廣東省2018年手足口病病原譜及柯薩奇病毒A10型基因特征分析
發(fā)布時間:2025-04-14 23:49
廣東省手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)監(jiān)測數(shù)據(jù)顯示,2018年5~7月非腸道病毒A組71型(Enterovirus A71,EV-A71)、非柯薩奇病毒A16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)和非柯薩奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)的其他腸道病毒(以下簡稱"其他EV")陽性率大幅度增高,經鑒定60%為柯薩奇病毒A10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)。因此,為了解廣東省2018年HFMD病原譜及CV-A10的基因特征,本研究收集2018年哨點監(jiān)測數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析,采集HFMD其他EV標本進行分型鑒定,并隨機選取2008~2018年CV-A10陽性標本開展VP1全長序列測序與分析。結果顯示,廣東省2018年HFMD病原譜包括24種腸道病毒,陽性率位于前三位的分別是CV-A16(30.73%)、CV-A6(24.29%)和CV-A10(≈11.0%)。CV-A10主要流行于5~7月份,且在各市廣泛流行,所致HFMD重癥率低于EV-A71,卻高于CV-A16和CV-A6。遺傳...
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本文編號:4039736
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圖5 廣東省2008~2018年柯薩奇病毒A10型(CV-A10)與國內外代表株VP1系統(tǒng)進化樹
哨點監(jiān)測數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),2018年廣東省HFMD優(yōu)勢病原為CV‐A16和CV‐A6,二者陽性率總和約占55%。其他EV的陽性率處于第3位(17.6%),但在5~7月份,其他EV與CV‐A16一起成為了引起HFMD的共同優(yōu)勢病原。通過對其他EV鑒定結果分析發(fā)現(xiàn),共檢出了包括腸道病毒A....
圖6 2008~2018年廣東省柯薩奇病毒A10型(CV-A10)病毒基因型分布
本研究從GenBank下載現(xiàn)有的CV‐A10序列,并篩選出50條國內外代表序列,與211條廣東2008~2018年CV‐A10VP1全長序列開展遺傳進化分析,把CV‐A10分為A、B、C、D、E、F和G等7個基因型。分子流行病學分析發(fā)現(xiàn),目前A、B、D、E、F和G等基因型的流....
圖2 2018年廣東省手足口。℉FMD)病例其他EV分型
本研究選取廣東省2008~2018年HFMDCV‐A10陽性標本,進行VP1區(qū)全長序列擴增與測序,共獲得CV‐A10VP1區(qū)全長序列183條,與2015、2017~2018年在皰疹性咽峽炎監(jiān)測獲得的26條序列和下載自GenBank的2條深圳市代表序列一起納入分析,一共211....
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