目的:尋找與膽管癌預后密切相關的關鍵基因,探索該基因與膽管癌預后的臨床相關性。方法:在GEO數(shù)據(jù)庫中檢索膽管癌表達譜芯片,通過GEO2R分析得到在不同芯片數(shù)據(jù)中均差異表達的關鍵基因,將差異基因利用DAVID數(shù)據(jù)庫進行GO生物學過程富集分析和KEGG通路富集分析,并利用TCGA數(shù)據(jù)庫及OncoLnc在線生存分析明確差異基因與膽管癌預后的關系,通過臨床數(shù)據(jù)驗證這一相關性,并由STRING數(shù)據(jù)庫對可能機制進行探索,為后續(xù)研究提供方向。結果:檢索到3個膽管癌相關基因芯片,通過差異分析得到127個基因在3個基因芯片中均有差異表達,GO富集及KEGG通路分析顯示差異基因主要參與氧化還原、細胞色素P450途徑、葉酸代謝等過程,TCGA、OncoLnc在線生存分析提示NAT2與膽管癌預后密切相關。收集臨床經(jīng)晚期標準化療的膽管癌患者組織及血液學樣本38例,采集臨床數(shù)據(jù)并送檢SNP基因測序,結果顯示NAT2突變型的疾病控制率為76.19%,顯著高于野生型的35.29%,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),提示突變型NAT2預后較好。利用STRING數(shù)據(jù)庫對NAT2基因進行蛋白互作分析,推測NAT2、C...

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【文章目錄】：
1 資料與方法
    1.1 基因芯片的選取及差異基因的篩選
    1.2 差異基因的生物學功能及通路分析
    1.3 關鍵基因與膽管癌預后的相關性分析
    1.4 繪制目標基因蛋白-蛋白相互作用圖
    1.5 臨床數(shù)據(jù)檢驗
    1.6 統(tǒng)計學方法
2 結果
    2.1 差異基因的篩選
    2.2 差異基因的生物學功能及通路分析
    2.3 關鍵基因對膽管癌預后的影響
    2.4 臨床數(shù)據(jù)檢驗
    2.5 尋找可能的作用機制
3 討論



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