以泰山紅石榴果實(shí)為試驗(yàn)材料,利用逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)技術(shù)擴(kuò)增出980 bp大小的中間片段,用3’c DNA末端快速擴(kuò)增PCR(RACE PCR)獲得DHQ/SDH基因的3’端,拼接后獲得1 585 bp的c DNA片段。結(jié)果表明,該基因含有1 265 bp編碼序列(CDS),編碼421個(gè)氨基酸,其氨基酸序列與蘋果(注冊(cè)號(hào):XP₀08370537.1)、葡萄(注冊(cè)號(hào):XP₀02270232.1)、白梨(注冊(cè)號(hào):XP₀09335660.1)的同源性分別為82%、84%、82%;蛋白質(zhì)理論分子質(zhì)量為133 682.2 u,等電點(diǎn)為5.01,含量最豐富的氨基酸是丙氨酸(Ala)、半胱氨酸(Cys)、甘氨酸(Gly)、蘇氨酸(Thr),具有DHQase I、SDH(Aro E)2個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,為親水性蛋白;二級(jí)結(jié)構(gòu)主要由無(wú)規(guī)則卷曲(31.12%)、α-螺旋(30.17%)、伸展鏈(24.94%)和β-轉(zhuǎn)角(13.78%)組成;Gen Bank登錄號(hào)為KU133479。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 試驗(yàn)方法
        1.2.1 總RNA提取和c DNA第1鏈的合成
        1.2.2 基因中間片段的克隆
        1.2.3 3'c DNA末端快速擴(kuò)增PCR(RACE PCR)獲得基因的3'端序列
        1.2.4 DHQ/SDH基因的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 石榴果皮DHQ/SDH基因保守片段的克隆
    2.2 石榴果皮DHQ/SDH基因3'端序列的克隆
    2.3 DHQ/SDH基因的生物信息學(xué)分析
        2.3.1 DHQ/SDH基因編碼蛋白的理化性質(zhì)、疏/親水性分析
        2.3.2 DHQ/SDH基因編碼蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析
3 討論與結(jié)論



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