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Fmr1基因敲除型小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)分析

發(fā)布時(shí)間:2023-04-09 23:10
  目的探討Fmr1基因敲除型小鼠糞便腸道細(xì)菌群落的結(jié)構(gòu)及多樣性。方法利用16S rRNA高通量測序技術(shù)對10份小鼠糞便樣本進(jìn)行測序分析并進(jìn)行生物學(xué)分析。結(jié)果兩組樣本測序共獲得高質(zhì)量序列325 280條,核心菌門為擬桿菌門、厚壁菌門、變形菌門。Anosim分析表明基因敲除(KO)組與正常野生型(WT)組小鼠兩組間具有顯著差異,組內(nèi)樣品重復(fù)性滿足數(shù)據(jù)分析要求,Adonis分析表明本次檢驗(yàn)可信度高(P<0.05)。LDA值展現(xiàn)KO組與WT組小鼠腸道微生態(tài)菌群有明顯差異,基于Unifrac距離,Amova分析表明KO和WT組組間差異顯著(P<0.05)。結(jié)論 KO組與WT組小鼠腸道微生物群落的結(jié)構(gòu)及多樣性存在顯著差異且具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示孤獨(dú)癥與腸道微生態(tài)系統(tǒng)密切相關(guān),腸道微生態(tài)系統(tǒng)可能通過微生物代謝的間接作用影響孤獨(dú)癥的發(fā)生發(fā)展,但具體的作用機(jī)制仍需進(jìn)一步的研究。

【文章頁數(shù)】:8 頁

【文章目錄】:
材料與方法
    1.實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
    2.試劑與儀器
    3.方法
        (1) 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物基因型鑒定[7]:
        (2) 樣本采集
        (3)生物信息學(xué)及統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
結(jié) 果
    1.實(shí)驗(yàn)小鼠鑒定型結(jié)果
    2.樣本序列及OTUs
    3.Alpha多樣性分析
    4.Beta多樣性分析
    5.腸道菌群整體結(jié)構(gòu)分析
        (1)共有及特有OTU統(tǒng)計(jì)分析
        (2)腸道菌群在門水平的結(jié)構(gòu)分析
        (3)腸道菌群在科水平的結(jié)構(gòu)分析
        (4)腸道菌群在屬水平的結(jié)構(gòu)分析
    6.樣本組間統(tǒng)計(jì)分析
        (1)組間群落結(jié)構(gòu)差異顯著性分析
        (2)組間物種差異顯著性分析
討 論



本文編號:3787898

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