干擾素刺激基因-15、信號(hào)傳導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子-1在卵巢癌中作用研究
發(fā)布時(shí)間:2023-12-02 09:39
目的探討干擾素刺激基因-15(ISG15)、信號(hào)傳導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子-1(STAT1)在卵巢癌中的作用。方法從基因型組織表達(dá)(GTEx)數(shù)據(jù)庫(kù)、腫瘤基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)下載并分析數(shù)據(jù);利用基因集富集分析(GSEA)軟件對(duì)通路富集進(jìn)行分析;采用Perl語(yǔ)言整理數(shù)據(jù),采用SPSS統(tǒng)計(jì)軟件包進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,采用R語(yǔ)言進(jìn)行數(shù)據(jù)分析、建立圖片、京都基因與基因組百科全書(KEGG)-基因本體論(GO)富集分析。結(jié)果卵巢癌組織的ISG15表達(dá)水平明顯高于正常卵巢組織(P<0.05);ISG15表達(dá)水平高的卵巢癌患者預(yù)后較好(P<0.05)。ISG15與STAT1呈正相關(guān)(r=0.629,P<0.05);卵巢癌組織的STAT1表達(dá)水平明顯高于正常卵巢組織(P<0.05);STAT1高表達(dá)是卵巢癌的保護(hù)因子(P<0.05)。ISG15、STAT1均在RIG-Ⅰ樣受體信號(hào)通路、溶酶體、TOLL樣受體信號(hào)通路富集;同時(shí),ISG15還富集于自噬調(diào)節(jié),STAT1還富集于凋亡。結(jié)論 ISG15及其密切相關(guān)基因STAT1在卵巢癌中可能發(fā)揮抑癌作用。
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 數(shù)據(jù)挖掘
1.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
2.1 ISG15在卵巢癌中的表達(dá)水平及與預(yù)后的相關(guān)性
2.2 STAT1在卵巢癌中的表達(dá)水平及與預(yù)后的相關(guān)性
2.3 基于GSEA的ISG15和STAT1相關(guān)信號(hào)通路
3 討論
本文編號(hào):3869403
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1 資料與方法
1.1 數(shù)據(jù)挖掘
1.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
2.1 ISG15在卵巢癌中的表達(dá)水平及與預(yù)后的相關(guān)性
2.2 STAT1在卵巢癌中的表達(dá)水平及與預(yù)后的相關(guān)性
2.3 基于GSEA的ISG15和STAT1相關(guān)信號(hào)通路
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