基于目標(biāo)測序的中國漢族人群卒中后抑郁障礙的易感位點(diǎn)研究
發(fā)布時(shí)間:2024-01-24 10:42
背景和目的:卒中和抑郁癥都是由多種因素導(dǎo)致的,遺傳和環(huán)境都參與兩種疾病的發(fā)生。卒中后抑郁障礙(PSD)是卒中后常見的并發(fā)癥之一,會(huì)嚴(yán)重影響卒中患者的功能康復(fù)及日常生活能力。盡管已經(jīng)發(fā)現(xiàn)某些基因與PSD發(fā)生相關(guān),但目前對PSD的遺傳基礎(chǔ)及相關(guān)的病理生理過程仍缺乏了解。本研究旨在通過多通路基因目標(biāo)測序,尋找中國漢族人群中新型的PSD候選基因及位點(diǎn)。方法:本研究采用二階段病例對照研究方法,第一階段共納入了121例PSD患者,131例卒中后非抑郁(non-PSD)患者和639例健康對照,對其3.5M目標(biāo)基因區(qū)域進(jìn)行深度測序,通過logistic回歸對測得的基因突變位點(diǎn)進(jìn)行分析以尋找與PSD和non-PSD分別相關(guān)的突變位點(diǎn)。接著篩選出54個(gè)位點(diǎn)在第二階段獨(dú)立樣本中(200例PSD,218例non-PSD和983例健康對照)進(jìn)行重復(fù)驗(yàn)證。最后通過meta分析將兩組數(shù)據(jù)合并,尋找在3次分析中均有一致陽性結(jié)果的突變位點(diǎn)。其次研究還對陽性位點(diǎn)和基因進(jìn)行功能注釋,功能網(wǎng)絡(luò)分析及功能聚類分析。結(jié)果:在三次分析中,HTR3D和NEUROG3基因均與PSD顯著相關(guān)(HTR3D,rs55674402,p=0.0...
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
縮略詞對照表
前言
文獻(xiàn)綜述
研究方法
一、受試者入組
二、人口學(xué)特征統(tǒng)計(jì)和心理評估
三、血樣本收集和基因測序
四、質(zhì)量控制
五、驗(yàn)證位點(diǎn)篩選
六、數(shù)據(jù)分析
七、基因注釋
八、功能網(wǎng)絡(luò)分析與功能聚類分析
研究結(jié)果
一、人口學(xué)資料及心理評估結(jié)果
二、兩階段logistic回歸及meta分析結(jié)果
三、基因注釋
四、既往陽性位點(diǎn)在本研究中的結(jié)果
五、功能網(wǎng)絡(luò)及功能聚類分析結(jié)果
討論
結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
作者簡介
本文編號:3883672
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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中文摘要
英文摘要
縮略詞對照表
前言
文獻(xiàn)綜述
研究方法
一、受試者入組
二、人口學(xué)特征統(tǒng)計(jì)和心理評估
三、血樣本收集和基因測序
四、質(zhì)量控制
五、驗(yàn)證位點(diǎn)篩選
六、數(shù)據(jù)分析
七、基因注釋
八、功能網(wǎng)絡(luò)分析與功能聚類分析
研究結(jié)果
一、人口學(xué)資料及心理評估結(jié)果
二、兩階段logistic回歸及meta分析結(jié)果
三、基因注釋
四、既往陽性位點(diǎn)在本研究中的結(jié)果
五、功能網(wǎng)絡(luò)及功能聚類分析結(jié)果
討論
結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
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作者簡介
本文編號:3883672
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