目的基于數(shù)據(jù)庫(kù)篩選胃癌相關(guān)差異表達(dá)基因,分析胃癌相關(guān)差異表達(dá)基因的生物學(xué)功能及相關(guān)信號(hào)通路,探索胃癌相關(guān)核心差異表達(dá)基因與胃癌預(yù)后的關(guān)系。方法從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)選取胃癌相關(guān)基因芯片GSE79973、GSE54129,應(yīng)用GEO2R分別篩選出兩組芯片胃癌組織與正常胃黏膜組織的差異表達(dá)基因,取交集后得到共有差異表達(dá)基因。應(yīng)用DAVID對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行生物學(xué)功能及信號(hào)通路分析。采用STRING構(gòu)建差異表達(dá)基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò),應(yīng)用Cytoscape軟件的MCODE插件篩選胃癌相關(guān)核心差異表達(dá)基因。對(duì)核心差異表達(dá)基因與胃癌預(yù)后的關(guān)系進(jìn)行分析。結(jié)果相對(duì)于正常胃黏膜組織,胃癌組織差異表達(dá)基因共164個(gè),其中42個(gè)上調(diào)、122個(gè)下調(diào),主要存在于胞外區(qū)、蛋白細(xì)胞外基質(zhì)、細(xì)胞外基質(zhì)、細(xì)胞外外泌體等部位,主要涉及細(xì)胞外基質(zhì)受體相互作用、局部黏附、蛋白質(zhì)消化和吸收、細(xì)胞色素P450代謝等相關(guān)通路。初步篩選出13個(gè)胃癌相關(guān)核心基因（COL1A2、BGN、THBS2、FN1、THBS1、COL1A1、COL4A1、SPARC、COL11A1、COL6A3、COL12A1、TIMP1、SPP1）,除THBS1外,其余1... 

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 胃癌相關(guān)基因芯片基本信息與質(zhì)量分析
    1.2 兩組差異表達(dá)基因篩選
    1.3 胃癌差異表達(dá)基因生物學(xué)功能與信號(hào)通路分析
    1.4 胃癌相關(guān)核心基因的篩選
    1.5 胃癌預(yù)后相關(guān)基因分析
2 結(jié)果
    2.1 胃癌組織與正常胃黏膜組織差異表達(dá)基因
    2.2 胃癌相關(guān)差異表達(dá)基因生物學(xué)功能與信號(hào)通路
    2.3 胃癌相關(guān)核心差異表達(dá)基因
    2.4 胃癌相關(guān)核心差異表達(dá)基因與胃癌預(yù)后的關(guān)系
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3727430