脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs基因家族功能分化圖譜分析
發(fā)布時(shí)間:2023-12-04 18:35
研究目的:煙堿型乙酰膽堿受體(nAChRs)屬于五聚體配體門控離子通道或半胱氨酸環(huán)受體,傳導(dǎo)快速突觸信號(hào)在中樞和外周神經(jīng)系統(tǒng)。它們可以被內(nèi)源性神經(jīng)遞質(zhì)乙酰膽堿和外源性配體如尼古丁激活。它們還與多種神經(jīng)系統(tǒng)疾病如肌無力、精神分裂癥、帕金森病、阿爾茨海默病和尼古丁成癮等有密切關(guān)系。現(xiàn)在對(duì)nAChRs亞基及受體在神經(jīng)系統(tǒng)作用的分子機(jī)制及其與各種疾病的關(guān)系還不完全理解。隨著基因組學(xué)的快速發(fā)展和相關(guān)數(shù)據(jù)的積累,通過對(duì)nAChRs基因家族進(jìn)行進(jìn)化分析探究其功能分化成為可能。在本研究中,通過系統(tǒng)發(fā)育和最大似然分析方法,研究脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs基因家族的進(jìn)化,并分析其進(jìn)化特征,和與亞基功能分化相關(guān)的位點(diǎn),確定受體功能特異性的位點(diǎn)。研究方法:1.本研究選取了十二種包括人在內(nèi)的脊椎動(dòng)物,收集其神經(jīng)型nAChRs基因家族同源蛋白質(zhì)編碼區(qū)的核酸序列。2.對(duì)所有基因的核苷酸序列進(jìn)行處理。去掉每條序列中信號(hào)肽片段對(duì)應(yīng)的核苷酸。對(duì)處理好的數(shù)據(jù)進(jìn)行多序列比對(duì)和構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹;3.通過系統(tǒng)發(fā)育分析和最大似然法,根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹,計(jì)算每個(gè)亞基和每個(gè)部落的選擇壓力,即dN/dS;4.分析每個(gè)亞基在脊椎動(dòng)物和位點(diǎn)間的...
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語/符號(hào)說明
一、前言
1.1 研究現(xiàn)狀、成果
1.2 研究目的、方法
二、原理與方法
2.1 數(shù)據(jù)收集
2.2 多序列比對(duì)
2.3 系統(tǒng)發(fā)育分析
2.4 測(cè)量自然選擇
2.4.1 計(jì)算dN/dS的三個(gè)步驟
2.4.2 馬爾可夫過程
2.4.3 估計(jì)dN/dS
2.5 結(jié)構(gòu)模型
附圖
三、結(jié)果
3.1 脊椎動(dòng)物中的神經(jīng)型nAChRs亞基
3.2 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChR亞基的的多序列比對(duì)
3.3 脊椎動(dòng)物中的神經(jīng)型nAChRs亞基的系統(tǒng)發(fā)育分析
3.4 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基在不同的選擇壓力的模式下
3.5 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs基因家族部落的功能分化檢測(cè)
3.6 神經(jīng)型nAChRs亞基在脊椎動(dòng)物中的進(jìn)化
四、討論與結(jié)論
4.1 討論
4.1.1 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基的保守特征
4.1.2 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基的分子進(jìn)化
4.1.3 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基的每個(gè)部落的功能特異性
4.1.4 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基的進(jìn)化特征
4.2 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
發(fā)表論文和參加科研情況說明
附錄
附錄1 椎動(dòng)物中的煙堿型乙酰膽堿受體基因序列集
附錄2 九個(gè)脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基的ICD的多序列比對(duì)
綜述 變構(gòu)受體:從電器官到認(rèn)知
綜述參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3870487
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語/符號(hào)說明
一、前言
1.1 研究現(xiàn)狀、成果
1.2 研究目的、方法
二、原理與方法
2.1 數(shù)據(jù)收集
2.2 多序列比對(duì)
2.3 系統(tǒng)發(fā)育分析
2.4 測(cè)量自然選擇
2.4.1 計(jì)算dN/dS的三個(gè)步驟
2.4.2 馬爾可夫過程
2.4.3 估計(jì)dN/dS
2.5 結(jié)構(gòu)模型
附圖
三、結(jié)果
3.1 脊椎動(dòng)物中的神經(jīng)型nAChRs亞基
3.2 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChR亞基的的多序列比對(duì)
3.3 脊椎動(dòng)物中的神經(jīng)型nAChRs亞基的系統(tǒng)發(fā)育分析
3.4 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基在不同的選擇壓力的模式下
3.5 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs基因家族部落的功能分化檢測(cè)
3.6 神經(jīng)型nAChRs亞基在脊椎動(dòng)物中的進(jìn)化
四、討論與結(jié)論
4.1 討論
4.1.1 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基的保守特征
4.1.2 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基的分子進(jìn)化
4.1.3 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基的每個(gè)部落的功能特異性
4.1.4 脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基的進(jìn)化特征
4.2 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
發(fā)表論文和參加科研情況說明
附錄
附錄1 椎動(dòng)物中的煙堿型乙酰膽堿受體基因序列集
附錄2 九個(gè)脊椎動(dòng)物神經(jīng)型nAChRs亞基的ICD的多序列比對(duì)
綜述 變構(gòu)受體:從電器官到認(rèn)知
綜述參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3870487
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