棘頭梅童魚(Collichthys lucidus)作為我國重要的小型、底棲經(jīng)濟魚類,廣泛分布于我國河口地區(qū)及沿海海域。棘頭梅童魚的肉質(zhì)細膩,味道鮮美,終年可以捕獲,深受沿海居民的喜愛。然而,棘頭梅童魚有限的種群規(guī)模和繁衍速率難以滿足市場需求,現(xiàn)已出現(xiàn)過度捕撈和種群衰退的危險。課題組已對我國沿海地區(qū)棘頭梅童魚群體遺傳結(jié)構(gòu)進行了系統(tǒng)研究,并正在開展棘頭梅童魚規(guī)�；庇夹g(shù)攻關(guān)與研究工作。目前,棘頭梅童魚缺少轉(zhuǎn)錄組學(xué)及基因組學(xué)信息,對棘頭梅童魚細胞學(xué)與生殖學(xué)方面的研究尚未見報道。對棘頭梅童魚生殖細胞發(fā)育及相關(guān)調(diào)控機制的研究,不論對棘頭梅童魚遺傳基礎(chǔ)的深入系統(tǒng)研究,還是產(chǎn)業(yè)化開發(fā)都有很深遠的意義。本研究基于Illumina HiSeq^TMM 500測序平臺,對棘頭梅童魚成熟精巢和卵巢進行轉(zhuǎn)錄組測序,經(jīng)de nove組裝,得到與棘頭梅童魚生殖發(fā)育相關(guān)的基因及信號通路;通過克隆得到生殖細胞特異基因dnd、dmrt1、foxl2和vasa cDNA全長序列,并對它們的表達模式和功能進行分析研究;最后通過數(shù)據(jù)庫預(yù)測參與棘頭梅童魚生殖發(fā)育調(diào)控的microRNA。本研究結(jié)果不僅可以...

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1棘頭梅童魚外部形態(tài)

梅童魚簡介童魚（Collichthyslucidus），俗稱梅童，小金鱗，隸屬硬hyes），鱸形目（Perciformes），石首魚科（Sciaenidae），梅童魚屬型底棲經(jīng)濟魚類[73,74]，短期洄游、喜棲息于低鹽度溫水水域[75分布于我國黃渤海、東海和南海水域，適溫、....

圖1-2技術(shù)路線

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文LRE驗證vasa和dnd的3’非編碼區(qū)對于PGCs具有保守的標(biāo)記作用，是重要的生殖細胞標(biāo)記基因。通過靶向調(diào)控基因數(shù)據(jù)庫反向預(yù)測和microRNA保守性分析，初步篩選到6個性腺特異的microRNA，為探究性腺特異基因轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)....

圖2-1NR注釋物種分布圖

圖2-1NR注釋物種分布圖Fig.2-1NRspeciesdistributionGO分類注釋用于描述序列的功能，分為生物過程（Biologicalprocess）、細（Cellularcomponent）和分子功能（Molecularfunction）三個部....

圖2-2GO分類注釋結(jié)果圖

圖2-2GO分類注釋結(jié)果圖Fig.2-2GOanalysis隨后，通過eggNOG蛋白質(zhì)組分析，用于unigene的功能分類。48,042個(36.63%nigene被分成24類（圖2-3）。最豐富的類別有：信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機制（9710，20.2%）般功能預(yù)測（96....

本文編號：3973478