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人類(lèi)N-RAS等位基因特異性Taqman Q-PCR的初步研究

發(fā)布時(shí)間:2024-03-11 03:17
  西妥昔單抗和帕尼單抗是表皮生長(zhǎng)因子受體抑制劑,此類(lèi)靶向治療藥物的出現(xiàn),有效抑制了結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展,但西妥昔單抗和帕尼單抗的治療受到EGFR下游RAS基因的影響,RAS突變型能自動(dòng)活化通路并轉(zhuǎn)導(dǎo)下游信號(hào),所以只有RAS野生型患者才能對(duì)EGFR單抗的治療產(chǎn)生良好效果。RAS突變中N-RAS突變僅占約2%,不容易受到研究重視,因此本文對(duì)N-RAS的突變檢測(cè)進(jìn)行研究。本文先通過(guò)N-RAS常見(jiàn)的17種突變位點(diǎn),構(gòu)建了N-RAS突變型和野生型的質(zhì)粒,提取質(zhì)粒后通過(guò)電泳觀察條帶顏色,顏色較亮,用nanodrop檢測(cè)質(zhì)粒濃度結(jié)果為40ng/μL。測(cè)序驗(yàn)證顯示模板DNA序列與合成序列一致。采用Taqman探針熒光定量PCR技術(shù),使用Primer Express 3.0軟件設(shè)計(jì)野生型和突變型引物及探針,經(jīng)過(guò)PCR反應(yīng)體系優(yōu)化后得出最佳反應(yīng)體系的條件,引物終濃度為0.4μΜ/μL,探針終濃度為0.2μΜ/μL,模板DNA終濃度為1ng/μL,并以此建立單引物熒光定量PCR反應(yīng)體系。單引物體系構(gòu)建完成后分別用單引物驗(yàn)證其特異性,2號(hào)外顯子12號(hào)密碼子野生型模板熒光定量PCR的Ct值分別為:20.5456,2...

【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1.1第一代基因測(cè)序原理

圖1.1第一代基因測(cè)序原理

圖1.1第一代基因測(cè)序原理先由dNTP(短寡聚核苷酸)自身反應(yīng)之。之后用終止試劑(不含聚合酶的雙脫氧同大小的分子最終篩選分離。DNA模板后在DNA聚合酶作用下生成一部分均由一種ddNTP將其終止,后用所需序列讀出。


圖1.2延伸反應(yīng)分組示意圖

圖1.2延伸反應(yīng)分組示意圖

圖1.1第一代基因測(cè)序原理由圖1.1可知,首先由dNTP(短寡聚核苷酸)自身反應(yīng)之后被用作引物來(lái)導(dǎo)新DNA鏈的合成[5]。之后用終止試劑(不含聚合酶的雙脫氧核苷酸)對(duì)引物伸出大量不同形狀、不同大小的分子最終篩選分離。測(cè)序引物結(jié)合單鏈DNA模板后在DNA聚合酶....


圖1.3illumina測(cè)序原理

圖1.3illumina測(cè)序原理

圖1.3illumina測(cè)序原理DNA待測(cè)文庫(kù)構(gòu)建出單鏈的DNA文庫(kù)前要將待測(cè)樣本DNA打斷成多個(gè)長(zhǎng)度為200-,在這些小片段的兩端加上不同接頭。Flowcellcell以槽道的形式吸附流動(dòng)的DNA片段,建立文庫(kù)后,DNA片段在隨機(jī)附著在其表面。每個(gè)F....


圖1.4Solid測(cè)序原理

圖1.4Solid測(cè)序原理

齊魯工業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文行下一輪測(cè)序反應(yīng)。這種測(cè)序技術(shù)每次只用添加一個(gè)dNTP的特點(diǎn)就可以很高同聚物長(zhǎng)度的測(cè)量精度,此技術(shù)的主要測(cè)序誤差來(lái)自于堿基的替換%-1.5%之間[16]。ABI公司于2007年開(kāi)始投入Solid測(cè)序技術(shù)[17]并開(kāi)發(fā)此技術(shù)機(jī)器進(jìn)行商應(yīng)用。So....



本文編號(hào):3925740

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