大鼠肝再生中基因轉錄變化的調(diào)節(jié)機理研究
發(fā)布時間:2023-05-18 21:51
肝臟具有許多重要的功能,如合成、解毒和代謝等。肝臟具有獨特的再生能力,在物理、化學、生物等因素的誘導下,殘肝細胞迅速活化,進入細胞周期和細胞增殖的過程以補償丟失的肝組織并恢復肝臟的生物學功能,此過程稱為肝再生(liver regeneration,LR)。肝臟再生是一個由多種因素共同調(diào)節(jié)控制的復雜精密過程,由多細胞和多因子參與,涉及多種生理生化活動。本文從調(diào)節(jié)組學出發(fā),探究大鼠肝再生中基因甲基化、miRNA、lncRNA、circRNA、蛋白磷酸化、蛋白乙酰化、蛋白糖基化、蛋白泛素化等調(diào)控方式對基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用以及它們對肝再生進程的影響,進一步闡明大鼠肝再生的分子機理。本研究以SD大鼠的2/3肝切除作為模型,通過高通量測序得到大鼠肝再生中基因甲基化、miRNA、lncRNA、circRNA、蛋白磷酸化、蛋白乙;⒌鞍滋腔、蛋白泛素化等調(diào)控方式涉及的基因/RNA/蛋白的種類及表達變化,用GO、NCBI和IPA等網(wǎng)站和軟件確定與基因轉錄活動相關的基因/RNA/蛋白,生物統(tǒng)計和計算機分析等得到其ratio值進而篩選出差異基因/RNA/蛋白,系統(tǒng)生物學等方法分析它們在大鼠肝再生基因轉...
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 文獻綜述
1.1 大鼠肝再生
1.1.1 大鼠2/3 肝再生模型制備
1.1.2 大鼠肝再生進程
1.1.3 大鼠肝再生的機理
1.2 大鼠肝再生的分子調(diào)節(jié)
1.2.1 基因甲基化對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.2 miRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.3 lncRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.4 circRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.5 蛋白磷酸化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.6 蛋白乙;揎棇Υ笫蟾卧偕恼{(diào)節(jié)作用
1.2.7 蛋白糖基化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.8 蛋白泛素化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.9 大鼠肝再生中各調(diào)節(jié)方式的關聯(lián)性
1.3 研究目的和意義
1.3.1 研究目的
1.3.2 研究意義
2 材料與方法
2.1 實驗用大鼠
2.2 大鼠2/3 肝切除模型制備
2.3 大鼠再生肝的獲得
2.4 生理活動相關基因的確認
2.5 基因甲基化的生物高通量檢測與分析
2.6 miRNA的生物高通量檢測與分析
2.7 lncRNA的生物高通量檢測與分析
2.8 circRNA的生物高通量檢測與分析
2.9 蛋白修飾的生物高通量檢測與分析
3.結果
3.1 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA表達變化
3.2 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白表達變化
3.3 大鼠肝再生中基因轉錄相關基因的甲基化變化
3.4 大鼠肝再生中基因轉錄相關miRNA表達變化
3.5 大鼠肝再生中基因轉錄相關lncRNA表達變化
3.6 大鼠肝再生中基因轉錄相關circRNA表達變化
3.7 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白的磷酸化變化
3.8 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白的乙;兓
3.9 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白的糖基化變化
3.10 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白的泛素化變化
3.11 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA/蛋白的表達相關性
3.12 大鼠肝再生中基因轉錄相關基因甲基化/mRNA的豐度相關性
3.13 大鼠肝再生中基因轉錄相關miRNA/mRNA的表達相關性
3.14 大鼠肝再生中基因轉錄相關lncRNA/mRNA的表達相關性
3.15 大鼠肝再生中基因轉錄相關circRNA/miRNA/mRNA的表達相關性
3.16 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白磷酸化/蛋白的豐度相關性
3.17 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白乙;/蛋白的豐度相關性
3.18 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白糖基化/蛋白的豐度相關性
3.19 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白泛素化/蛋白的豐度相關性
3.20 大鼠肝再生中基因轉錄相關基因甲基化/mRNA/蛋白的豐度相關性
3.21 大鼠肝再生中基因轉錄相關miRNA/mRNA/蛋白的表達相關性
3.22 大鼠肝再生中基因轉錄相關lncRNA/mRNA/蛋白的表達相關性
3.23 大鼠肝再生中基因轉錄相關circRNA/miRNA/mRNA/蛋白的表達相關性
3.24 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA/蛋白/蛋白磷酸化的豐度相關性
3.25 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA/蛋白/蛋白乙;呢S度相關性
3.26 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA/蛋白/蛋白糖基化的豐度相關性
3.27 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA/蛋白/蛋白泛素化的豐度相關性
4.論討
