大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄變化的調(diào)節(jié)機(jī)理研究
發(fā)布時間:2023-05-18 21:51
肝臟具有許多重要的功能,如合成、解毒和代謝等。肝臟具有獨特的再生能力,在物理、化學(xué)、生物等因素的誘導(dǎo)下,殘肝細(xì)胞迅速活化,進(jìn)入細(xì)胞周期和細(xì)胞增殖的過程以補(bǔ)償丟失的肝組織并恢復(fù)肝臟的生物學(xué)功能,此過程稱為肝再生(liver regeneration,LR)。肝臟再生是一個由多種因素共同調(diào)節(jié)控制的復(fù)雜精密過程,由多細(xì)胞和多因子參與,涉及多種生理生化活動。本文從調(diào)節(jié)組學(xué)出發(fā),探究大鼠肝再生中基因甲基化、miRNA、lncRNA、circRNA、蛋白磷酸化、蛋白乙;⒌鞍滋腔⒌鞍追核鼗日{(diào)控方式對基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用以及它們對肝再生進(jìn)程的影響,進(jìn)一步闡明大鼠肝再生的分子機(jī)理。本研究以SD大鼠的2/3肝切除作為模型,通過高通量測序得到大鼠肝再生中基因甲基化、miRNA、lncRNA、circRNA、蛋白磷酸化、蛋白乙;⒌鞍滋腔、蛋白泛素化等調(diào)控方式涉及的基因/RNA/蛋白的種類及表達(dá)變化,用GO、NCBI和IPA等網(wǎng)站和軟件確定與基因轉(zhuǎn)錄活動相關(guān)的基因/RNA/蛋白,生物統(tǒng)計和計算機(jī)分析等得到其ratio值進(jìn)而篩選出差異基因/RNA/蛋白,系統(tǒng)生物學(xué)等方法分析它們在大鼠肝再生基因轉(zhuǎn)...
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 大鼠肝再生
1.1.1 大鼠2/3 肝再生模型制備
1.1.2 大鼠肝再生進(jìn)程
1.1.3 大鼠肝再生的機(jī)理
1.2 大鼠肝再生的分子調(diào)節(jié)
1.2.1 基因甲基化對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.2 miRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.3 lncRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.4 circRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.5 蛋白磷酸化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.6 蛋白乙;揎棇Υ笫蟾卧偕恼{(diào)節(jié)作用
1.2.7 蛋白糖基化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.8 蛋白泛素化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.9 大鼠肝再生中各調(diào)節(jié)方式的關(guān)聯(lián)性
1.3 研究目的和意義
1.3.1 研究目的
1.3.2 研究意義
2 材料與方法
2.1 實驗用大鼠
2.2 大鼠2/3 肝切除模型制備
2.3 大鼠再生肝的獲得
2.4 生理活動相關(guān)基因的確認(rèn)
2.5 基因甲基化的生物高通量檢測與分析
2.6 miRNA的生物高通量檢測與分析
2.7 lncRNA的生物高通量檢測與分析
2.8 circRNA的生物高通量檢測與分析
2.9 蛋白修飾的生物高通量檢測與分析
3.結(jié)果
3.1 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA表達(dá)變化
3.2 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白表達(dá)變化
3.3 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)基因的甲基化變化
3.4 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)miRNA表達(dá)變化
3.5 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)lncRNA表達(dá)變化
3.6 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)circRNA表達(dá)變化
3.7 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白的磷酸化變化
3.8 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白的乙酰化變化
3.9 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白的糖基化變化
3.10 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白的泛素化變化
3.11 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA/蛋白的表達(dá)相關(guān)性
3.12 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)基因甲基化/mRNA的豐度相關(guān)性
3.13 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)miRNA/mRNA的表達(dá)相關(guān)性
3.14 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)lncRNA/mRNA的表達(dá)相關(guān)性
3.15 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)circRNA/miRNA/mRNA的表達(dá)相關(guān)性
3.16 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白磷酸化/蛋白的豐度相關(guān)性
3.17 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白乙;/蛋白的豐度相關(guān)性
3.18 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白糖基化/蛋白的豐度相關(guān)性
3.19 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白泛素化/蛋白的豐度相關(guān)性
3.20 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)基因甲基化/mRNA/蛋白的豐度相關(guān)性
3.21 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)miRNA/mRNA/蛋白的表達(dá)相關(guān)性
3.22 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)lncRNA/mRNA/蛋白的表達(dá)相關(guān)性
3.23 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)circRNA/miRNA/mRNA/蛋白的表達(dá)相關(guān)性
3.24 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA/蛋白/蛋白磷酸化的豐度相關(guān)性
3.25 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA/蛋白/蛋白乙酰化的豐度相關(guān)性
3.26 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA/蛋白/蛋白糖基化的豐度相關(guān)性
3.27 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA/蛋白/蛋白泛素化的豐度相關(guān)性
4.論討
