黃瓜葉酸合成關(guān)鍵基因克隆與分析
發(fā)布時(shí)間:2023-04-09 02:25
【目的】分析黃瓜基因組中與葉酸合成代謝相關(guān)的基因數(shù)量、定位以及表達(dá)特征,對(duì)關(guān)鍵酶基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析與克隆,旨在為黃瓜葉酸合成調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)!痉椒ā扛鶕(jù)已報(bào)道的擬南芥葉酸合成相關(guān)基因,利用黃瓜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中9930V3版本進(jìn)行BLAST比對(duì)。利用MapChart繪制黃瓜染色體物理圖譜并對(duì)基因定位。利用qRT-PCR分析這些基因在黃瓜果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期和不同材料中的表達(dá)量。通過(guò)MEGA、WebLOGO、ExPASy等工具對(duì)關(guān)鍵酶基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析。通過(guò)PCR擴(kuò)增對(duì)關(guān)鍵酶基因進(jìn)行克隆,并測(cè)序分析基因的序列差異!窘Y(jié)果】同源比對(duì)獲得19個(gè)黃瓜葉酸代謝相關(guān)基因,這些基因不均勻分布在黃瓜7條染色體上,且以Chr.4和Chr.5上分布最多。通過(guò)對(duì)其中11個(gè)調(diào)控葉酸合成的基因在測(cè)序黃瓜9930果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期以及果實(shí)葉酸含量高低差異顯著的2份材料的表達(dá)量分析,發(fā)現(xiàn)CsFPGS、CsHPPK/CsDHPS和CsDHNA 3個(gè)基因與果實(shí)葉酸含量變化趨勢(shì)完全一致;CsADCS、CsADCL、CsDHNA、CsHPPK/CsDHFS、CsFPGS、CsDHFS等基因的表達(dá)量在2...
【文章頁(yè)數(shù)】:17 頁(yè)
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 黃瓜葉酸合成代謝相關(guān)基因鑒定
1.2.2 黃瓜材料取樣方式及葉酸含量測(cè)定
1.2.3 總RNA的提取與cDNA第一鏈的合成
1.2.4 黃瓜葉酸合成基因在果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期及不同材料中的表達(dá)量分析
1.2.5 黃瓜葉酸合成關(guān)鍵酶基因的蛋白序列比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
1.2.6 黃瓜GCHI及ADCS的克隆與序列分析
1.2.7 基因的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
2.1 黃瓜葉酸合成相關(guān)基因
2.2 基因的染色體定位
2.3 9930果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期葉酸含量及對(duì)應(yīng)時(shí)期的葉酸合成基因的表達(dá)量
2.4 果實(shí)葉酸含量高低差異顯著材料65G和02245中基因的表達(dá)量分析
2.5 黃瓜及其他物種GCHI蛋白質(zhì)序列分析及進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
2.6 黃瓜及其他物種ADCS蛋白質(zhì)序列分析及進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
2.7 黃瓜GCHI與ADCS基因全長(zhǎng)的克隆與序列分析
2.8 黃瓜GCHI與ADCS基因的生物信息學(xué)分析
3 討論
4 結(jié)論
本文編號(hào):3786895
【文章頁(yè)數(shù)】:17 頁(yè)
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 黃瓜葉酸合成代謝相關(guān)基因鑒定
1.2.2 黃瓜材料取樣方式及葉酸含量測(cè)定
1.2.3 總RNA的提取與cDNA第一鏈的合成
1.2.4 黃瓜葉酸合成基因在果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期及不同材料中的表達(dá)量分析
1.2.5 黃瓜葉酸合成關(guān)鍵酶基因的蛋白序列比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
1.2.6 黃瓜GCHI及ADCS的克隆與序列分析
1.2.7 基因的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
2.1 黃瓜葉酸合成相關(guān)基因
2.2 基因的染色體定位
2.3 9930果實(shí)發(fā)育不同時(shí)期葉酸含量及對(duì)應(yīng)時(shí)期的葉酸合成基因的表達(dá)量
2.4 果實(shí)葉酸含量高低差異顯著材料65G和02245中基因的表達(dá)量分析
2.5 黃瓜及其他物種GCHI蛋白質(zhì)序列分析及進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
2.6 黃瓜及其他物種ADCS蛋白質(zhì)序列分析及進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
2.7 黃瓜GCHI與ADCS基因全長(zhǎng)的克隆與序列分析
2.8 黃瓜GCHI與ADCS基因的生物信息學(xué)分析
3 討論
4 結(jié)論
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