目的:尋找與膽管癌預(yù)后密切相關(guān)的關(guān)鍵基因,探索該基因與膽管癌預(yù)后的臨床相關(guān)性。方法:在GEO數(shù)據(jù)庫中檢索膽管癌表達(dá)譜芯片,通過GEO2R分析得到在不同芯片數(shù)據(jù)中均差異表達(dá)的關(guān)鍵基因,將差異基因利用DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行GO生物學(xué)過程富集分析和KEGG通路富集分析,并利用TCGA數(shù)據(jù)庫及OncoLnc在線生存分析明確差異基因與膽管癌預(yù)后的關(guān)系,通過臨床數(shù)據(jù)驗(yàn)證這一相關(guān)性,并由STRING數(shù)據(jù)庫對(duì)可能機(jī)制進(jìn)行探索,為后續(xù)研究提供方向。結(jié)果:檢索到3個(gè)膽管癌相關(guān)基因芯片,通過差異分析得到127個(gè)基因在3個(gè)基因芯片中均有差異表達(dá),GO富集及KEGG通路分析顯示差異基因主要參與氧化還原、細(xì)胞色素P450途徑、葉酸代謝等過程,TCGA、OncoLnc在線生存分析提示NAT2與膽管癌預(yù)后密切相關(guān)。收集臨床經(jīng)晚期標(biāo)準(zhǔn)化療的膽管癌患者組織及血液學(xué)樣本38例,采集臨床數(shù)據(jù)并送檢SNP基因測(cè)序,結(jié)果顯示NAT2突變型的疾病控制率為76.19%,顯著高于野生型的35.29%,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),提示突變型NAT2預(yù)后較好。利用STRING數(shù)據(jù)庫對(duì)NAT2基因進(jìn)行蛋白互作分析,推測(cè)NAT2、C...

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 資料與方法
    1.1 基因芯片的選取及差異基因的篩選
    1.2 差異基因的生物學(xué)功能及通路分析
    1.3 關(guān)鍵基因與膽管癌預(yù)后的相關(guān)性分析
    1.4 繪制目標(biāo)基因蛋白-蛋白相互作用圖
    1.5 臨床數(shù)據(jù)檢驗(yàn)
    1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 差異基因的篩選
    2.2 差異基因的生物學(xué)功能及通路分析
    2.3 關(guān)鍵基因?qū)δ懝馨╊A(yù)后的影響
    2.4 臨床數(shù)據(jù)檢驗(yàn)
    2.5 尋找可能的作用機(jī)制
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