研究目的:尋找外胚層發(fā)育不良(ectodermal dysplasia,ED)及單純性先天缺牙(selective tooth agenesis,STA)患者可能致病的基因突變,并對基因突變的致病性進(jìn)行功能驗證。材料與方法:抽取ED及STA患者外周血并提取血液基因組,對基因組DNA進(jìn)行全外顯子測序。對測序結(jié)果進(jìn)行分析,篩選出可能致病的基因突變,并通過細(xì)胞功能實驗對突變致病性進(jìn)行驗證。結(jié)果:對5名ED患者及1名STA患者進(jìn)行全外顯子測序。測序數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示,其質(zhì)量合格滿足后續(xù)分析要求。對數(shù)據(jù)進(jìn)行進(jìn)一步篩選,在5名ED患者中發(fā)現(xiàn)4個EDA基因突變,包括2個移碼突變(c.252delT,c.441₄42insACTCT)及2個錯義突變(c.463C>T,c.1013C>T)。兩個EDA移碼突變導(dǎo)致EDA蛋白胞外結(jié)構(gòu)域破壞,細(xì)胞無法分泌活性EDA蛋白,進(jìn)而引起下游NF-κB通路活性異常。EDA c.463C>T突變位于EDA蛋白胞外剪切位點,可導(dǎo)致可溶性EDA分泌減少及NF-κB通路活性降低。EDA c.1013C>T突變也可影響下游NF-κB通...

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3.1ED患者缺牙狀況分析

上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文252/10）及下頜第一磨牙（30%，3/10）。綜上所述，本研究中ED患者前磨牙及切牙缺失較為常見，磨牙及尖牙缺失較為少見。表3.2ED患者牙齒缺失狀況。Table3.2PatternsofteethlossforEDpatients.“*”缺失牙位圖3....

圖3.2一名患者全外顯子測序原始數(shù)據(jù)過濾狀況

上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文263.1.2全外顯子測序及結(jié)果篩選為尋找外胚層發(fā)育不良可能致病的基因突變，本研究抽取了五名ED患者的外周靜脈血，并進(jìn)行全外顯子測序。原始數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示，所有患者測序數(shù)據(jù)的GC堿基比例均為50%左右：低質(zhì)量reads（Lowqualityreads）在原....

圖3.3一名患者全外顯子測序數(shù)據(jù)堿基分布圖

上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文263.1.2全外顯子測序及結(jié)果篩選為尋找外胚層發(fā)育不良可能致病的基因突變，本研究抽取了五名ED患者的外周靜脈血，并進(jìn)行全外顯子測序。原始數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示，所有患者測序數(shù)據(jù)的GC堿基比例均為50%左右：低質(zhì)量reads（Lowqualityreads）在原....

圖3.4一名患者全外顯子測序數(shù)據(jù)堿基質(zhì)量狀況

上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文27圖3.4一名患者全外顯子測序數(shù)據(jù)堿基質(zhì)量狀況。Figure3.4ThebasequalityoftheWESdatafromoneEDpatient.本研究在五名ED患者中均篩選到可能致病的EDA基因突變，包括2個移碼突變（EDAc.252delT，E....

本文編號：3953827