基于生物信息學(xué)方法分析甲狀腺乳頭狀癌的差異表達(dá)基因
發(fā)布時(shí)間:2023-03-19 06:24
研究目的通過(guò)生物信息學(xué)方法分析甲狀腺乳頭狀癌的差異表達(dá)基因,進(jìn)一步了解其潛在的分子機(jī)制,為尋找新的診斷性生物學(xué)標(biāo)志物或治療性靶基因提供理論支撐。研究材料與方法從基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫(kù)(gene expression omnibus,GEO)中下載GSE33630、GSE3678和GSE60542的原始數(shù)據(jù),利用R語(yǔ)言對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理后篩選出差異表達(dá)基因(differentially expressed genes,DEGs),并對(duì)DEGs進(jìn)行GO(Gene Ontology)功能富集分析、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析和蛋白互作(Protein–protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)分析后進(jìn)一步篩選出靶基因。然后在人體組織、癌癥和腫瘤基因圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)和人類蛋白質(zhì)圖譜(Human Protein Atlas,HPA)數(shù)據(jù)庫(kù)中驗(yàn)證靶基因的表達(dá)。最后用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中的臨床資料分析靶基因與預(yù)后的關(guān)系。研究結(jié)果通過(guò)生物信息學(xué)分析,我們從75個(gè)成對(duì)的甲狀腺乳頭狀癌...
【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
主要英文縮略詞表
1 引言
2 材料與方法
3 結(jié)果
4 討論
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 分子靶向治療在晚期分化型甲狀腺癌中的研究進(jìn)展
參考文獻(xiàn)
個(gè)人簡(jiǎn)歷、在學(xué)期間的學(xué)術(shù)發(fā)表論文
致謝
本文編號(hào):3764743
【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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1 引言
2 材料與方法
3 結(jié)果
4 討論
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 分子靶向治療在晚期分化型甲狀腺癌中的研究進(jìn)展
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