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谷子SiSAP8基因的克隆及dCAPS標(biāo)記開發(fā)

發(fā)布時(shí)間:2023-10-15 15:17
  谷子是中國(guó)北方重要的耐旱雜糧作物。脅迫相關(guān)蛋白是一類具有A20和(或) AN1結(jié)構(gòu)域的鋅指蛋白,廣泛參與植物對(duì)非生物脅迫的響應(yīng)。本研究從‘晉谷20’中克隆得到谷子SiSAP8基因,該基因編碼區(qū)513 bp,編碼170個(gè)氨基酸,分子量為18.20 kD,等電點(diǎn)為8.28,包含1個(gè)A20和1個(gè)AN1結(jié)構(gòu)域。在對(duì)該基因序列進(jìn)行多態(tài)性分析,共發(fā)現(xiàn)5個(gè)SNP位點(diǎn)和1個(gè)InDel,其中編碼區(qū)有1處核苷酸變異位點(diǎn)(G/T)為非同義突變,使得纈氨酸變成了苯丙氨酸。利用第81位的SNP位點(diǎn)(A/G)開發(fā)了dCAPS標(biāo)記,命名為‘SNP-81’,該標(biāo)記的開發(fā)為后期功能鑒定及關(guān)聯(lián)分析提供了依據(jù)。

【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)

【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
    1.1 SiSAP8基因的克隆
    1.2 SiSAP8氨基酸序列的同源性分析及進(jìn)化分析
    1.3 SiSAP8序列的多態(tài)性分析
    1.4 SiSAP8的dCAPS標(biāo)記開發(fā)
2 討論
3 材料與方法
    3.1 試驗(yàn)材料
    3.2 目標(biāo)基因的克隆
    3.3 目標(biāo)基因序列的多態(tài)性分析
    3.4 dCAPS標(biāo)記的開發(fā)
作者貢獻(xiàn)



本文編號(hào):3854153

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