目的鑒定并分析2018年湖南省登革病毒2型(dengue virus 2,DENV-2)分離株的非結(jié)構(gòu)蛋白1(non-structural protein 1,NS1)基因。方法利用試劑盒提取登革熱患者血清RNA,RT-PCR法鑒定病毒類型及擴(kuò)增11株分離株NS1基因,并進(jìn)行基因測(cè)序。應(yīng)用MEGA 7.0軟件分析分離株與DENV-2標(biāo)準(zhǔn)株(KM204118)的NS1基因核苷酸及氨基酸序列,利用最大似然法(1000 Boot strap replicate)構(gòu)建NS1基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果共獲得11株分離株的NS1基因,經(jīng)比對(duì)發(fā)現(xiàn),除分離株HNNS201804和HNNS201810外,其余分離株在NS1基因第585位堿基由T變?yōu)镃(無(wú)義突變);HNNS201806的NS1基因第936位堿基由C變?yōu)門(無(wú)義突變)。11株分離株NS1基因其他突變位點(diǎn)均相同,共68處發(fā)生堿基突變,其中9個(gè)為有義突變。11株分離株與China-ZJ(2017-MH110594)、China-GZ(2018-MK564485、2015-KX621245、2017-MK564483)、Thailand(2017-L...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣品
    1.2 主要試劑
    1.3 DEN V型別鑒定
    1.4 DENV-2 NS1片段的特異性擴(kuò)增
    1.5 NS1核苷酸及氨基酸的序列對(duì)比
    1.6 NS1基因進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建
2 結(jié)果
    2.1 DEN V的型別鑒定
    2.2 DEN V-2 NS1基因特異性擴(kuò)增產(chǎn)物鑒定
    2.3 NS1的核苷酸及氨基酸BLAST比對(duì)
    2.4 NS1基因進(jìn)化樹(shù)分析
3 討論



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