高原鼢鼠p53通路抑制血管生成基因生信分析及低氧應答
發(fā)布時間:2024-02-22 18:58
高原鼢鼠(Myospalax Baileyi)是青藏高原特有的地下鼠,對低氧環(huán)境有很強的適應能力。上調血管內皮生長因子(vasculai endothelial growth factor,VEGF),提高組織中微血管密度(microvessel density,MVD)是地下鼠適應低氧洞道生境的重要機制。但是,隨著低氧程度增加,地下鼠組織中血管內皮生長因子表達受抑制,與SD大鼠的表達模式不同。這可能與p53結合HIF-1α后,通過增強下游抑制血管生成相關靶基因的轉錄,抑制微血管在低氧環(huán)境下無限制增長有關。本文以SD大鼠為對照,對高原鼢鼠p53及其下游抑制血管生成相關靶基因的編碼區(qū)序列進行了生物信息學分析,研究在不同海拔條件下高原鼢鼠p53及其下游抑制血管生成相關靶基因的表達模式。高原鼢鼠與同為嚙齒動物的以色列鼴鼠(Nannospalax galili)有較高的同源性。我們對多個物種的p53序列分析發(fā)現,高原鼢鼠p53基因309號位點甘氨酸(Gly,G)突變?yōu)樘於彼?Asp,D)。高原鼢鼠與以色列鼴鼠有2個(89 Ser和95 Pro)平行進化位點,我們認為這2個平行進化位點可能增強...
【文章頁數】:123 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
本文編號:3907110
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【部分圖文】:
圖2.低氧對HIF-1α的調節(jié)
圖2.低氧對HIF-1α的調節(jié)。主要途徑用粗體箭頭表示。ig2.RegulationofHIF-1αbyhypoxicresponse.ThemainpathwayofHIF-1αregulationypoxiaisdenotedwith....
圖3.p53抑制血管生成通路圖
士學位論文第1酸(K)與相鄰單體上殘基的結合,形成不穩(wěn)定二聚體來適應從而影響一系列下游靶基因功能[212]。鼴鼠p53的這種變異削的能力,表現為Apaf1基因不表達,Puma、Pten以及Noxa達;增強了抑制細胞周期的功能,使得細胞周期抑制相關的基表達[2....
圖4.p53相關靶基因通路圖
因子(VEGF),還可介導與肝素硫酸蛋白多糖及一些整合素(如:α3β1、α4β1、α6β1和α9β1)結合,調節(jié)細胞間相互作用、細胞分化增殖及血小板聚集[230-232];②原膠原同源區(qū)(procollagenhomologydomain,PC):可通過亞基聚集抑制血管....
圖5.22種哺乳動物的mtDNA系統進化樹
5.22種哺乳動物的mtDNA系統進化樹[383].分支長度與后驗概率值(%)標注在高原鼢鼠以紅星為代表。ure5.PhylogeneticTreeof22Mammals[383].Branchlengthwasshowedandposbabil....
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