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全外顯子組測序技術(shù)鑒定1個Olmsted綜合征家系的致病基因和4個表皮松解性掌跖角化癥家系的KRT9基因突變譜分析及產(chǎn)前

發(fā)布時間:2022-10-19 14:18
  背景:(1)Olmsted 綜合征(Olmsted syndrome OMIM:#614594)是一種罕見的以殘毀性掌趾角化和腔口周圍角化斑兩個特征性皮損為主要臨床特征的先天性皮膚病。其他臨床表現(xiàn)還包括彌漫性脫發(fā)、甲營養(yǎng)不良、口腔黏膜白斑、指跖的縮窄等。已發(fā)現(xiàn)的Olmsted綜合征致病基因包括TRPV3、MBTPS2等。(2)表皮松解性掌跖角化癥(epidermolyticpalmoplantarkeratoderma,EPPKOMIM:#144200)為一種較為常見的常染色體顯性遺傳性皮膚病,臨床表現(xiàn)為掌跖皮膚呈彌漫性的角質(zhì)增厚,主要由KRT9、KRT1等基因的突變造成。目的:(1)用全外顯子組測序技術(shù)(whole exome sequencing,WES)尋找一個疑似Olmsted綜合征家系的致病基因突變,為家系的臨床確診和可能的發(fā)病分子機制提供資料,并為該家系的后續(xù)產(chǎn)前DNA診斷、植入前遺傳學(xué)診斷(preimplantation genetic diagnosis,PGD)等奠定基礎(chǔ)。(2)繪制 4 個 EPPK 家系的致病基因突變譜。在明確致病基因突變后,應(yīng)其中3個家系的請求,... 

【文章頁數(shù)】:89 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
致謝
摘要
ABSTRACT
英文縮略詞
第一部分 全外顯子組測序技術(shù)鑒定1個Olmsted綜合征家系的致病基因
    1 引言
        1.1 Olmsted綜合征及其分子遺傳學(xué)研究
            1.1.1 Olmsted綜合征的臨床特征
            1.1.2 Olmsted綜合征的分子遺傳學(xué)
            1.1.3 Olmsted綜合征與其他PPK的鑒別診斷
        1.2 全外顯子組測序技術(shù)
            1.2.1 全外顯子組測序技術(shù)簡介
            1.2.2 全外顯子組測序技術(shù)的優(yōu)勢及挑戰(zhàn)
            1.2.3 全外顯子組測序技術(shù)在孟德爾病中的應(yīng)用
    2 實驗材料與方法
        2.1 主要溶液和試劑
        2.2 主要儀器
        2.3 相關(guān)搜索網(wǎng)站及軟件
        2.4 實驗方法
            2.4.1 Olmsted綜合征家系的收集
            2.4.2 基因組DNA的提取和純化
            2.4.3 PCR擴增KRT9和KRT1基因的編碼區(qū)
            2.4.4 Sanger DNA測序
            2.4.5 全外顯子組測序
            2.4.6 全外顯子組測序數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)分析
            2.4.7 基因變異體的Sanger DNA測序驗證
    3 實驗結(jié)果
        3.1 EPPK相關(guān)致病基因突變的排除
        3.2 全外顯子組測序?qū)ふ抑虏』虻慕Y(jié)果
            3.2.1 WES的質(zhì)量
            3.2.2 WES所發(fā)現(xiàn)的突變
        3.3 KRT10及TRPV3基因突變的驗證
    4 討論
    5 結(jié)論
    參考文獻
第二部分 4個EPPK家系的KRT9基因突變譜分析及產(chǎn)前DNA診斷
    1 掌跖角化癥概述
        1.1 掌跖角化癥和表皮松解性掌跖角化癥(EPPK)
        1.2 角蛋白
        1.3 EPPK的致病基因
        1.4 產(chǎn)前DNA診斷在EPPK中的應(yīng)用
    2 實驗材料與方法
        2.1 EPPK家系的收集
        2.2 基因組DNA的純化及PCR擴增KRT9基因編碼區(qū)
        2.3 正、反向Sanger DNA測序
        2.4 AS-PCR驗證KRT9基因突變
        2.5 基于已知DNA致病突變的EPPK高風(fēng)險胎兒的產(chǎn)前DNA診斷
    3 實驗結(jié)果
        3.1 正、反向Sanger測序的結(jié)果
        3.2 AS-PCR驗證KRT9基因突變的結(jié)果
        3.3 胎兒產(chǎn)前DNA診斷正、反向Sanger測序的結(jié)果
    4 討論
    5 結(jié)論
    參考文獻
綜述
    參考文獻
個人簡介及碩士學(xué)習(xí)期間發(fā)表的論文


【參考文獻】:
期刊論文
[1]Olmsted綜合征一例及文獻復(fù)習(xí)[J]. 常靜,韋祝,梁曉婷.  醫(yī)學(xué)臨床研究. 2016 (04)
[2]Olmsted綜合征1例(附文獻復(fù)習(xí))[J]. 常樹霞,王曉華,顧有守.  皮膚性病診療學(xué)雜志. 2011(05)
[3]母女同患Olmsted綜合征[J]. 陳龍,賀美林,覃莉,孔慶云.  中華皮膚科雜志. 2011 (09)
[4]Olmsted綜合征一例[J]. 王鵬,李君棗,王媚媚.  中華皮膚科雜志. 2009 (08)
[5]Olmsted綜合征與1例文獻復(fù)習(xí)[J]. 陸原,陳達燦,翁翊,李清,禤國維.  中國皮膚性病學(xué)雜志. 2008(07)
[6]Olmsted綜合征1例及文獻復(fù)習(xí)[J]. 黃長征,余念文,吳艷,張晶,楊凌云,陶娟,田進,李延,劉業(yè)強,李家文,王椿森,涂亞庭.  中國麻風(fēng)皮膚病雜志. 2007(09)
[7]Olmsted綜合征1例[J]. 龐曉文,耿麗紅.  臨床皮膚科雜志. 2007(01)
[8]Olmsted綜合征國內(nèi)首報[J]. 馬東來,胡瑾,方凱.  臨床皮膚科雜志. 2006(10)
[9]Olmsted綜合征:報道1例罕見病例[J]. Al-Mutairi N.,Sharma A.K.,Nour-Eldin O.,Al-Adawy E.,劉艷.  世界核心醫(yī)學(xué)期刊文摘(皮膚病學(xué)分冊). 2006(02)
[10]Olmsted綜合征2例[J]. 鐘珊,王兵,楊勇,馮華,陳喜雪.  中國麻風(fēng)皮膚病雜志. 2009 (02)



本文編號:3693520

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