目的通過大數(shù)據(jù)篩選與肺腺癌預(yù)后相關(guān)的關(guān)鍵基因并探討其臨床價(jià)值和潛在機(jī)制。方法基于基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(GEO)中獲得的GSE18842,GSE27262以及GSE33532基因表達(dá)譜進(jìn)行數(shù)據(jù)分析;生物信息學(xué)方法篩選腫瘤組織和正常肺組織的差異表達(dá)基因,對(duì)其進(jìn)行京都基因與基因組百科全書(KEGG)和基因本體論(GO)富集分析后進(jìn)行蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI)、模組、表達(dá)差異和預(yù)后分析和篩選。35例非小細(xì)胞肺癌標(biāo)本和35例配對(duì)的癌旁正常組織,共70例組織標(biāo)本分為腫瘤組和正常組對(duì)MAD2L1和TTK的表達(dá)進(jìn)行了免疫組化驗(yàn)證。結(jié)果共有256個(gè)基因的表達(dá)譜數(shù)據(jù)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.05),包括66個(gè)上調(diào)基因,190個(gè)下調(diào)基因。進(jìn)行功能分析后篩選出32個(gè)上調(diào)基因。32個(gè)基因中的29與肺腺癌預(yù)后顯著相關(guān)。相較與正常肺組織,所有29個(gè)基因均在肺腺癌組織中高表達(dá)并主要富集在細(xì)胞周期通路。其中7個(gè)關(guān)鍵基因與紡錘體組裝檢查點(diǎn)(SAC)復(fù)合體緊密相關(guān),負(fù)責(zé)調(diào)控細(xì)胞G2/M期行為。我們選擇了SAC相關(guān)基因TTK和MAD2L1,在肺腺癌患者組織標(biāo)本中觀察到了TTK和MAD2L1相較與癌旁正常肺組織的過表...

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【文章目錄】：
1 資料和方法
    1.1 基因芯片數(shù)據(jù)
    1.2 差異表達(dá)基因的數(shù)據(jù)分析
    1.3 基因富集分析
    1.4 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（PPI）構(gòu)建和分析
    1.5 MCODE基因的生存分析
    1.6 基因表達(dá)量分析
    1.7 免疫組化數(shù)據(jù)庫分析
    1.8 非小細(xì)胞肺癌患者組織標(biāo)本
    1.9 免疫組化實(shí)驗(yàn)
    1.1 0 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 差異表達(dá)基因的獲取
    2.2 差異表達(dá)基因的GO和KEGG富集分析
    2.3 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（PPI）以及模組分析
    2.4 MCODE基因的生存分析以及TCGA差異表達(dá)分析
    2.5 29個(gè)核心基因的二次KEGG富集分析
    2.6 驗(yàn)證組織樣本中關(guān)鍵DEGs的表達(dá)
3討論



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