光肩星天牛(Anoplophora glabripennis)是我國重要的林業(yè)蛀干害蟲,也是國際重要的檢疫對象。寄主廣泛,主要以幼蟲在寄主內(nèi)蛀道危害并越冬,而冬季的低溫條件直接影響著越冬昆蟲的發(fā)育生長以及繁殖擴(kuò)散,因此昆蟲的耐寒性已成為其種群得以生存和繁衍的重要條件。通過近年來的追蹤調(diào)查發(fā)現(xiàn)光肩星天牛正在向高緯度高海拔地區(qū)進(jìn)行擴(kuò)散,推測與其耐寒性的增強(qiáng)相關(guān)。本文以光肩星天牛不同越冬時(shí)期的幼蟲為研究對象,利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),探究目標(biāo)基因以及可變剪切事件在不同越冬時(shí)期的表達(dá)規(guī)律以揭示其耐寒性的影響因素及相關(guān)耐寒適應(yīng)機(jī)制。主要結(jié)果如下:1.獲得了不同越冬時(shí)期的光肩星天牛轉(zhuǎn)錄水平的遺傳信息。對5個(gè)不同越冬階段的15個(gè)樣本分別進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得822,365,302條clean reads,注釋22319個(gè)基因,在COG、GO、KEGG注釋的基因分別為3909、8103和4581個(gè)基因,3個(gè)數(shù)據(jù)庫中共注釋基因1518個(gè)。2.明確了不同越冬時(shí)期光肩星天牛幼蟲的轉(zhuǎn)錄差異。對顯著差異表達(dá)基因的9種聚類子集中5個(gè)聚類子集分析表明,5個(gè)子集的基因表達(dá)量變化趨勢各不相同,2、4、6、7、8類子集中基因的...

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【學(xué)位級別】：碩士

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摘要
Abstract
1 引言
    1.1 光肩星天牛的概況
        1.1.1 光肩星天牛及其分布危害
        1.1.2 光肩星天牛的研究進(jìn)展
    1.2 昆蟲耐寒性概況
        1.2.1 昆蟲的耐寒性
        1.2.2 影響昆蟲耐寒性的因素
        1.2.3 昆蟲的耐寒策略
        1.2.4 昆蟲耐寒性研究技術(shù)發(fā)展
        1.2.5 昆蟲耐寒性分子生物學(xué)研究
        1.2.6 光肩星天牛耐寒性研究概況
    1.3 可變剪切事件的研究概況
    1.4 研究的目的與意義
    1.5 研究思路與技術(shù)路線
2 轉(zhuǎn)錄組測序分析不同越冬階段光肩星天牛幼蟲的耐寒基因
    2.1 材料與方法
        2.1.1 蟲源
        2.1.2 光肩星天牛的RNA提取和文庫構(gòu)建
        2.1.3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
        2.1.4 與參考基因組比對
        2.1.5 轉(zhuǎn)錄組功能注釋與分類
        2.1.6 差異表達(dá)分析
        2.1.7 熒光定量PCR驗(yàn)證
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 Illumina測序和從頭組裝
        2.2.2 基因注釋結(jié)果
        2.2.3 基因的表達(dá)量分析
        2.2.4 差異基因分析
        2.2.5 熒光定量結(jié)果分析
    2.3 結(jié)論與討論
        2.3.1 轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果分析
        2.3.2 差異基因的表達(dá)分析
3 基于RNA-seq技術(shù)對不同越冬階段光肩星天牛幼蟲的可變剪切事件分析
    3.1 材料與方法
        3.1.1 數(shù)據(jù)來源
        3.1.2 可變剪切事件鑒定方法
        3.1.3 差異可變剪切事件的鑒定方法
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 相鄰階段可變剪切事件及產(chǎn)生的新可變剪切事件
        3.2.2 差異可變剪切事件分析
    3.4 結(jié)論與討論
4 結(jié)論與展望
    4.1 研究結(jié)論
    4.2 創(chuàng)新點(diǎn)
    4.3 問題與展望
參考文獻(xiàn)
個(gè)人簡介
導(dǎo)師簡介
致謝



本文編號：3769617