玉米XYLPs基因家族表達(dá)模式及其蛋白結(jié)構(gòu)分析
發(fā)布時(shí)間:2024-04-23 04:10
通過生物信息學(xué)的方法對(duì)玉米木質(zhì)形成素類阿拉伯半乳糖蛋白(xylogen-like arabinogalactan proteins,XYLPs)基因家族的表達(dá)模式和蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析。ZmXYLPs基因家族成員在染色體上的分布具有一定的偏好性;驈(fù)制事件不僅在基因家族成員數(shù)量的擴(kuò)張和進(jìn)化中發(fā)揮重要作用,同時(shí)還可能引起基因表達(dá)部位的擴(kuò)張。根據(jù)ZmXYLPs蛋白結(jié)構(gòu)特點(diǎn),可將其分為兩大類。其中僅ZmXYLP10/13/14蛋白存在N連接的糖修飾位點(diǎn),其余ZmXYLPs蛋白均為O連接糖修飾位點(diǎn)。結(jié)果顯示,玉米ZmXYLPs的生物學(xué)功能可能與其糖基側(cè)鏈有關(guān),并且其作用并不局限于維管組織發(fā)生過程,可能也參與生殖發(fā)育過程。
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本文編號(hào):3962596
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圖1ZmXYLPs基因的染色體定位和基因復(fù)制關(guān)系
進(jìn)一步對(duì)ZmXYLPs在37個(gè)玉米不同發(fā)育時(shí)期和不同組織中的表達(dá)模式進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,ZmXYLPs基因在玉米不同發(fā)育時(shí)期的組織和器官中的表達(dá)存在明顯差異(圖2、圖3)。ZmXYLP1/3/5在所有組織中的表達(dá)量均很低(圖2、圖3)。而ZmXYLP7和ZmXYLP8則特異性的....
圖2ZmXYLPs在營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)時(shí)期的表達(dá)模式
圖1ZmXYLPs基因的染色體定位和基因復(fù)制關(guān)系圖3ZmXYLPs在生殖生長(zhǎng)時(shí)期的表達(dá)模式
圖3ZmXYLPs在生殖生長(zhǎng)時(shí)期的表達(dá)模式
圖2ZmXYLPs在營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)時(shí)期的表達(dá)模式2.3ZmXYLPs蛋白結(jié)構(gòu)分析
圖4ZmXYLPs蛋白結(jié)構(gòu)示意圖
表1玉米XYLPs蛋白結(jié)構(gòu)分析Table1ProteinstructureanalysisofmaizeXYLPs基因GeneN端信號(hào)肽N-terminalsignalpeptideN端信號(hào)肽切割位點(diǎn)N-terminalsignalpeptidecle....
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