目的:應用生物信息學方法研究干燥綜合征的差異基因,為干燥綜合征的治療提供新靶點。方法:在GEO數據庫中下載并篩選干燥綜合征相關的差異表達基因,利用STRING在線數據庫構建蛋白與蛋白相互作用關系網絡,運用Cytoscape軟件篩選出關鍵基因,通過DAVID數據平臺對差異基因進行基因本體論(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析。結果:通過分析基因芯片GSE127952后獲得406個差異基因,篩選出STAT1、MX1、IFIT1、IFIT3、ISG15等10個關鍵基因;GO分析顯示差異基因主要富集在正向調節(jié)細胞因子產生、淋巴細胞分化、T細胞活化等生物學過程;KEGG分析主要涉及細胞因子與細胞因子受體的相互作用、趨化因子信號通路、Toll樣受體信號通路、T細胞受體信號通路等。結論:上述所得的關鍵基因和信號通路可能與干燥綜合征的疾病過程相關,為深入研究靶向治療干燥綜合征提供了理論參考。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材 料
    1.2 篩選pSS差異表達基因
    1.3 PPI分析
    1.4 差異表達基因的富集分析
2 結 果
    2.1 差異基因的篩選
    2.2 構建PPI網絡和篩選關鍵差異基因
    2.3 差異基因的GO和KEGG富集分析
3 討 論



本文編號：3768741