發(fā)布時間：2024-04-21 08:59

　　鹽脅迫是影響植物生長和發(fā)育的主要環(huán)境因素之一,深入理解鹽脅迫的作用機(jī)制有助于研究植物的抗鹽性。植物在應(yīng)對鹽脅迫的過程中會有許多物質(zhì)參與調(diào)控,其中MicroRNA(miRNA)在鹽脅迫的調(diào)控過程中發(fā)揮著重要的作用。如能深入的理解miRNA的調(diào)控機(jī)制,構(gòu)建植物耐高鹽相關(guān)基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),將會為改善植物的耐高鹽能力提供重要的理論基礎(chǔ)。而巨紫荊作為廣泛的綠化點(diǎn)綴樹種,其本身就具有微弱的抗鹽性,如果能提高巨紫荊的耐高鹽能力,將會使其成為鹽堿地區(qū)優(yōu)秀的綠化植物,遺憾的是到目前為止沒有任何關(guān)于巨紫荊的抗鹽性研究。本文中我們利用基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序和miRNA測序技術(shù)對鹽脅迫條件下的巨紫荊進(jìn)行研究,鑒定巨紫荊表達(dá)的miRNA及其靶基因,構(gòu)建巨紫荊耐高鹽相關(guān)基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為了研究巨紫荊在高鹽條件下miRNA的表達(dá)水平,我們對巨紫荊使用200mM的氯化鈉溶液處理48小時,隨后提取巨紫荊根和葉組織的總RNA進(jìn)行miRNA測序。通過對測序數(shù)據(jù)的處理,鑒定出巨紫荊已知70個miRNA家族的407個miRNAs。其中在鹽脅迫條件下巨紫荊顯著差異表達(dá)的miRNA有80個,例如miR160和miR171家族。接下來...

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3.1：miRNA測序中原始reads和干凈reads的長度分布圖

圖3.1：miRNA測序中原始reads和干凈reads的長度分布圖。為了鑒定巨紫荊已知的miRNA，我們首先將巨紫荊miRNA的備選序列與ase數(shù)據(jù)庫中所有植物的miRNA進(jìn)行序列比對。而后統(tǒng)計所有匹配到植物A的備選序列長度，圖3.2是備選miR....

圖3.2：miRNA的備選序列與miRBase數(shù)據(jù)庫中所有植物miRNA進(jìn)行比對，鑒定

：miRNA的備選序列與miRBase數(shù)據(jù)庫中所有植物miRNA進(jìn)行比對荊已知miRNA的長度分布。圖3.3：巨紫荊不同miRNA家族表達(dá)量的分布。

圖3.3：巨紫荊不同miRNA家族表達(dá)量的分布

15圖3.3：巨紫荊不同miRNA家族表達(dá)量的分布。3.2.2鑒定鹽脅迫條件下巨紫荊差異表達(dá)的miRNA為了研究鹽脅迫條件對巨紫荊已知miRNA的表達(dá)影響，我們首先鑒定在高鹽實(shí)驗組和對照組中有顯著差異表達(dá)的miRNA。通過對miRNA表達(dá)量的歸一化處理，排除歸....

圖3.4：對照組和高鹽實(shí)驗組中巨紫荊miRNA表達(dá)量的分布

碩士學(xué)位論文布，其中miR160_2、miR160_7、miR171_2、miR171_4、miR390_8_1、miR408_7的表達(dá)呈下調(diào)趨勢，而miR403_3的表達(dá)呈上調(diào)趨勢，可以推斷出鹽脅迫條件可以造成巨紫荊已知miRNA的差異表達(dá)，這很有可能參與到巨紫荊....

本文編號：3960680