兩個裸燕麥品種AsCSLH基因的克隆及差異分析
發(fā)布時間:2023-02-25 19:07
本研究通過對24份裸燕麥品種籽粒的β-葡聚糖含量數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選,得到兩個β-葡聚糖含量差異顯著的品種,克隆得到這兩個品種的β-葡聚糖合成酶(AsCSLH)基因,并對這兩個品種中AsCSLH基因的序列進(jìn)行差異分析及生物信息學(xué)分析。主要結(jié)果如下:1、24份裸燕麥品種中β-葡聚糖含量在2.5%-7.0%。其中β-葡聚糖含量最低的品種為:‘花早2號’;β-葡聚糖含量最高的品種為:‘內(nèi)莜6號’。2、克隆得到裸燕麥品種‘花早2號’AsCSLH基因cDNA全長為2277bp,AsCSLH基因gDNA全長為2953bp,由7個外顯子和6個內(nèi)含子組成‘內(nèi)莜6號’的AsCSLH基因cDNA全長為2277bp,AsCSLH基因gDNA全長為2953bp,由7個外顯子和6個內(nèi)含子組成;生物信息學(xué)分析,兩個基因序列一致。3、裸燕麥AaCSLH基因共編碼758個氨基酸,預(yù)測是一個理論等電點(diǎn)為6.8,分子量為83.15kD,具有6個跨膜結(jié)構(gòu)域且無信號肽的親水性蛋白,其二級結(jié)構(gòu)以α-螺旋(Hh)為主,三級結(jié)構(gòu)預(yù)測與二級結(jié)構(gòu)相符。4、裸燕麥AsCSLH基因編碼的氨基酸序列與水稻進(jìn)化關(guān)系最遠(yuǎn),同源性為63%;與大麥進(jìn)化關(guān)系...
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
1.1 燕麥簡介
1.2 燕麥的價值
1.3 燕麥中的β-葡聚糖
1.4 燕麥β-葡聚糖的價值
1.5 燕麥β-葡聚糖含量影響因素
1.6 燕麥β-葡聚糖合成機(jī)制
1.7 β-葡聚糖合成相關(guān)酶類基因
1.8 研究目的及意義
2 材料與方法
2.1 供試材料及處理
2.1.1 供試材料
2.1.2 樣品處理
2.2 主要藥品、試劑
2.3 重要儀器設(shè)備
2.4 β-葡聚糖含量檢測
2.5 引物設(shè)計與合成
2.6 燕麥總DNA提取及檢測
2.7 燕麥葉片中總RNA的提取及檢測
2.8 cDNA的獲取
2.9 裸燕麥AsCSLH基因的擴(kuò)增
2.9.1 ‘內(nèi)莜6號'AsCSLH基因cDNA全長和gDNA全長序列的擴(kuò)增
2.9.2 ‘花早2號'AsCSLH基因cDNA全長和gDNA全長序列的擴(kuò)增
2.10 燕麥AsCSLH基因的生物信息學(xué)分析
2.10.1 多序列比對及序列同源性分析
2.10.2 蛋白質(zhì)基本性質(zhì)分析
2.10.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
2.10.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
3 結(jié)果與分析
3.1 試驗品種的篩選
3.2 總RNA的檢測結(jié)果
3.3 ‘內(nèi)莜6號’AsCSLH基因的克隆及序列分析
3.3.1 ‘內(nèi)莜6號’AsCSLH基因cDNA全場序列的擴(kuò)增
3.3.2 ‘內(nèi)莜6號’AsCSLH基因gDNA全長序列的擴(kuò)增
3.3.3 ‘內(nèi)莜6號’AsCSLH基因的序列分析
3.4 ‘花早2號’AsCSLH基因的克隆及序列分析
3.4.1 ‘花早2號’AsCSLH基因cDNA全場序列的擴(kuò)增
3.4.2 ‘花早2號’AsCSLH基因gDNA全長序列的擴(kuò)增
3.4.3 ‘花早2號’AsCSLH基因的序列分析
3.5 兩個品種之間AsCSLH基因的比對分析
3.6 燕麥AsCSLH基因編碼蛋白質(zhì)分析
3.6.1 燕麥AsCSLH基因編碼蛋白質(zhì)的性質(zhì)與結(jié)構(gòu)分析
3.6.2 CSLH基因編碼氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
4 討論
4.1 裸燕麥籽粒中β-葡聚糖的分布
4.2 影響燕麥籽粒中β-葡聚糖含量的因素
4.2.1 環(huán)境因素的影響
4.2.2 遺傳因子的影響
4.2.3 β-葡聚糖合成機(jī)制中的影響
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
作者簡介
本文編號:3749026
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
Abstract
1 引言
1.1 燕麥簡介
1.2 燕麥的價值
1.3 燕麥中的β-葡聚糖
1.4 燕麥β-葡聚糖的價值
1.5 燕麥β-葡聚糖含量影響因素
1.6 燕麥β-葡聚糖合成機(jī)制
1.7 β-葡聚糖合成相關(guān)酶類基因
1.8 研究目的及意義
2 材料與方法
2.1 供試材料及處理
2.1.1 供試材料
2.1.2 樣品處理
2.2 主要藥品、試劑
2.3 重要儀器設(shè)備
2.4 β-葡聚糖含量檢測
2.5 引物設(shè)計與合成
2.6 燕麥總DNA提取及檢測
2.7 燕麥葉片中總RNA的提取及檢測
2.8 cDNA的獲取
2.9 裸燕麥AsCSLH基因的擴(kuò)增
2.9.1 ‘內(nèi)莜6號'AsCSLH基因cDNA全長和gDNA全長序列的擴(kuò)增
2.9.2 ‘花早2號'AsCSLH基因cDNA全長和gDNA全長序列的擴(kuò)增
2.10 燕麥AsCSLH基因的生物信息學(xué)分析
2.10.1 多序列比對及序列同源性分析
2.10.2 蛋白質(zhì)基本性質(zhì)分析
2.10.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
2.10.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
3 結(jié)果與分析
3.1 試驗品種的篩選
3.2 總RNA的檢測結(jié)果
3.3 ‘內(nèi)莜6號’AsCSLH基因的克隆及序列分析
3.3.1 ‘內(nèi)莜6號’AsCSLH基因cDNA全場序列的擴(kuò)增
3.3.2 ‘內(nèi)莜6號’AsCSLH基因gDNA全長序列的擴(kuò)增
3.3.3 ‘內(nèi)莜6號’AsCSLH基因的序列分析
3.4 ‘花早2號’AsCSLH基因的克隆及序列分析
3.4.1 ‘花早2號’AsCSLH基因cDNA全場序列的擴(kuò)增
3.4.2 ‘花早2號’AsCSLH基因gDNA全長序列的擴(kuò)增
3.4.3 ‘花早2號’AsCSLH基因的序列分析
3.5 兩個品種之間AsCSLH基因的比對分析
3.6 燕麥AsCSLH基因編碼蛋白質(zhì)分析
3.6.1 燕麥AsCSLH基因編碼蛋白質(zhì)的性質(zhì)與結(jié)構(gòu)分析
3.6.2 CSLH基因編碼氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
4 討論
4.1 裸燕麥籽粒中β-葡聚糖的分布
4.2 影響燕麥籽粒中β-葡聚糖含量的因素
4.2.1 環(huán)境因素的影響
4.2.2 遺傳因子的影響
4.2.3 β-葡聚糖合成機(jī)制中的影響
5 結(jié)論
致謝
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本文編號:3749026
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