從NCBI數(shù)據(jù)庫中檢索得到甘薯ANS序列,利用同源比對在前期轉錄組數(shù)據(jù)庫中篩選獲得同源序列,通過PCR反應克隆出甘薯ANS基因(IbANS)的c DNA全長序列,進而預測和分析IbANS基因的蛋白質(zhì)序列,同時對其在不同甘薯品種的不同組織進行了實時定量PCR分析。結果表明,該c DNA具有最大開放閱讀框(ORF),共1 086個堿基,編碼362個氨基酸殘基;ANS蛋白為親水性蛋白質(zhì),不存在信號肽;保守結構域預測分析表明,該基因編碼的蛋白具有典型的ANS蛋白功能結構域,屬于2OG-Fe II_Oxy雙加氧酶超家族;系統(tǒng)進化樹分析顯示,甘薯ANS與三淺裂野牽牛親緣關系最近;熒光定量PCR結果表明,IbANS在紫心甘薯塊根中高表達。研究結果可為進一步闡明IbANS基因在紫心甘薯塊根中的形成及累積機制提供理論基礎。

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 材料
        1.1.1 植物材料
        1.1.2 儀器
        1.1.3試劑
    1.2 方法
        1.2.1 總RNA的提取和c DNA的反轉錄
        1.2.2 甘薯ANS基因c DNA的獲得
        1.2.3 生物信息學分析
        1.2.4 實時熒光定量PCR檢測
    1.3 數(shù)據(jù)分析
2 結果與分析
    2.1 甘薯Ib ANS基因克隆與電泳檢測
    2.2 理化性質(zhì)分析結果
    2.3 親/疏水性分析結果
    2.4 蛋白跨膜結構域及保守結構域分析
    2.5 蛋白信號肽預測
    2.6 亞細胞定位預測
    2.7 蛋白質(zhì)二級結構預測
    2.8 蛋白質(zhì)三級結構預測
    2.9 系統(tǒng)進化樹分析
    2.1 0 實時熒光定量PCR檢測ANS基因的組織表達結果
3 結論與討論



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