吉林人參Dof基因家族的系統(tǒng)分析及PgDof14-1和PgDof26-5基因功能的初步研究
發(fā)布時間:2023-03-21 18:45
人參(Panax ginseng C.A.Meyer)是五加科(Araliaceae)人參屬(Panax)多年生草本藥用植物,DNA binding with one finger(Dof)蛋白是植物中特有的一類轉(zhuǎn)錄因子。為初步探究人參中Dof基因的功能,本研究以實驗室構(gòu)建的吉林人參248,993 Unigenes數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ),共挖掘75條吉林人參Dof Unigenes(Pg Dofs),其中有54條具備完整的開放閱讀框和保守結(jié)構(gòu)域。對這些基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,挖掘出2條與皂苷含量相關(guān)的基因Pg Dof14-1和Pg Dof26-5,在吉林人參中克隆上述基因,并以根癌農(nóng)桿菌和發(fā)根農(nóng)桿菌介導(dǎo)法分別轉(zhuǎn)化擬南芥和誘導(dǎo)人參發(fā)狀根,以期為這兩條基因的功能驗證奠定基礎(chǔ),研究結(jié)果如下:1.75條Pg Dofs基因長度平均分布在200bp-2400bp之間。2.Dof蛋白普遍參與植物生物過程、分子功能與細(xì)胞成分三個方面,在level2水平上主要功能集中于8個功能類別:包括細(xì)胞過程(Cellular process,GO:0009987)、代謝過程(Metabolic process,GO:0008...
【文章頁數(shù)】:85 頁
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 前言
1.1 人參概述
1.2 人參皂苷
1.3 人參發(fā)狀根
1.4 Dof轉(zhuǎn)錄因子
1.5 Dof蛋白參與植物的抗冷脅迫
1.6 目的與意義
第二章 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 儀器和軟件
2.3 實驗方法
第三章 結(jié)果與分析
3.1 PgDofs的生物信息學(xué)
3.2 PgDof14-1、PgDof26-5 基因的生物信息學(xué)分析
3.3 目的基因的克隆及表達(dá)載體的構(gòu)建
3.4 冷脅迫處理下候選基因的表達(dá)分析
3.5 擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化
3.6 人參幼苗的遺傳轉(zhuǎn)化及檢測
第四章 討論
4.1 PgDofs的生物信息學(xué)分析
4.2 PgDof14-1和PgDof26-5的生物信息學(xué)分析
4.3 冷脅迫處理下候選基因的表達(dá)分析
4.4 PgDof14-1、PgDof26-5 基因轉(zhuǎn)化擬南芥的研究
4.5 PgDof14-1、PgDof26-5 基因轉(zhuǎn)化人參幼苗的研究
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
附表1 PgDofs與人參皂苷含量的顯著性分析
附表2 PgDofs與關(guān)鍵酶基因表達(dá)量的顯著性分析
附表3 PgDofs的 SNP與皂苷含量的顯著性分析
作者簡介
致謝
本文編號:3767096
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第一章 前言
1.1 人參概述
1.2 人參皂苷
1.3 人參發(fā)狀根
1.4 Dof轉(zhuǎn)錄因子
1.5 Dof蛋白參與植物的抗冷脅迫
1.6 目的與意義
第二章 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 儀器和軟件
2.3 實驗方法
第三章 結(jié)果與分析
3.1 PgDofs的生物信息學(xué)
3.2 PgDof14-1、PgDof26-5 基因的生物信息學(xué)分析
3.3 目的基因的克隆及表達(dá)載體的構(gòu)建
3.4 冷脅迫處理下候選基因的表達(dá)分析
3.5 擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化
3.6 人參幼苗的遺傳轉(zhuǎn)化及檢測
第四章 討論
4.1 PgDofs的生物信息學(xué)分析
4.2 PgDof14-1和PgDof26-5的生物信息學(xué)分析
4.3 冷脅迫處理下候選基因的表達(dá)分析
4.4 PgDof14-1、PgDof26-5 基因轉(zhuǎn)化擬南芥的研究
4.5 PgDof14-1、PgDof26-5 基因轉(zhuǎn)化人參幼苗的研究
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
附表1 PgDofs與人參皂苷含量的顯著性分析
附表2 PgDofs與關(guān)鍵酶基因表達(dá)量的顯著性分析
附表3 PgDofs的 SNP與皂苷含量的顯著性分析
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本文編號:3767096
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