蛋白質(zhì)的合成是所有生物體中的基本生命過程。核糖體維持正確的讀框?qū)τ诘鞍踪|(zhì)的合成至關重要,一旦發(fā)生移碼,將會導致截短的或無義蛋白的生成,從而造成翻譯能量的損耗,加重細胞清除及質(zhì)控機制的負擔。然而,在某些特殊情況下,翻譯中的核糖體能夠在mRNA的特定位置,從起始的0讀框轉(zhuǎn)換到-1或+1讀框,然后繼續(xù)進行翻譯,這一過程被稱作編程性核糖體移碼(programmed ribosomal frameshifting,PRF)。PRF現(xiàn)象首次在病毒中發(fā)現(xiàn),隨后越來越多的證據(jù)表明該現(xiàn)象普遍存在于從細菌到真核生物等生命進化的各個分支。前期基于單個基因的研究顯示游仆蟲中具有高頻率的+1 PRF現(xiàn)象。本研究對八肋游仆蟲(Euplotes octocarinatus)的大核基因組及轉(zhuǎn)錄組進行了測序分析,從基因組水平對這一特殊現(xiàn)象及其分子機制進行了深入探討。此外,還通過質(zhì)譜分析對預測的PRF基因加以驗證。所得結(jié)果如下:1.利用Illumina測序平臺對八肋游仆蟲大核基因組進行測序,共得到約11 Gb原始數(shù)據(jù);將低質(zhì)量reads過濾后,采用meta-assembly的拼接策略進行基因組組裝,將組裝結(jié)果中來自于細菌...

【文章頁數(shù)】：125 頁

【學位級別】：博士

圖1.1蛋白質(zhì)合成示意圖

圖1.2編程性核糖體移碼原理示意圖

圖1.3負調(diào)控因子,抗酶，調(diào)控體內(nèi)多胺水平的作用機制示意圖

圖1.4典型的編程性核糖體移碼信號

本文編號：3889380