目的:應(yīng)用生物信息學(xué)方法研究干燥綜合征的差異基因,為干燥綜合征的治療提供新靶點(diǎn)。方法:在GEO數(shù)據(jù)庫中下載并篩選干燥綜合征相關(guān)的差異表達(dá)基因,利用STRING在線數(shù)據(jù)庫構(gòu)建蛋白與蛋白相互作用關(guān)系網(wǎng)絡(luò),運(yùn)用Cytoscape軟件篩選出關(guān)鍵基因,通過DAVID數(shù)據(jù)平臺(tái)對(duì)差異基因進(jìn)行基因本體論(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析。結(jié)果:通過分析基因芯片GSE127952后獲得406個(gè)差異基因,篩選出STAT1、MX1、IFIT1、IFIT3、ISG15等10個(gè)關(guān)鍵基因;GO分析顯示差異基因主要富集在正向調(diào)節(jié)細(xì)胞因子產(chǎn)生、淋巴細(xì)胞分化、T細(xì)胞活化等生物學(xué)過程;KEGG分析主要涉及細(xì)胞因子與細(xì)胞因子受體的相互作用、趨化因子信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路、T細(xì)胞受體信號(hào)通路等。結(jié)論:上述所得的關(guān)鍵基因和信號(hào)通路可能與干燥綜合征的疾病過程相關(guān),為深入研究靶向治療干燥綜合征提供了理論參考。

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材 料
    1.2 篩選pSS差異表達(dá)基因
    1.3 PPI分析
    1.4 差異表達(dá)基因的富集分析
2 結(jié) 果
    2.1 差異基因的篩選
    2.2 構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)和篩選關(guān)鍵差異基因
    2.3 差異基因的GO和KEGG富集分析
3 討 論



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