馬鈴薯（Solanum tuberosum L.）地下塊莖所含營養(yǎng)物質(zhì)豐富,具有很高的食用價值,是僅次于水稻、小麥和玉米的世界第四大糧食作物。本課題在前期的研究基礎(chǔ)上,利用RNA-seq技術(shù)得到的轉(zhuǎn)錄組SNP位點開發(fā)SNP標(biāo)記并篩選差異表達基因,對短日照條件下馬鈴薯試管薯形成能力相關(guān)的主效QTL區(qū)段MT05進行SNP標(biāo)記加密,進一步縮小其遺傳置信區(qū)間。同時,對主效QTL區(qū)段內(nèi)的候選基因進行表達驗證與篩選,確定影響試管薯形成的關(guān)鍵候選基因。主要研究結(jié)果如下:1、基于BSA RNA-seq數(shù)據(jù),本研究挑選了464個SNP位點用于群體基因分型,并依據(jù)SNP劑量信息模型和四倍體作圖軟件成功構(gòu)建了第V號染色體MT05區(qū)段的雙親整合遺傳連鎖圖譜,圖譜全長42.07cM,包含193個SNP標(biāo)記,平均標(biāo)記間距0.22cM,包含了雙親的全部8條同源染色體。2、結(jié)合MTI群體的試管薯形成數(shù)據(jù),本研究在新的整合圖譜上進行QTL定位。結(jié)果顯示2014年的表型數(shù)據(jù)定位到的QTL的LOD峰值位于14 cM處,其one-LOD置信區(qū)間為13-18 cM;2016年的表型數(shù)據(jù)定位到的QTL的LOD峰值位于32 cM處... 

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【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略詞表
第一章 前言
    1.1 馬鈴薯的種植及影響
    1.2 多因素調(diào)控馬鈴薯塊莖形成發(fā)育
        1.2.1 溫度對馬鈴薯塊莖形成的影響
        1.2.2 蔗糖濃度對馬鈴薯試管薯形成的影響
        1.2.3 光周期對馬鈴薯塊莖發(fā)育的調(diào)控
    1.3 馬鈴薯塊莖發(fā)育的遺傳調(diào)控
    1.4 試管薯的形成和優(yōu)勢
    1.5 課題提出
第二章 SNP標(biāo)記加密及QTL定位
    2.1 材料與方法
        2.1.1 植物材料
        2.1.2 差異SNP位點挑選原則
        2.1.3 F1代分離群體SNP標(biāo)記檢測及基因型分析
        2.1.4 遺傳連鎖圖鐠構(gòu)建及試管薯形成QTL定位分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 MTI群體遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
        2.2.2 試管薯形成QTL定位
        2.2.3 標(biāo)記與表型的關(guān)聯(lián)分析
        2.2.4 QTL區(qū)間對應(yīng)物理位置的進一步確認(rèn)
第三章試管薯形成相關(guān)基因的篩選和鑒定
    3.1 材料與方法
        3.1.1 供試材料及處理方法
        3.1.2 Trizol法提取植物總RNA
        3.1.3 RNA樣品質(zhì)量檢測及反轉(zhuǎn)錄
        3.1.4 樣品不同時間點混樣的定量檢測
        3.1.5 熒光定量PCR
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 不同基因型材料不同基因型材料光周期誘導(dǎo)結(jié)薯的表型鑒定
        3.2.2 馬鈴薯試管薯短日照塊莖形成候選基因定量表達檢測
第四章 討論
    4.1 主效區(qū)段SNP標(biāo)記及QTL定位
    4.2 候選基因篩選
    4.3 研究展望
參考文獻
附錄
    附錄A SNP標(biāo)記位點及引物
    附表B 基因定量表達引物
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]蔗糖調(diào)節(jié)馬鈴薯塊莖形成機制的研究進展[J]. 鞏慧玲,孫夢遙,馮再平,袁惠君.  中國蔬菜. 2016(03)
[2]馬鈴薯產(chǎn)業(yè)的現(xiàn)狀與發(fā)展[J]. 謝從華.  華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(社會科學(xué)版). 2012(01)
[3]我國馬鈴薯生產(chǎn)發(fā)展綜述[J]. 魏俊杰.  吉林農(nóng)業(yè). 2011(02)
[4]馬鈴薯試管薯誘導(dǎo)影響因子的研究[J]. 劉尚前,袁丁,張鳳英,栗占芳.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(21)
[5]馬鈴薯class Ⅰ patatin基因在試管塊莖形成中的功能[J]. 司懷軍,柳俊,謝從華.  作物學(xué)報. 2006(09)
[6]植物體中的糖信號及其轉(zhuǎn)導(dǎo)機制[J]. 單守明,董曉穎,王永章,劉成連,原永兵.  中國農(nóng)學(xué)通報. 2004(03)
[7]園藝植物高溫逆境生理研究進展[J]. 范雙喜,谷建田,韓瑩琰.  北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報. 2003(02)
[8]植物超氧化物歧化酶（SOD）的研究進展[J]. 馬旭俊,朱大海.  遺傳. 2003(02)
[9]分子遺傳標(biāo)記類型及其在作物種質(zhì)資源研究上的應(yīng)用[J]. 王金英,江川.  福建稻麥科技. 2002(03)
[10]馬鈴薯塊莖發(fā)育機理及其基因表達[J]. 柳俊,謝從華.  植物學(xué)通報. 2001(05)

博士論文
[1]馬鈴薯（Solanum tuberosum L.）試管塊莖形成的QTL定位及遺傳分析[D]. 周俊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014

碩士論文
[1]馬鈴薯（Solanum tuberosum L.）試管薯形成相關(guān)SNP標(biāo)記的開發(fā)與QTL分析[D]. 楊艷佩.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



本文編號：3730147