目的采用生物信息學(xué)方法篩選在肝細(xì)胞癌中的異常表達(dá)基因,并分析其在肝癌中的臨床意義及其可能的機(jī)制。方法通過(guò)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)獲取GSE101728基因芯片數(shù)據(jù)集,篩選差異基因;通過(guò)STRING和Cytoscape篩選出核心基因;利用GEPIA驗(yàn)證核心基因在肝癌組織中的表達(dá)及其臨床意義,進(jìn)一步利用DAVID進(jìn)行GO分析及KEGG通路分析;通過(guò)STRING構(gòu)建核心基因的PPI網(wǎng)絡(luò);運(yùn)用GEPIA分析核心基因之間的相關(guān)性。結(jié)果在分析GSE101728數(shù)據(jù)集后共得到1 082個(gè)差異基因,其中354個(gè)基因上調(diào),728個(gè)基因下調(diào)。10個(gè)基因被鑒定為差異基因網(wǎng)絡(luò)中的核心基因,分別為周期素依賴性激酶1（CDK1）、細(xì)胞周期蛋白B1（CCNB1）、細(xì)胞周期蛋白A2（CCNA2）、polo樣激酶1（PLK1）、激光激酶B（AURKB）、細(xì)胞分裂周期蛋白20（CDC20）、著絲粒蛋白A（CENPA）、有絲分裂阻滯缺陷蛋白2（MAD2L1）、細(xì)胞周期蛋白B2（CCNB2）和驅(qū)動(dòng)蛋白家族2C（KIF2C）。GO及KEGG通路分析表明,該10個(gè)核心基因與細(xì)胞分裂和細(xì)胞周期具有密切關(guān)系。AURKB、CCNB1和MAD2L1... 

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【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]中國(guó)肝癌一級(jí)預(yù)防專家共識(shí)（2018）[J]. 陳萬(wàn)青,崔富強(qiáng),樊春筍,李霓,曲春楓,舒為群,王宇婷,殷建華,鄒懷賓.  中國(guó)腫瘤. 2018(09)



本文編號(hào)：3686333