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基于生物信息學方法分析甲狀腺乳頭狀癌的差異表達基因

發(fā)布時間:2023-03-19 06:24
  研究目的通過生物信息學方法分析甲狀腺乳頭狀癌的差異表達基因,進一步了解其潛在的分子機制,為尋找新的診斷性生物學標志物或治療性靶基因提供理論支撐。研究材料與方法從基因表達譜數(shù)據(jù)庫(gene expression omnibus,GEO)中下載GSE33630、GSE3678和GSE60542的原始數(shù)據(jù),利用R語言對數(shù)據(jù)進行預處理后篩選出差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs),并對DEGs進行GO(Gene Ontology)功能富集分析、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析和蛋白互作(Protein–protein interaction,PPI)網(wǎng)絡分析后進一步篩選出靶基因。然后在人體組織、癌癥和腫瘤基因圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫和人類蛋白質(zhì)圖譜(Human Protein Atlas,HPA)數(shù)據(jù)庫中驗證靶基因的表達。最后用TCGA數(shù)據(jù)庫中的臨床資料分析靶基因與預后的關系。研究結(jié)果通過生物信息學分析,我們從75個成對的甲狀腺乳頭狀癌...

【文章頁數(shù)】:59 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
主要英文縮略詞表
1 引言
2 材料與方法
3 結(jié)果
4 討論
5 結(jié)論
參考文獻
綜述 分子靶向治療在晚期分化型甲狀腺癌中的研究進展
    參考文獻
個人簡歷、在學期間的學術發(fā)表論文
致謝



本文編號:3764743

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