4.1 基因甲基化對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.2 miRNA對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.3 lncRNA對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.4 circRNA對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.5 蛋白磷酸化修飾對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.6 蛋白乙;揎棇Υ笫笤偕位蜣D(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.7 蛋白糖基化修飾對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.8 蛋白泛素化修飾對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
參考文獻(xiàn)
結(jié)論
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄
本文編號:3819063
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 大鼠肝再生
1.1.1 大鼠2/3 肝再生模型制備
1.1.2 大鼠肝再生進(jìn)程
1.1.3 大鼠肝再生的機(jī)理
1.2 大鼠肝再生的分子調(diào)節(jié)
1.2.1 基因甲基化對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.2 miRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.3 lncRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.4 circRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.5 蛋白磷酸化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.6 蛋白乙;揎棇Υ笫蟾卧偕恼{(diào)節(jié)作用
1.2.7 蛋白糖基化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.8 蛋白泛素化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.9 大鼠肝再生中各調(diào)節(jié)方式的關(guān)聯(lián)性
1.3 研究目的和意義
1.3.1 研究目的
1.3.2 研究意義
2 材料與方法
2.1 實驗用大鼠
2.2 大鼠2/3 肝切除模型制備
2.3 大鼠再生肝的獲得
2.4 生理活動相關(guān)基因的確認(rèn)
2.5 基因甲基化的生物高通量檢測與分析
2.6 miRNA的生物高通量檢測與分析
2.7 lncRNA的生物高通量檢測與分析
2.8 circRNA的生物高通量檢測與分析
2.9 蛋白修飾的生物高通量檢測與分析
3.結(jié)果
3.1 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA表達(dá)變化
3.2 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白表達(dá)變化
3.3 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)基因的甲基化變化
3.4 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)miRNA表達(dá)變化
3.5 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)lncRNA表達(dá)變化
3.6 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)circRNA表達(dá)變化
3.7 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白的磷酸化變化
3.8 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白的乙酰化變化
3.9 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白的糖基化變化
3.10 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白的泛素化變化
3.11 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA/蛋白的表達(dá)相關(guān)性
3.12 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)基因甲基化/mRNA的豐度相關(guān)性
3.13 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)miRNA/mRNA的表達(dá)相關(guān)性
3.14 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)lncRNA/mRNA的表達(dá)相關(guān)性
3.15 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)circRNA/miRNA/mRNA的表達(dá)相關(guān)性
3.16 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白磷酸化/蛋白的豐度相關(guān)性
3.17 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白乙;/蛋白的豐度相關(guān)性
3.18 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白糖基化/蛋白的豐度相關(guān)性
3.19 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)蛋白泛素化/蛋白的豐度相關(guān)性
3.20 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)基因甲基化/mRNA/蛋白的豐度相關(guān)性
3.21 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)miRNA/mRNA/蛋白的表達(dá)相關(guān)性
3.22 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)lncRNA/mRNA/蛋白的表達(dá)相關(guān)性
3.23 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)circRNA/miRNA/mRNA/蛋白的表達(dá)相關(guān)性
3.24 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA/蛋白/蛋白磷酸化的豐度相關(guān)性
3.25 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA/蛋白/蛋白乙酰化的豐度相關(guān)性
3.26 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA/蛋白/蛋白糖基化的豐度相關(guān)性
3.27 大鼠肝再生中基因轉(zhuǎn)錄相關(guān)mRNA/蛋白/蛋白泛素化的豐度相關(guān)性
4.論討
4.1 基因甲基化對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.2 miRNA對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.3 lncRNA對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.4 circRNA對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.5 蛋白磷酸化修飾對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.6 蛋白乙;揎棇Υ笫笤偕位蜣D(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.7 蛋白糖基化修飾對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.8 蛋白泛素化修飾對大鼠再生肝基因轉(zhuǎn)錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
參考文獻(xiàn)
結(jié)論
致謝
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本文編號:3819063
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