目的檢測(cè)納米二氧化硅(SiO₂)粉塵刺激的巨噬細(xì)胞微陣列芯片差異表達(dá)基因(DEGs)表達(dá)水平,篩選納米SiO₂粉塵暴露相關(guān)疾病的主導(dǎo)信號(hào)通路。方法從美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心開發(fā)的公共基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù)獲取納米SiO₂粉塵干預(yù)的RAW264.7巨噬細(xì)胞基因芯片GSE13005。以不添加SiO₂粉塵的完全培養(yǎng)基培養(yǎng)巨噬細(xì)胞作為對(duì)照組,終質(zhì)量濃度為5、20、50 mg/L的納米SiO₂粉塵處理巨噬細(xì)胞作為暴露組。采用RMA Express 1.2.0軟件、R語(yǔ)言3.5.1對(duì)巨噬細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選DEGs,并對(duì)相關(guān)基因進(jìn)行基因本體(GO)富集分析和京都基因與基因組百科全書(KEGG)信號(hào)通路分析。結(jié)果共篩選出67個(gè)SiO₂粉塵處理后的巨噬細(xì)胞DEGs,其中48個(gè)基因高表達(dá),19個(gè)基因低表達(dá)。GO富集分析結(jié)果顯示,DEGs主要參與胺的反應(yīng)、病毒基因組復(fù)制的調(diào)控、氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)負(fù)調(diào)控、排卵、支氣管擴(kuò)張劑反應(yīng)、趨化因子活性、肌細(xì)胞分化負(fù)調(diào)控、細(xì)胞對(duì)氨基酸缺乏的反應(yīng)、...

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 數(shù)據(jù)來(lái)源
    1.2 差異表達(dá)基因(differentially expressed genes,DEGs)篩選
    1.3 DEGs功能注釋與富集
    1.4 質(zhì)量控制
2 結(jié) 果
    2.1 DEGs
    2.2 DEGs功能注釋
    2.3 DEGs功能富集
3 討 論



本文編號(hào)：3822524