǎn)國(guó)和消費(fèi)國(guó),其果實(shí)相關(guān)性狀是育種工作的重點(diǎn),F(xiàn)有的西瓜遺傳圖譜標(biāo)記飽和度較低,且作圖群體多為臨時(shí)性分離群體,限制了西瓜重要農(nóng)藝性狀的基因/QTL定位研究。本研究通過對(duì)重組自交系(Recombinant inbreed line,RIL)群體進(jìn)行全基因組重測(cè)序,利用重組bin構(gòu)建了一張西瓜高密度遺傳圖譜。對(duì)西瓜果皮顏色、種皮顏色和果實(shí)苦味3個(gè)性狀進(jìn)行了初定位分析,并通過后續(xù)精細(xì)定位等過程進(jìn)行候選基因的確定。獲得的主要結(jié)果如下:1.以西瓜自交系‘9904’和‘Handel’為親本經(jīng)過七代連續(xù)自交,創(chuàng)制了含126個(gè)單株的重組自交系群體。通過對(duì)RIL群體和親本進(jìn)行全基因組重測(cè)序構(gòu)建了一張西瓜高密度遺傳圖譜。圖譜包含11個(gè)連鎖群,總長(zhǎng)度1508.94 cM,由2 132個(gè)重組bin標(biāo)記組成,平均圖距0.74 cM。對(duì)西瓜果皮顏色、種皮顏色、果實(shí)苦味等質(zhì)量性狀基因進(jìn)行了初定位。果皮顏色、種皮顏色、果實(shí)苦味各定位到一個(gè)顯著性位點(diǎn),分別位于8、3和1號(hào)染色體上。2.對(duì)控制果皮顏色(墨綠色vs淺綠色)的候選...

【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1.1技術(shù)路線

圖1.1技術(shù)路線

院碩士學(xué)位論文第.,2016;Shangetal.,2016;Liuetal.,2016)。但這些圖譜大都基于簡(jiǎn)化基因度相對(duì)不足,作圖群體多為臨時(shí)性分離群體,不能進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn),影響后性。究中,我們不僅對(duì)親本進(jìn)行了高覆蓋深度的測(cè)序,同時(shí)對(duì)重組自交系進(jìn)行通過對(duì)重組自交....


圖2.1西瓜遺傳圖譜作圖親本和重組自交系表型Fig.2.1PhenotypeoftheparentallinesandRILs注:A為親本果皮顏色表型,B為親本種皮顏色表型,C為重組自交系種皮顏色表型Note:Arepresentsthephenotypeoftherindcolorinparentallines,Brepresentsthephenotypeoftheseedcoatcolorinparentallines.CrepresentsthephenotypeoftheseedcoatcolorinRILspopulation.

圖2.1西瓜遺傳圖譜作圖親本和重組自交系表型Fig.2.1PhenotypeoftheparentallinesandRILs注:A為親本果皮顏色表型,B為親本種皮顏色表型,C為重組自交系種皮顏色表型Note:Arepresentsthephenotypeoftherindcolorinparentallines,Brepresentsthephenotypeoftheseedcoatcolorinparentallines.CrepresentsthephenotypeoftheseedcoatcolorinRILspopulation.

碩士學(xué)位論文第二章西瓜高密度第二章西瓜高密度遺傳圖譜的構(gòu)建方法本及群體9904’和‘Handel’)為來自中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所多倍體料。‘9904’來源于栽培種(C.lanatussubsp.vulgaris)JW和黏籽西瓜(spermus)雜交,并經(jīng)過多代....


圖2.2西瓜高密度遺傳圖譜

圖2.2西瓜高密度遺傳圖譜


圖2.3遺傳圖譜與參考基因組的共線性圖

圖2.3遺傳圖譜與參考基因組的共線性圖

為了評(píng)估構(gòu)建的遺傳圖譜的質(zhì)量,將所有重組bin定位到參考基因組‘97103’上進(jìn)行共線性分析。圖2.3遺傳圖譜與參考基因組的共線性圖Fig.2.3Relationshipbetweengeneticandphysicalpositionswitheach....



本文編號(hào):4039395

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