玉米矮稈基因d15和d78的克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-10-21 13:39
20世紀(jì)60年代,綠色革命基因sd1和Rht1的發(fā)掘?qū)τ谌蜃魑锇N具有重要的推動(dòng)作用。玉米br2基因能有效降低株高,已在育種中成功應(yīng)用。因此,發(fā)掘新的玉米矮稈資源,對(duì)玉米矮化育種具有重要意義。本課題組發(fā)現(xiàn)2份玉米矮稈突變體K15d和K78d,前期研究表明均具有矮稈高產(chǎn)育種潛力,其矮稈基因d15和d78與br2等位。本研究對(duì)2個(gè)矮稈基因進(jìn)行克隆和表達(dá)分析,為進(jìn)一步研究其矮化機(jī)制和應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1、參考Br2基因序列設(shè)計(jì)7對(duì)特異性引物,利用PCR技術(shù)對(duì)d15基因分段擴(kuò)增,測(cè)序后經(jīng)DNAMAN軟件拼接發(fā)現(xiàn),d15基因由5個(gè)外顯子和4個(gè)內(nèi)含子組成,其中第五外顯子5485bp到5685bp間缺失200bp,編碼區(qū)全長(zhǎng)3983bp,編碼1326個(gè)氨基酸,是一個(gè)新的br2等位基因。生物信息學(xué)分析表明,與野生型K15比較,突變體K15d中d15編碼蛋白只有10個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,缺失了2個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,并且二級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,第二個(gè)保守功能域NBD缺失,影響了底物的結(jié)合和轉(zhuǎn)運(yùn)功能。d15啟動(dòng)子序列為1091bp,該區(qū)域含有光響應(yīng)、激素響應(yīng)及脅迫誘導(dǎo)等相關(guān)順式作用元件,與Br2僅有2個(gè)SN...
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
中英文縮寫對(duì)照
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 作物矮稈基因研究進(jìn)展
1.2 玉米br2基因的研究與應(yīng)用
1.2.1 玉米br2基因的研究
1.2.2 玉米br2基因的應(yīng)用
1.3 植物矮化機(jī)理研究
1.3.1 赤霉素生物合成途徑與株高調(diào)控
1.3.2 生長(zhǎng)素極性運(yùn)輸?shù)恼{(diào)控
1.4 植物啟動(dòng)子的研究
1.4.1 植物啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)及特征
1.4.2 啟動(dòng)子區(qū)突變的研究進(jìn)展
1.5 植物基因克隆的方法
1.5.1 同源克隆
1.5.2 圖位克隆
1.5.3 轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽克隆
1.5.4 表型克隆
1.6 研究?jī)?nèi)容及目的意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料和主要試劑
2.1.1 供試材料
2.1.2 主要試劑及儀器
2.1.3 相關(guān)試劑的配制
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 基因同源克隆
2.2.2 生物信息學(xué)分析
2.2.3 基因表達(dá)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 基因克隆及序列比對(duì)
3.1.1 矮稈基因d15
3.1.2 矮稈基因d78
3.2 生物信息學(xué)預(yù)測(cè)分析
3.2.1 d15基因的預(yù)測(cè)
3.2.2 d78基因的預(yù)測(cè)
3.3 基因表達(dá)分析
3.3.1 總RNA濃度與純度檢測(cè)
3.3.2 d15基因的表達(dá)
3.3.3 d78基因的表達(dá)
4 討論與結(jié)論
4.1 d15和d78基因的序列比較
4.2 d15和d78基因的功能分析
4.3 d15和d78基因的表達(dá)分析
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
作者簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥Rht矮稈基因研究和應(yīng)用綜述[J]. 鐘明志,魏淑紅,彭正松,楊在君. 分子植物育種. 2018(20)
[2]中國(guó)水稻遺傳育種歷程與展望[J]. 吳比,胡偉,邢永忠. 遺傳. 2018(10)
[3]玉米矮桿基因研究進(jìn)展[J]. 王文秀,王磊. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(11)
[4]植物AUX/IAA基因家族研究進(jìn)展[J]. 李俊男,燕曉杰,李樞航,張榮沭. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2018(15)
[5]作物基因組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 唐丁,呂慧穎,王玨,葛毅強(qiáng),魏珣,楊維才,程祝寬. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2018(03)
[6]玉米育種行業(yè)創(chuàng)新現(xiàn)狀與發(fā)展趨勢(shì)[J]. 趙久然,王帥,李明,呂慧穎,王道文,葛毅強(qiáng),魏珣,楊維才. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2018(03)
