PPP1R105基因在肝細胞癌中的表達相關(guān)信號通路及其與患者預(yù)后關(guān)系
發(fā)布時間:2023-03-12 17:39
背景肝細胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是臨床上常見的實體惡性腫瘤,預(yù)后較差.本文擬采用生物信息學(xué)技術(shù)分析PPP1R105基因在肝細胞癌中的表達相關(guān)信號通路及其與患者預(yù)后關(guān)系.同時,采用免疫組織化學(xué)法對PPP1R105生物信息數(shù)據(jù)進行驗證.目的探討PPP1R10基因(Ki-67或MKI67)在HCC中的表達及其臨床意義.方法在TCGA數(shù)據(jù)中,檢索PPP1R105基因在各個腫瘤組織中的相對表達情況;分析PPP1R105基因在肝細胞癌組織和癌旁組織中的相對表達水平,并比較是否存在差異.應(yīng)用蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫STRING構(gòu)建PPP1R105基因編碼蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò).比較PPP1R105高低表達組患者無疾病進展生存(disease free survival, DFS)和總生存(overall survival, OS)是否存在差異.選取我院手術(shù)治療的原發(fā)性肝細胞癌患者81例進行回顧性分析,采用免疫組織化學(xué)法檢測肝細胞癌組織中PPP1R105蛋白表達情況,并與患者的臨床特征進行相關(guān)性分析.結(jié)果PPP1R105基因mRNA在不同腫瘤中表達水平差異并不顯著,其表達...
【文章頁數(shù)】:12 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 PPP1R105表達水平分析:
1.1.2 PPP1R105蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò):
1.1.3 共表達分析:
1.1.4 生存分析:
1.2 方法
1.2.1 IHC檢測PPP1R105表達:
1.2.2 PPP1R105高低表達標(biāo)準(zhǔn):
2 結(jié)果
2.1 PPP1R105基因mRNA表達
2.2 PPP1R105基因蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)
2.3 GO富集
2.4 P P P1R105及其相關(guān)基因KEGG信號通路富集
2.5 與PPP1R105共表達基因分析
2.6 生存分析
2.8 PPP1R105蛋白表達與肝細胞癌患者特征
3 討論
文章亮點
實驗背景
實驗動機
實驗?zāi)繕?biāo)
實驗方法
實驗結(jié)果
實驗結(jié)論
展望前景
本文編號:3761658
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0 引言
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 PPP1R105表達水平分析:
1.1.2 PPP1R105蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò):
1.1.3 共表達分析:
1.1.4 生存分析:
1.2 方法
1.2.1 IHC檢測PPP1R105表達:
1.2.2 PPP1R105高低表達標(biāo)準(zhǔn):
2 結(jié)果
2.1 PPP1R105基因mRNA表達
2.2 PPP1R105基因蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)
2.3 GO富集
2.4 P P P1R105及其相關(guān)基因KEGG信號通路富集
2.5 與PPP1R105共表達基因分析
2.6 生存分析
2.8 PPP1R105蛋白表達與肝細胞癌患者特征
3 討論
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實驗背景
實驗動機
實驗?zāi)繕?biāo)
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實驗結(jié)論
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