PPP1R105基因在肝細(xì)胞癌中的表達(dá)相關(guān)信號(hào)通路及其與患者預(yù)后關(guān)系
發(fā)布時(shí)間:2023-03-12 17:39
背景肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是臨床上常見的實(shí)體惡性腫瘤,預(yù)后較差.本文擬采用生物信息學(xué)技術(shù)分析PPP1R105基因在肝細(xì)胞癌中的表達(dá)相關(guān)信號(hào)通路及其與患者預(yù)后關(guān)系.同時(shí),采用免疫組織化學(xué)法對(duì)PPP1R105生物信息數(shù)據(jù)進(jìn)行驗(yàn)證.目的探討PPP1R10基因(Ki-67或MKI67)在HCC中的表達(dá)及其臨床意義.方法在TCGA數(shù)據(jù)中,檢索PPP1R105基因在各個(gè)腫瘤組織中的相對(duì)表達(dá)情況;分析PPP1R105基因在肝細(xì)胞癌組織和癌旁組織中的相對(duì)表達(dá)水平,并比較是否存在差異.應(yīng)用蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫STRING構(gòu)建PPP1R105基因編碼蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò).比較PPP1R105高低表達(dá)組患者無疾病進(jìn)展生存(disease free survival, DFS)和總生存(overall survival, OS)是否存在差異.選取我院手術(shù)治療的原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者81例進(jìn)行回顧性分析,采用免疫組織化學(xué)法檢測肝細(xì)胞癌組織中PPP1R105蛋白表達(dá)情況,并與患者的臨床特征進(jìn)行相關(guān)性分析.結(jié)果PPP1R105基因mRNA在不同腫瘤中表達(dá)水平差異并不顯著,其表達(dá)...
【文章頁數(shù)】:12 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 PPP1R105表達(dá)水平分析:
1.1.2 PPP1R105蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò):
1.1.3 共表達(dá)分析:
1.1.4 生存分析:
1.2 方法
1.2.1 IHC檢測PPP1R105表達(dá):
1.2.2 PPP1R105高低表達(dá)標(biāo)準(zhǔn):
2 結(jié)果
2.1 PPP1R105基因mRNA表達(dá)
2.2 PPP1R105基因蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)
2.3 GO富集
2.4 P P P1R105及其相關(guān)基因KEGG信號(hào)通路富集
2.5 與PPP1R105共表達(dá)基因分析
2.6 生存分析
2.8 PPP1R105蛋白表達(dá)與肝細(xì)胞癌患者特征
3 討論
文章亮點(diǎn)
實(shí)驗(yàn)背景
實(shí)驗(yàn)動(dòng)機(jī)
實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)
實(shí)驗(yàn)方法
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
實(shí)驗(yàn)結(jié)論
展望前景
本文編號(hào):3761658
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0 引言
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 PPP1R105表達(dá)水平分析:
1.1.2 PPP1R105蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò):
1.1.3 共表達(dá)分析:
1.1.4 生存分析:
1.2 方法
1.2.1 IHC檢測PPP1R105表達(dá):
1.2.2 PPP1R105高低表達(dá)標(biāo)準(zhǔn):
2 結(jié)果
2.1 PPP1R105基因mRNA表達(dá)
2.2 PPP1R105基因蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)
2.3 GO富集
2.4 P P P1R105及其相關(guān)基因KEGG信號(hào)通路富集
2.5 與PPP1R105共表達(dá)基因分析
2.6 生存分析
2.8 PPP1R105蛋白表達(dá)與肝細(xì)胞癌患者特征
3 討論
文章亮點(diǎn)
實(shí)驗(yàn)背景
實(shí)驗(yàn)動(dòng)機(jī)
實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)
實(shí)驗(yàn)方法
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
實(shí)驗(yàn)結(jié)論
展望前景
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