[7]高等植物啟動(dòng)子研究概述[J]. 楊鵬芳,段國(guó)琴,胡曉煒,繆秀梅,南淑珍,張麗靜. 分子植物育種. 2018(05)
[8]甘藍(lán)型油菜BnGS3和BnGhd7的同源克隆及其與油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀的關(guān)系[J]. 薛志飛,王夏,李付鵬,馬朝芝. 作物學(xué)報(bào). 2018(02)
[9]黃淮麥區(qū)小麥種質(zhì)資源矮稈基因分布及其與農(nóng)藝性狀的關(guān)系[J]. 周曉變,趙磊,陳建輝,陽(yáng)霞,王永彥,張香粉,閆雪芳,董中東,崔黨群,陳鋒. 麥類作物學(xué)報(bào). 2017(08)
[10]玉米ZmPGP1基因啟動(dòng)子的克隆及結(jié)構(gòu)功能分析[J]. 葉凌鳳,劉琳,張志高,徐啟來(lái),王俊仁,康定明. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(03)
博士論文
[1]玉米行粒數(shù)主效QTL KERNEL NUMBER PER ROW6(KNR6)的克隆與功能解析[D]. 賈海濤.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]玉米株高主效QTL-qph1及ys基因及其修飾因子ys-modifier的克隆、功能驗(yàn)證及機(jī)理研究[D]. 邢安琪.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]新型玉米矮化突變位點(diǎn)的鑒定及其功能分析[D]. 葉凌鳳.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]玉米矮稈基因Dt和壞死基因nec-t的圖位克隆與功能分析[D]. 王立靜.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]簇毛麥(Dasypyrum villosum)矮化突變體鑒定及矮化機(jī)理初步研究[D]. 蔡鵬.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]兩個(gè)水稻株高突變體變異機(jī)制的研究[D]. 張所兵.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]玉米紅軸基因C(t)和矮稈基因d125的克隆及表達(dá)分析[D]. 李開兵.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]玉米矮稈突變體的矮化效應(yīng)及主要性狀配合力研究[D]. 王攀.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]玉米矮稈突變體的等位性鑒定及對(duì)外源激素的敏感性研究[D]. 何少勇.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]枇杷赤霉素代謝途徑關(guān)鍵酶基因的克隆及表達(dá)初步分析[D]. 李華.西南大學(xué) 2017
[5]玉米zma-miR528對(duì)淹水脅迫響應(yīng)的順反調(diào)控機(jī)理研究[D]. 趙蝶.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[6]淹水脅迫下玉米幼苗的轉(zhuǎn)錄組分析及耐漬候選基因克隆[D]. 耿存娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[7]多肽TAP親和活性預(yù)測(cè)與分子模擬研究[D]. 潘顯超.重慶大學(xué) 2013
[8]新型特矮稻基因定位和赤霉素代謝關(guān)鍵酶基因表達(dá)分析[D]. 梅進(jìn).湖南大學(xué) 2009
[9]水稻半矮稈基因sdt2的克隆研究[D]. 胡靜.揚(yáng)州大學(xué) 2007
本文編號(hào):3695753
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
中英文縮寫對(duì)照
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 作物矮稈基因研究進(jìn)展
1.2 玉米br2基因的研究與應(yīng)用
1.2.1 玉米br2基因的研究
1.2.2 玉米br2基因的應(yīng)用
1.3 植物矮化機(jī)理研究
1.3.1 赤霉素生物合成途徑與株高調(diào)控
1.3.2 生長(zhǎng)素極性運(yùn)輸?shù)恼{(diào)控
1.4 植物啟動(dòng)子的研究
1.4.1 植物啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)及特征
1.4.2 啟動(dòng)子區(qū)突變的研究進(jìn)展
1.5 植物基因克隆的方法
1.5.1 同源克隆
1.5.2 圖位克隆
1.5.3 轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽克隆
1.5.4 表型克隆
1.6 研究?jī)?nèi)容及目的意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料和主要試劑
2.1.1 供試材料
2.1.2 主要試劑及儀器
2.1.3 相關(guān)試劑的配制
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 基因同源克隆
2.2.2 生物信息學(xué)分析
2.2.3 基因表達(dá)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 基因克隆及序列比對(duì)
3.1.1 矮稈基因d15
3.1.2 矮稈基因d78
3.2 生物信息學(xué)預(yù)測(cè)分析
3.2.1 d15基因的預(yù)測(cè)
3.2.2 d78基因的預(yù)測(cè)
