基因突變和免疫分型預(yù)測膀胱癌患者PD-1/PD-L1阻斷免疫治療反應(yīng)性的研究
發(fā)布時間:2023-03-19 05:17
背景:膀胱癌已成為全球最常見和最致命的癌癥之一。據(jù)估計,2018年美國估計有81,190例新發(fā)膀胱癌病例和17,240例死亡病例,在中國,雖然發(fā)病率和死亡率相對較低,但發(fā)病率逐年增加,估計每年約有80,500例新發(fā)膀胱癌病例和32,900例死亡病例。近期,針對程序性細胞死亡蛋白1(PD-1)及其配體(PD-L1)的免疫檢查點抑制劑的出現(xiàn),徹底改變了轉(zhuǎn)移性尿路上皮癌的治療現(xiàn)狀。然而,僅有15%至24%接受治療的患者可以獲得有效反應(yīng)。有效預(yù)測晚期膀胱癌患者抗PD-1/PD-L1治療的療效仍然是一項巨大的挑戰(zhàn)。在本研究中,我們對膀胱癌患者的基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)以及臨床資料等多維數(shù)據(jù)類型進行綜合分析,探究可有效反應(yīng)膀胱癌患者抗PD-1/PD-L1治療療效的生物標(biāo)志物。方法:我們從公共數(shù)據(jù)庫中下載了膀胱癌患者多維類型的數(shù)據(jù),包括臨床數(shù)據(jù)、mRNA表達譜數(shù)據(jù)、基因拷貝數(shù)變異數(shù)據(jù)和基因突變數(shù)據(jù)。分別分析膀胱癌的RNA測序數(shù)據(jù)、體細胞突變數(shù)據(jù)和PD-L1基因擴增數(shù)據(jù)。將膀胱癌樣本分成4種腫瘤微環(huán)境免疫類型(TMIT),分別如下:TMIT I型:PD-L1和CD8A的表達水平分別高于其中位值;TMIT I...
【文章頁數(shù)】:44 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
縮略詞說明
中文摘要
英文摘要
第一章 TP53和RB1 基因突變預(yù)測膀胱癌患者PD-1/PD-L1 阻斷免疫治療反應(yīng)性的研究
1 材料和方法
1.1 人口統(tǒng)計學(xué)、臨床和病理學(xué)數(shù)據(jù)
1.2 mRNA表達譜和基因拷貝數(shù)變異分析
1.3 體細胞突變數(shù)據(jù)分析
1.4 基因集富集分析
1.5 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果
2.1 膀胱癌中TP53/ RB1 突變與PD-L1 表達的相關(guān)性
2.2 TP53/ RB1 突變促進CD8+ T細胞浸潤并激活T效應(yīng)和干擾素-γ相關(guān)基因表達
2.3 TP53/RB1 突變導(dǎo)致腫瘤突變負荷增加和膀胱癌突變譜的改變
2.4 TP53/RB1 突變對細胞周期調(diào)控、細胞核分裂和DNA損傷與修復(fù)反應(yīng)相關(guān)基因的影響
2.5 TP53、RB1 突變膀胱患者對抗PD-1/ PD-L1 治療顯示出有利的臨床益處
4 討論
5 總結(jié)
第二章 基于PD-L1 表達水平和CD8+T細胞浸潤強度的腫瘤微環(huán)境免疫分型預(yù)測膀胱癌患者PD-1/PD-L1 阻斷免疫治療反應(yīng)性的研究
1 材料和方法
1.1 人口統(tǒng)計學(xué),臨床和病理學(xué)數(shù)據(jù)
1.2 體細胞變異數(shù)據(jù),mRNA表達譜和基因拷貝數(shù)改變分析
1.3 基因集富集分析
1.4 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果
2.1 TMIT Ⅰ型膀胱癌與高體細胞突變負荷相關(guān)
2.2 TMIT Ⅰ(高PD-L1/高CD8A)和TMIT Ⅱ(低PD-L1/低CD8A)的體細胞變異不同
2.3 TMIT Ⅰ分型膀胱癌促進CD8+ T細胞浸潤并激活T淋巴細胞效應(yīng)因子和IFN-γ相關(guān)基因
2.4 TMIT Ⅰ與抗腫瘤免疫相關(guān)信號通路顯著相關(guān)
3 討論
4 總結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻
致謝
學(xué)術(shù)論文和科研成果目錄
本文編號:3764635
【文章頁數(shù)】:44 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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縮略詞說明
中文摘要
英文摘要
第一章 TP53和RB1 基因突變預(yù)測膀胱癌患者PD-1/PD-L1 阻斷免疫治療反應(yīng)性的研究
1 材料和方法
1.1 人口統(tǒng)計學(xué)、臨床和病理學(xué)數(shù)據(jù)
1.2 mRNA表達譜和基因拷貝數(shù)變異分析
1.3 體細胞突變數(shù)據(jù)分析
1.4 基因集富集分析
1.5 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果
2.1 膀胱癌中TP53/ RB1 突變與PD-L1 表達的相關(guān)性
2.2 TP53/ RB1 突變促進CD8+ T細胞浸潤并激活T效應(yīng)和干擾素-γ相關(guān)基因表達
2.3 TP53/RB1 突變導(dǎo)致腫瘤突變負荷增加和膀胱癌突變譜的改變
2.4 TP53/RB1 突變對細胞周期調(diào)控、細胞核分裂和DNA損傷與修復(fù)反應(yīng)相關(guān)基因的影響
2.5 TP53、RB1 突變膀胱患者對抗PD-1/ PD-L1 治療顯示出有利的臨床益處
4 討論
5 總結(jié)
第二章 基于PD-L1 表達水平和CD8+T細胞浸潤強度的腫瘤微環(huán)境免疫分型預(yù)測膀胱癌患者PD-1/PD-L1 阻斷免疫治療反應(yīng)性的研究
1 材料和方法
1.1 人口統(tǒng)計學(xué),臨床和病理學(xué)數(shù)據(jù)
1.2 體細胞變異數(shù)據(jù),mRNA表達譜和基因拷貝數(shù)改變分析
1.3 基因集富集分析
1.4 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果
2.1 TMIT Ⅰ型膀胱癌與高體細胞突變負荷相關(guān)
2.2 TMIT Ⅰ(高PD-L1/高CD8A)和TMIT Ⅱ(低PD-L1/低CD8A)的體細胞變異不同
2.3 TMIT Ⅰ分型膀胱癌促進CD8+ T細胞浸潤并激活T淋巴細胞效應(yīng)因子和IFN-γ相關(guān)基因
2.4 TMIT Ⅰ與抗腫瘤免疫相關(guān)信號通路顯著相關(guān)
3 討論
4 總結(jié)
全文總結(jié)
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本文編號:3764635
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