土地鹽堿化嚴(yán)重影響農(nóng)作物的生長,了解植物抗逆機理并篩選抗逆相關(guān)基因?qū)鼓嬷参锓肿佑N具有重要的意義。本實驗室前期研究發(fā)現(xiàn),脹果甘草(Glycyrrhiza inflata)根誘導(dǎo)產(chǎn)生的愈傷組織具有一定的耐鹽性。對鹽處理之后的愈傷組織進行轉(zhuǎn)錄組測序,獲得了脹果甘草轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。本研究基于脹果甘草轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),對注釋為胚胎發(fā)育晚期豐富蛋白(late embryogenesis abundant protein,LEA)、NAC轉(zhuǎn)錄因子(NAC transcription factor,NAC)和富集脯氨酸蛋白(proline-rich proteins,PRPs)基因進行生物信息學(xué)分析,對篩選得到的差異表達基因進行基因表達模式分析,對GiLEA₃-1、GiNAC06、GiPRP3進行基因功能分析。主要研究結(jié)果如下:(1)脹果甘草LEA、NAC、PRPs基因生物信息學(xué)分析從鹽脅迫脹果甘草轉(zhuǎn)錄組中鑒定出20個LEA家族基因以及1個上調(diào)的LEA差異表達基因、86個脹果甘草NAC轉(zhuǎn)錄因子基因和14個NAC差異表達基因、5個PRPs家族基因以及3個PRPs差異表達基因。序列比對分析...

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2.1脹果甘草與擬南芥LEA家族基因構(gòu)建進化樹

12圖2.1脹果甘草與擬南芥LEA家族基因構(gòu)建進化樹Figure2.1PhylogenetictreeconstructedbyLEAfamilygenefromGlycyrrhizainflataandArabidopsisthaliana將脹果甘草與擬南芥NAC家族基因進行序....

圖2.2脹果甘草與擬南芥NAC家族基因構(gòu)建的進化樹

15圖2.2脹果甘草與擬南芥NAC家族基因構(gòu)建的進化樹Figure2.2PhylogenetictreeconstructedbyNACfamilygenefromGlycyrrhizainflataandArabidopsisthaliana將脹果甘草PRPs家族基因與擬南芥、....

圖2.3脹果甘草PRPs家族基因與擬南芥、水稻、大豆基因構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹

16圖2.3脹果甘草PRPs家族基因與擬南芥、水稻、大豆基因構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹Figure2.3PhylogenetictreeconstructedbyPRPsfamilygenesofGlycyrrhizainflataandArabidopsis，riceandsoybean....

圖2.4脹果甘草中LEA家族基因Motifs預(yù)測結(jié)果

18圖2.4脹果甘草中LEA家族基因Motifs預(yù)測結(jié)果注:A：脹果甘草LEA家族基因所含Motifs序列圖；B：脹果甘草LEA家族基因Motifs分布圖Figure2.4PredictionresultsoftheLEAfamilygeneMotifsinGlycyrrhiza....

本文編號：3940388