3.3 基因表達(dá)分析
3.3.1 總RNA濃度與純度檢測(cè)
3.3.2 d15基因的表達(dá)
3.3.3 d78基因的表達(dá)
4 討論與結(jié)論
4.1 d15和d78基因的序列比較
4.2 d15和d78基因的功能分析
4.3 d15和d78基因的表達(dá)分析
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
作者簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥Rht矮稈基因研究和應(yīng)用綜述[J]. 鐘明志,魏淑紅,彭正松,楊在君. 分子植物育種. 2018(20)
[2]中國(guó)水稻遺傳育種歷程與展望[J]. 吳比,胡偉,邢永忠. 遺傳. 2018(10)
[3]玉米矮桿基因研究進(jìn)展[J]. 王文秀,王磊. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(11)
[4]植物AUX/IAA基因家族研究進(jìn)展[J]. 李俊男,燕曉杰,李樞航,張榮沭. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2018(15)
[5]作物基因組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 唐丁,呂慧穎,王玨,葛毅強(qiáng),魏珣,楊維才,程祝寬. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2018(03)
[6]玉米育種行業(yè)創(chuàng)新現(xiàn)狀與發(fā)展趨勢(shì)[J]. 趙久然,王帥,李明,呂慧穎,王道文,葛毅強(qiáng),魏珣,楊維才. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2018(03)
[7]高等植物啟動(dòng)子研究概述[J]. 楊鵬芳,段國(guó)琴,胡曉煒,繆秀梅,南淑珍,張麗靜. 分子植物育種. 2018(05)
[8]甘藍(lán)型油菜BnGS3和BnGhd7的同源克隆及其與油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀的關(guān)系[J]. 薛志飛,王夏,李付鵬,馬朝芝. 作物學(xué)報(bào). 2018(02)
[9]黃淮麥區(qū)小麥種質(zhì)資源矮稈基因分布及其與農(nóng)藝性狀的關(guān)系[J]. 周曉變,趙磊,陳建輝,陽(yáng)霞,王永彥,張香粉,閆雪芳,董中東,崔黨群,陳鋒. 麥類作物學(xué)報(bào). 2017(08)
[10]玉米ZmPGP1基因啟動(dòng)子的克隆及結(jié)構(gòu)功能分析[J]. 葉凌鳳,劉琳,張志高,徐啟來(lái),王俊仁,康定明. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(03)
博士論文
[1]玉米行粒數(shù)主效QTL KERNEL NUMBER PER ROW6(KNR6)的克隆與功能解析[D]. 賈海濤.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]玉米株高主效QTL-qph1及ys基因及其修飾因子ys-modifier的克隆、功能驗(yàn)證及機(jī)理研究[D]. 邢安琪.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]新型玉米矮化突變位點(diǎn)的鑒定及其功能分析[D]. 葉凌鳳.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]玉米矮稈基因Dt和壞死基因nec-t的圖位克隆與功能分析[D]. 王立靜.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]簇毛麥(Dasypyrum villosum)矮化突變體鑒定及矮化機(jī)理初步研究[D]. 蔡鵬.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]兩個(gè)水稻株高突變體變異機(jī)制的研究[D]. 張所兵.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]玉米紅軸基因C(t)和矮稈基因d125的克隆及表達(dá)分析[D]. 李開兵.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]玉米矮稈突變體的矮化效應(yīng)及主要性狀配合力研究[D]. 王攀.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]玉米矮稈突變體的等位性鑒定及對(duì)外源激素的敏感性研究[D]. 何少勇.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]枇杷赤霉素代謝途徑關(guān)鍵酶基因的克隆及表達(dá)初步分析[D]. 李華.西南大學(xué) 2017
[5]玉米zma-miR528對(duì)淹水脅迫響應(yīng)的順反調(diào)控機(jī)理研究[D]. 趙蝶.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[6]淹水脅迫下玉米幼苗的轉(zhuǎn)錄組分析及耐漬候選基因克隆[D]. 耿存娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[7]多肽TAP親和活性預(yù)測(cè)與分子模擬研究[D]. 潘顯超.重慶大學(xué) 2013
[8]新型特矮稻基因定位和赤霉素代謝關(guān)鍵酶基因表達(dá)分析[D]. 梅進(jìn).湖南大學(xué) 2009
[9]水稻半矮稈基因sdt2的克隆研究[D]. 胡靜.揚(yáng)州大學(xué) 2007
本文編號(hào):3695753
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