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基于聯(lián)合測(cè)序的燕麥光周期不敏感基因挖掘

發(fā)布時(shí)間:2025-01-01 09:26
  光是重要的環(huán)境因子,參與植物不同的生理過(guò)程,調(diào)控植物的生長(zhǎng)和發(fā)育。植物對(duì)晝夜長(zhǎng)短的生理反應(yīng)稱為光周期現(xiàn)象。根據(jù)日照長(zhǎng)度和開(kāi)花時(shí)間的關(guān)系,植物可以分為長(zhǎng)日照、短日照和日中性植物。燕麥?zhǔn)且环N分布于世界范圍內(nèi)的糧飼兼用作物,作為長(zhǎng)日照植物,抽穗結(jié)實(shí)需要日照時(shí)長(zhǎng)超過(guò)其臨界日長(zhǎng)。對(duì)日照長(zhǎng)度的需求限制了燕麥的熟期及適種范圍,影響了燕麥的產(chǎn)量。本研究選用對(duì)光周期不敏感品種gp012和對(duì)光周期敏感的品種紅旗2號(hào)作為試驗(yàn)材料,對(duì)兩個(gè)品種在短日照條件下的莖尖形態(tài)進(jìn)行了觀察,并以葉片和莖尖構(gòu)建了 Illumina和Pacbio轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),分析并挖掘了燕麥光周期不敏感的候選基因。主要結(jié)果如下:1、12h日照生長(zhǎng)條件下,光周期不敏感品種gp012的莖尖形態(tài)沒(méi)有明顯變化,光周期敏感品種紅旗2號(hào)的莖尖組織在生長(zhǎng)過(guò)程中逐漸干癟萎縮,導(dǎo)致紅旗2號(hào)不能抽穗結(jié)實(shí)。2、Illumina 測(cè)序共得到 63.63 Gb Clean Data,Q30 達(dá)到 90.32%,Pacbio 測(cè)序測(cè)得數(shù)據(jù)11.62 Gb,通過(guò)Illumina測(cè)序數(shù)據(jù)校正Pacbio測(cè)序數(shù)據(jù)并篩選出差異轉(zhuǎn)錄本。最后得到去冗余的60,673條轉(zhuǎn)錄本序列。3、...

【文章頁(yè)數(shù)】:52 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1擬南芥節(jié)律鐘的簡(jiǎn)化模型[31]??.?.?.?[31]??Figure?1?A?simplified?model?of?Arabidopsis?circadian?clock??

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內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文子,而?T0C1?又稱為?PRR1,是?pseudo-response?regulator?(PRR)家族CA1/LHY和T0C1在一天之中相互抑制,CCA1/LHY的表達(dá)水平在黎而T0C1的表達(dá)峰值則出現(xiàn)在黃昏。CCA1/LHY的表達(dá)水平在黎明后T0C....


圖3技術(shù)路線圖??Figure?3?Technology?roadmap??

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基于聯(lián)合測(cè)序的燕麥光周期不敏感基因挖掘術(shù)路線??


圖4生物信息學(xué)分析流程

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內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文?1J_??4)三代文庫(kù)構(gòu)建使用SMARTer??PCR?cDNA?Synthesis?Kit合成mRNA的全長(zhǎng)??NA。使用BluePippin篩選全長(zhǎng)cDNA片段,構(gòu)建不同大小的cDNA文庫(kù)。隨后??次PCR擴(kuò)增放大篩選的全長(zhǎng)cDNA,并對(duì)全長(zhǎng)cDN....


圖5?gP012?(A)和紅旗2號(hào)(B)莖尖在12h條件下形態(tài)觀察??Figure?5?Morphological?changes?of?MSA?of?gp012?(A)?and?H0NGQI2?(B)?under?12h?were?observed??

圖5?gP012?(A)和紅旗2號(hào)(B)莖尖在12h條件下形態(tài)觀察??Figure?5?Morphological?changes?of?MSA?of?gp012?(A)?and?H0NGQI2?(B)?under?12h?were?observed??

內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文分析??莖尖形態(tài)觀察??探究光照時(shí)長(zhǎng)對(duì)燕麥生長(zhǎng)發(fā)育的影響,我們通過(guò)掃描電錄其在12h日照條件下的形態(tài)變化。光周期不敏感品種沒(méi)有明顯變化,能夠正常生長(zhǎng)發(fā)育。光周期敏感品種紅,從二棱期呈現(xiàn)出干癟萎縮的狀態(tài)。這種變化可能在莖最終在二棱期的時(shí)候出現(xiàn)了表型上的差異....



本文編號(hào):4022384

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