4.1 基因甲基化對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.2 miRNA對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.3 lncRNA對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.4 circRNA對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.5 蛋白磷酸化修飾對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.6 蛋白乙;揎棇Υ笫笤偕位蜣D錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.7 蛋白糖基化修飾對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.8 蛋白泛素化修飾對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
參考文獻
結論
致謝
攻讀碩士學位期間發(fā)表的學術論文目錄
本文編號:3819063
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摘要
ABSTRACT
1 文獻綜述
1.1 大鼠肝再生
1.1.1 大鼠2/3 肝再生模型制備
1.1.2 大鼠肝再生進程
1.1.3 大鼠肝再生的機理
1.2 大鼠肝再生的分子調(diào)節(jié)
1.2.1 基因甲基化對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.2 miRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.3 lncRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.4 circRNA對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.5 蛋白磷酸化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.6 蛋白乙;揎棇Υ笫蟾卧偕恼{(diào)節(jié)作用
1.2.7 蛋白糖基化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.8 蛋白泛素化修飾對大鼠肝再生的調(diào)節(jié)作用
1.2.9 大鼠肝再生中各調(diào)節(jié)方式的關聯(lián)性
1.3 研究目的和意義
1.3.1 研究目的
1.3.2 研究意義
2 材料與方法
2.1 實驗用大鼠
2.2 大鼠2/3 肝切除模型制備
2.3 大鼠再生肝的獲得
2.4 生理活動相關基因的確認
2.5 基因甲基化的生物高通量檢測與分析
2.6 miRNA的生物高通量檢測與分析
2.7 lncRNA的生物高通量檢測與分析
2.8 circRNA的生物高通量檢測與分析
2.9 蛋白修飾的生物高通量檢測與分析
3.結果
3.1 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA表達變化
3.2 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白表達變化
3.3 大鼠肝再生中基因轉錄相關基因的甲基化變化
3.4 大鼠肝再生中基因轉錄相關miRNA表達變化
3.5 大鼠肝再生中基因轉錄相關lncRNA表達變化
3.6 大鼠肝再生中基因轉錄相關circRNA表達變化
3.7 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白的磷酸化變化
3.8 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白的乙;兓
3.9 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白的糖基化變化
3.10 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白的泛素化變化
3.11 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA/蛋白的表達相關性
3.12 大鼠肝再生中基因轉錄相關基因甲基化/mRNA的豐度相關性
3.13 大鼠肝再生中基因轉錄相關miRNA/mRNA的表達相關性
3.14 大鼠肝再生中基因轉錄相關lncRNA/mRNA的表達相關性
3.15 大鼠肝再生中基因轉錄相關circRNA/miRNA/mRNA的表達相關性
3.16 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白磷酸化/蛋白的豐度相關性
3.17 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白乙;/蛋白的豐度相關性
3.18 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白糖基化/蛋白的豐度相關性
3.19 大鼠肝再生中基因轉錄相關蛋白泛素化/蛋白的豐度相關性
3.20 大鼠肝再生中基因轉錄相關基因甲基化/mRNA/蛋白的豐度相關性
3.21 大鼠肝再生中基因轉錄相關miRNA/mRNA/蛋白的表達相關性
3.22 大鼠肝再生中基因轉錄相關lncRNA/mRNA/蛋白的表達相關性
3.23 大鼠肝再生中基因轉錄相關circRNA/miRNA/mRNA/蛋白的表達相關性
3.24 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA/蛋白/蛋白磷酸化的豐度相關性
3.25 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA/蛋白/蛋白乙;呢S度相關性
3.26 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA/蛋白/蛋白糖基化的豐度相關性
3.27 大鼠肝再生中基因轉錄相關mRNA/蛋白/蛋白泛素化的豐度相關性
4.論討
4.1 基因甲基化對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.2 miRNA對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.3 lncRNA對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.4 circRNA對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.5 蛋白磷酸化修飾對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.6 蛋白乙;揎棇Υ笫笤偕位蜣D錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.7 蛋白糖基化修飾對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
4.8 蛋白泛素化修飾對大鼠再生肝基因轉錄活動的調(diào)節(jié)作用分析
參考文獻
結論
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本文編號:3819063
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