毛竹(Phyllostachys edulis)為禾本科竹亞科剛竹屬竹種,是我國分布最廣,種植面積最大,最重要的經(jīng)濟(jì)竹種,而筍產(chǎn)量是關(guān)乎毛竹產(chǎn)業(yè)效益的重要因素,生產(chǎn)中大部分筍芽始終處于休眠狀態(tài)不萌發(fā),極大的限制了其產(chǎn)量。據(jù)報(bào)道,IDD轉(zhuǎn)錄因子在筍芽頂端高表達(dá),可調(diào)控側(cè)生器官,因此本文從生物信息學(xué)及表達(dá)模式角度對Phe IDD基因家族進(jìn)行分析,取得以下結(jié)果:1.從毛竹中鑒定出32個(gè)Phe IDD家族成員,均具有完整IDD-domain。28個(gè)Phe IDD基因擁有3或4個(gè)外顯子,4個(gè)Phe IDD基因擁有2或6個(gè)外顯子,基因?qū)﹂g具相似的基因結(jié)構(gòu)。32條Phe IDD共被定位到16條Scaffold上。2.Phe IDDs均具有明顯組織特異性,17個(gè)成員在根中高表達(dá),3個(gè)在莖中高表達(dá),10個(gè)在葉子中高表達(dá),2個(gè)(Phe IDD2和Phe IDD21)在分蘗芽中高表達(dá)。3.81%(26/32)的Phe IDD基因的表達(dá)模式與地上分枝發(fā)育過程呈正相關(guān)。20個(gè)Phe IDD基因的表達(dá)模式與地下筍芽發(fā)育呈正相關(guān)。56.2%(18/32)的Phe IDD基因的表達(dá)模式同時(shí)與地上分枝發(fā)育及地下筍芽發(fā)育呈...

【文章頁數(shù)】：77 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
前言
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 植物分蘗分枝發(fā)育研究進(jìn)展
        1.1.1 分蘗分枝的發(fā)生
        1.1.2 植物激素對分蘗分枝的調(diào)控作用
        1.1.3 蔗糖處理對分蘗分枝的影響
        1.1.4 調(diào)控分蘗分枝的相關(guān)基因
    1.2 IDD基因家族研究現(xiàn)狀
        1.2.1 IDD基因家族調(diào)控植物發(fā)育的研究進(jìn)展
        1.2.2 毛竹中IDD基因家族研究進(jìn)展
    1.3 本研究的目的與意義
2 毛竹IDD基因家族鑒定與生物信息學(xué)分析
    2.1 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1.1 毛竹數(shù)據(jù)庫的建立
        2.1.2 毛竹Phe IDD基因核酸與蛋白序列的獲取
        2.1.3 毛竹IDD基因家族基因結(jié)構(gòu)及Scaffold分布
        2.1.4 毛竹IDD基因家族蛋白理化性質(zhì)分析
        2.1.5 毛竹IDD基因家族磷酸化位點(diǎn)預(yù)測分析
        2.1.6 毛竹IDD基因家族系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
        2.1.7 毛竹IDD基因家族Ka/Ks值計(jì)算與復(fù)制事件計(jì)算
        2.1.8 毛竹IDD基因家族進(jìn)化過程中選擇壓力復(fù)制事件
        2.1.9 毛竹IDD基因家族與水稻進(jìn)化過程中選擇壓力復(fù)制事件
        2.1.10 毛竹IDD基因家族啟動子順式作用元件分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 毛竹Phe IDD基因家族的鑒定
        2.2.2 毛竹IDD基因家族多重序列比對
        2.2.3 毛竹IDD基因家族基因結(jié)構(gòu)及Scaffold分布分析
        2.2.4 毛竹IDD基因家族蛋白理化性質(zhì)分析
        2.2.5 毛竹IDD基因家族磷酸化位點(diǎn)預(yù)測分析
        2.2.6 毛竹IDD基家因族系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
        2.2.7 毛竹IDD基家因族進(jìn)化過程中選擇壓力復(fù)制事件分析
        2.2.8 毛竹IDD基家因族與水稻進(jìn)化過程中選擇壓力復(fù)制事件分析
        2.2.9 毛竹IDD基家因族啟動子順式作用元件分析
    2.3 小結(jié)與討論
        2.3.1 毛竹IDD基因家族多重序列比對
        2.3.2 毛竹IDD基因家族基因結(jié)構(gòu)及Scaffold分布
        2.3.3 毛竹IDD基因家族磷酸化位點(diǎn)預(yù)測分析
        2.3.4 毛竹IDD基家因族系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
3 毛竹IDD基因家族表達(dá)模式分析
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1 毛竹實(shí)生苗種植
        3.1.2 毛竹不同組織部位樣品采集
        3.1.3 毛竹實(shí)生苗蔗糖處理樣品采集
        3.1.4 毛竹實(shí)生苗激素處理樣品采集
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 RNA的提取
        3.2.2 RNA反轉(zhuǎn)錄
        3.2.3 熒光定量PCR引物設(shè)計(jì)
        3.2.4 熒光定量PCR
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 毛竹實(shí)生苗分蘗時(shí)間確定
        3.3.2 毛竹Phe IDD基因家族實(shí)生苗組織特性表達(dá)分析
        3.3.3 毛竹筍分枝芽生長發(fā)育過程中Phe IDD基因家族表達(dá)模式
        3.3.4 筍芽發(fā)育過程中毛竹Phe IDD基因家族表達(dá)模式
        3.3.5 蔗糖處理下毛竹Phe IDD基因家族表達(dá)模式
        3.3.6 不同激素處理下毛竹Phe IDD基因家族表達(dá)模式
    3.4 小結(jié)與討論
        3.4.1 毛竹Phe IDD基因家族實(shí)生苗組織特性表達(dá)分析
        3.4.2 毛竹分枝芽及地下筍芽生長過程中Phe IDD基因家族表達(dá)模式
        3.4.3 蔗糖處理下毛竹Phe IDD基因家族表達(dá)模式
        3.4.4 不同激素處理下毛竹Phe IDD基因家族表達(dá)模式
4 毛竹IDD下游靶基因及互作蛋白預(yù)測
    4.1 實(shí)驗(yàn)方法
        4.1.1 下游靶基因篩選
        4.1.2 毛竹IDD互作蛋白預(yù)測
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 下游靶基因篩選
        4.2.2 毛竹IDD互作蛋白預(yù)測
    4.3 小結(jié)與討論
5 結(jié)論與展望
    5.1 研究結(jié)論
    5.2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
個(gè)人簡介
致謝



本文編號：4019484